Laboratorium Biologii Molekularnej

Ogólny profil

Celem działalności Laboratorium Biologii Molekularnej, utworzonego przez prof. Monikę Kaczmarek w ramach projektu pt. Wyposażenie i modernizacja zintegrowanych laboratoriów naukowo-badawczych Centrum Doskonałości BIOANIREP, finansowanego z środków Unii Europejskiej, jest rozpowszechnienie technik biologii molekularnej oraz wdrażanie nowych innowacyjnych metod i technik molekularnych do badań realizowanych w ramach Centrum Doskonałości BIOANIREP, sieci naukowych oraz badań własnych Instytutu. Specjalizacja laboratorium w zakresie technik biologii molekularnej, uzupełniona o działalność jednostki bioinformatycznej realizującej zaawansowane analizy bioinformatyczne, wspiera realizację projektów badawczych prowadzonych w Instytucie oraz sprzyja rozwojowi współpracy naukowej o charakterze krajowym i międzynarodowym.

Laboratorium dysponuje infrastrukturą naukowo-badawczą zgromadzaną w postaci stanowisk roboczych do izolacji oraz analizy kwasów nukleinowych i białek.

Więcej informacji o dostępnej infrastrukturze na stronie laboratorium.

Czytaj więcej

Laboratorium Analizy Komórek

Profil jednostki

Laboratorium Analizy Komórek typu core facilities jest zintegrowanym laboratorium w swojej strukturze zawierające trzy pracownie:

  • Pracownia hodowli in vitro i analizy populacji komórkowych;
  • Pracownia obrazowanie i analiz komórek i tkanek;
  • Pracownia histologiczna.

Misją Laboratorium jest wsparcie metodyczne i naukowo-badawcze badań realizowanych w IRZiBŻ PAN, a także działalność usługowa związana z profilem laboratorium. Oferta badań, którą kierujemy do jednostek naukowych, centrów medycznych lub podmiotów gospodarczych, pozwoli na wdrożenie tzw. dobrych praktyk w zakresie współpracy nauki i gospodarki. Szczegóły dotyczące analiz znajdziecie Państwo w Ofercie badawczej Laboratorium Analizy Komórek. Zasady prowadzenia badań w laboratorium znajdują się w zakładce Regulamin.

Laboratorium powstało przy współudziale środków unijnych w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka „BIO-CENTRUM – zwierzę, żywność i człowiek”, Działanie 2.2. Wsparcie Tworzenia Wspólnej Infrastruktury Badawczej Jednostek Naukowych.

Czytaj więcej

Zwierzętarnia dla zwierząt laboratoryjnych

Zwierzętarnia konwencjonalna typu CV zlokalizowana jest w budynku Oddziału Nauk o Żywności przy ul. Tuwima 10. Pierwszy obiekt o powierzchni  120 m2 powstał w 1998 r. dzięki dotacji Fundacji na rzecz Nauki Polskiej. W 2011 r. powiększony do 150 m2 i gruntownie zmodernizowany z dotacji MSWiN spełnia wszystkie wymogi określone dla nowoczesnych placówek tego typu.

Obiekt podzielony jest na:

  • 2 klimatyzowane pomieszczenia do prowadzenia stada matecznego szczurów Wistar,
  • 2 klimatyzowane pomieszczenia do prowadzenia doświadczeń z wykorzystaniem szczurów, wyposażone w 130 klatek do indywidualnego utrzymania zwierząt i 36 klatek metabolicznych,
  • 1 klimatyzowane pomieszczenie do prowadzenia doświadczeń na myszach, wyposażone w 60 klatek do indywidualnego lub grupowego utrzymania zwierząt,
  • 2 indywidualnie klimatyzowane pomieszczenia do doświadczeń na myszach, wyposażone w 210 klatek do indywidualnego lub grupowego utrzymania zwierząt,
  • Pokój zabiegowy,
  • Pokój przygotowania diet,
  • Zmywalnia,
  • Magazyn,
  • Pomieszczenie gospodarcze;

Z infrastruktury zwierzętarni korzystają obecnie:

Wszystkie doświadczenia prowadzone są za zgodą Lokalnej Komisji Etycznej ds. Doświadczeń na Zwierzętach w Olsztynie.

Zwierzętarnia oferuje:

  • możliwość uzyskania szczurów do celów doświadczalnych,
  • opiekę nad zwierzętami w trakcie trwania testów,
  • prowadzenie doświadczeń żywieniowych wg uzgodnionych warunków.

Czytaj więcej

Zwierzętarnia

Zwierzętarnia dla zwierząt laboratoryjnych

Zwierzęta laboratoryjne

Hodujemy dwa gatunki zwierząt laboratoryjnych – myszy i szczury. Nasza wyspecjalizowana kadra zapewnia opiekę w trakcie trwania doświadczeń in vivo.

Czytaj więcej

Zwierzętarnia dla dużych zwierząt

Zwierzęta gospodarskie

Dysponujemy dwoma stadami bydła ras zachowawczych oraz stadem zachowawczym koników polskich. Oferujemy możliwość prowadzenia badań na owcach i świniach. Zapewniamy opiekę i nadzór nad zwierzętami w doświadczeniu.

Czytaj więcej

Czytaj więcej

Oferowane metody i analizy

Laboratorium wykonuje badania zlecone przez Zleceniodawców zewnętrznych. Oferujemy wykonanie analiz mikrobiologicznych żywności oraz pasz metodami uwzględniającymi indywidualne wymagania Zleceniodawców.

Pracownicy Laboratorium służą pomocą w zakresie doboru metod i interpretacji wyników badań.

Czytaj więcej

Wykaz aparatury

  • Biostat C (Biotech International) – bioreaktor do namnażania biomasy bakterii z systemem sterylizacji i stacją mieszania gazów,
  • Tangential Filtration System „ProFlux” (Amicon) – do zagęszczania biomasy bakterii,
  • Liofilizator FD 8-55 (Heto-Holten) – do utrwalania szczepów bakteryjnych,
  • Zestaw do komputerowej analizy obrazu mikroskopowego (Nicon).

Czytaj więcej

Zwierzętarnia dla dużych zwierząt

Zwierzętarnia dla dużych zwierząt działa od 27 marca 2017r. i jest zlokalizowana na terenie Stacji Badawczej IRZiBŻ PAN w Popielnie. W strukturze zwierzętarni znajduje się zakład inżynierii genetycznej (nr w Rejestrze Zespółów Inżynierii Genetycznej 04-32/2017). W strukturze zwierzętarni znajduje się również gabinet weterynaryjny, który powstał w celu sprawowania opieki weterynaryjnej nad zwierzętami będącymi w zasobach Stacji Badawczej.

W celu umożliwienia prowadzenia doświadczeń na dużych zwierzętach, został całkowicie zmodernizowany jeden z budynków gospodarskich.

Obiekt podzielony jest na:

  • pomieszczenie, w którym utrzymywane są owce w systemie kojcowym,
  • pomieszczenie zabiegowe, laboratoryjne i socjalne przynależne do owczarni,
  • pomieszczenie, w którym utrzymywane są świnie w systemie kojcowym,
  • pomieszczenie zabiegowe, laboratoryjne i socjalne przynależne do świniarni.

Poza budynkiem przystosowanym do utrzymywania owiec i trzody chlewnej, jest możliwość prowadzenia badań na stadzie podstawowym koników polskich oraz bydła rasy czerwonej i nizinnej czarno-białej.

Z infrastruktury zwierzętarni korzystały:

  • Zespół Lokalnych regulacji fizjologicznych, projekt: „Ocena biodostępności preparatów hormonalnych”. Badania dotyczą oceny biodostępności preparatu hormonalnego zawartego w krążkach dopochwowych, przeznaczonego docelowo dla kobiet”,
  • Laboratorium Analizy Komórek, projekty: „Wykorzystanie potencjału regeneracyjnego mezenchymalnych komórek macierzystych – EXPLORE ME” oraz zadanie badawcze w ramach projektu „Produkcja transgenicznych świń eGFP”,
  • Zespół Patologii i Medycyny Translacyjnej Rozrodu, projekt: „Wpływ hierarchii i pozycji społecznej na zawartość kortyzolu i testosteronu u ogierów konika polskiego”,
  • Dział Genomiki i Biologii Molekularnej Zwierząt, Instytut Zootechniki – Państwowego Instytutu Badawczego w Balicach, projekt: „Wdrożenie innowacyjnych metod analiz genomu dla ochrony zmienności genetycznej, identyfikacji wariantów genów warunkujących cenne cechy fenotypowe, utworzenia wzorca molekularnego rasy konik polski oraz oceny struktury genetycznej populacji z wykorzystaniem wysokowydajnych technik analiz genomu”,
  • Zespół Zachowania się Zwierząt Instytut Genetyki i Hodowli Zwierząt PAN w Jastrzębcu, projekt: „Wykorzystanie konika polskiego jako modelu do badań nad behawiorem i dobrostanem koni oraz ocena przydatności poszczególnych linii genealogicznych pod kątem ich użytkowości”,
  • Katedra Chorób Wewnętrznych, UP we Wrocławiu, projekt: „Pilotażowe badania fizykochemicznych parametrów skóry u koników polskich”.

Jeżeli prowadzone badania wykraczają poza rutynową działalność weterynaryjno-zootechniczną, użytkownicy muszą uzyskać niezbędne zgody Lokalnej Komisji Etycznej ds. Doświadczeń na Zwierzętach.

Zwierzętarnia oferuje:

  • opiekę nad zwierzętami będącymi w procedurze (utrzymanie zwierząt, sprzątanie pomieszczeń, w których utrzymywane są zwierzęta),
  • możliwość prowadzenia doświadczeń na owcach, konikach i bydle, będących w zasobach Stacji Badawczej,
  • możliwość prowadzenia doświadczeń na zakupionych zwierzętach przez Użytkowników.

Czytaj więcej

Zespół Bioelektroanalityki

Specjalizujemy się w badaniu oddziaływań między biocząsteczkami z zastosowaniem metod elektroanalitycznych, aby opracowywać innowacyjne systemy analityczne, które mogą znaleźć zastosowanie w medycynie, weterynarii, analizie żywności i ochronie środowiska. 

Analizujemy oddziaływania pomiędzy biocząsteczkami takimi jak: białka i kwasy nukleinowe (DNA lub RNA), stosując metody elektrochemiczne.

Badania te pozwalają nam na projektowanie i opracowywanie nowatorskich platform i systemów analitycznych, które mogą być zastosowane do konstrukcji bioczujników elektrochemicznych. Bioczujnik to urządzenie analityczne, służące do wykrywania określonego analitu, które zawiera dwa zintegrowane elementy: biologiczny element rozpoznający (receptor) oraz przetwornik.

Jako element receptorowy stosujemy cząsteczki biologiczne: przeciwciała, jednoniciowe kwasy nukleinowe (ssDNA, ssRNA) oraz aptamery. Ich zadaniem jest nadanie bioczujnikowi selektywności. Interesujemy się szczególnie innowacyjnymi bioczujnikami, w których element przetwornikowy zawiera nanomateriały z węgla lub złota.

Skupiamy się na wykrywaniu biomarkerów różnych chorób, takich jak: choroby nowotworowe, układu krążenia, neurozwyrodnieniowe oraz cukrzyca. Opracowywane przez nas bioczujniki mają duży potencjał komercjalizacyjny.

Kolejnym celem naszych badań jest określenie wpływu wybranych związków obecnych w żywności na patologie procesów życiowych organizmu ludzkiego, takich jak utlenianie lipoprotein lub agregacja białek. Angażujemy się też w badania nad właściwościami inhibitorowymi nowych związków na białka pełniące kluczowe funkcje w organizmie człowieka. Ponadto pracujemy nad systemami ukierunkowanego i kontrolowanego dostarczania związków o znaczeniu terapeutycznym do komórek nowotworowych.

Czytaj więcej

Zespół Immunologii i Mikrobiologii Żywności

W naszych badaniach skupiamy się na zagadnieniach dotyczących wpływu składników diety na układ immunologiczny jelit oraz skład i aktywność mikrobioty jelitowej.

Naszym priorytetem jest poznanie mechanizmów odpowiedzialnych za wzbudzanie tolerancji lub alergii pokarmowej oraz utrzymanie prawidłowej pracy jelit uwzględniając komunikację na szlaku jelito-mózg oraz jelito-wątroba.

Prowadzimy interdyscyplinarne badania łączące mikrobiologię, immunologię, biologię molekularną oraz technologię żywności. Takie wielostronne podejście umożliwia nam poszerzanie wiedzy na temat identyfikacji kluczowych mechanizmów immunologicznych i mikrobiologicznych regulowanych dietą i jej bioaktywnymi składnikami.

Stosując modyfikacje technologiczne (termiczne, chemiczne, fizyczne i enzymatyczne) w odniesieniu do surowców i produktów spożywczych poszukujemy procesów obniżających ich immunogenność, co jest istotnym celem prowadzonych przez nas badań.

W naszej pracy stosujemy modele zwierzęce, tkankowe i komórkowe w systemach in vivo, in vitro i ex vivo. Uzupełniamy je analizami in silico, które pomagają przewidywać aktywność biologiczną badanych substancji, ich potencjał alergenny oraz metabolizm w organizmie. Zajmujemy się również charakterystyką szczepów bakteryjnych stosowanych w produkcji żywności fermentowanej i analizujemy ich wpływ na mikrobiom jelitowy ludzi i zwierząt, zarówno zdrowych, jak i w stanach chorobowych.

Poza aspektem naukowym stawiamy na współpracę z otoczeniem gospodarczym, wspierając rozwój innowacyjnych produktów spożywczych i współpracując z producentami żywności. Jako przykłady możemy wymienić opracowanie produktów spożywczych: o właściwościach immunogennych; korzystnie oddziaływujących na mikrobiotę jelitową i poprawiających funkcjonowanie układu immunologicznego oraz takich, które mogą być stosowane w profilaktyce i poprawiać kondycję organizmu.

Czytaj więcej