Ogłoszenie o rekrutacji: bioinformatyk-analityk danych

Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk (IRZBŻ PAN) w Olsztynie zatrudni bioinformatyka-analityka danych w Laboratorium Biologii Molekularnej.

Instytut:

IRZBŻ PAN w Olsztynie jest jednym z czołowych polskich instytutów badawczych kategorii A/A+, który prowadzi interdyscyplinarne badania w dziedzinie nauk rolniczych i biologicznych, zarówno o charakterze podstawowym, jak i stosowanym (https://pan.olsztyn.pl/granty). Instytut posiada najnowocześniejszą infrastrukturę naukowo-badawczą i ma doskonałe zaplecze administracyjne. IRZBŻ PAN zapewnia pracę w stymulującym środowisku naukowym, kładąc nacisk na wzajemną współpracę oraz przekraczanie granic poszczególnych dyscyplin (https://pan.olsztyn.pl/dzialalnosc-naukowa). Współpraca, wymiana wiedzy między naukowcami z różnych dyscyplin jest powszechna i doceniana.

Bioinformatyk, analityk danych dołączy do zespołu Laboratorium Biologii Molekularnej, który zajmuje się wsparciem badań z zakresu biologii molekularnej zarówno w oddziale Biologii Rozrodu Zwierząt, jak i Oddziale Nauk o Żywności (https://pan.olsztyn.pl/instytut/informacje-ogolne/struktura).

Miasto:

Olsztyn to świetne miejsce pracy, jeśli cenisz sobie bliski kontakt z naturą i spokojne życie. W granicach administracyjnych miasta znajduje się ponad 10 jezior, bardzo dobrze rozwinięta infrastruktura turystyczna i sportowa, a także zaplecze rekreacyjne. W kalendarzu nie brakuje również wydarzeń kulturalnych i sportowych (więcej na: Wikipedia).

Zakres obowiązków:

  • wsparcie bioinformatyczne, analityczne wysokoprzepustowych metod biologii molekularnych;
  • organizacja, utrzymywanie i rozwijanie infrastruktury informatycznej w środowisku Unix;
  • aktywny i konstruktywny udział w projektach badawczych realizowanych w Instytucie;
  • wizualizacja oraz prezentacja wyników analiz bioinformatycznych;
  • przygotowywanie wyników i materiału do publikacji naukowych.

Wymagania:

  • wykształcenie minimum wyższe matematyczne, bioinformatyczne, informatyczne lub biologiczne;
  • znajomość zagadnień bioinformatyki i statystyki;
  • zainteresowanie rozwojem w kierunku bioinformatyka/biologia systemowa/genomika funkcjonalna;
  • dobra znajomość języków skryptowych, tj.: R, Python;
  • dobra znajomość j. angielskiego (minimum poziom B1/B2);
  • dodatkowym atutem będzie doświadczenie w analizie danych sekwencjonowania nowej generacji.

Oczekiwania:

  • zorientowanie na cel;
  • umiejętność pracy indywidualnej i zespołowej;
  • komunikatywność i otwartość;
  • samodzielność w zdobywaniu wiedzy i zdolność do dzielenia się nią;
  • umiejętność rozwiązywania problemów.

Oferujemy:

  • zatrudnienie w oparciu o umowę o pracę;
  • wynagrodzenie uzależnione od doświadczenia i posiadanych umiejętności;
  • możliwość pracy nad ciekawą tematyką badawczą (np. regulacja ekspresji genów, epigenetyka, analiza struktur RNA/DNA, mikroRNA);
  • możliwość pracy w zespołach interdyscyplinarnych;
  • możliwość rozwoju zawodowego i podnoszenia kwalifikacji, w tym staże zagraniczne;
  • stabilne środowisko pracy.

Wymagane dokumenty:

  • CV, list motywacyjny wraz listą dokonań naukowych, zrealizowanych projektów, publikacji.

Jak wygląda proces rekrutacji:

  • wysłanie wymaganych dokumentów, ocena przesłanej dokumentacji, rozmowa kwalifikacyjna z wybranymi kandydatami, decyzja o zatrudnieniu;
  • rozmowy kwalifikacyjne odbędą się w języku polskim i angielskim.

Termin składania aplikacji: do dnia 3 grudnia br. (Instytut zastrzega sobie prawo do wydłużenia terminu składania dokumentów konkursowych w przypadku braku kandydatów spełniających w/w wymagania).

Dokumenty należy przesłać pocztą elektroniczną na adres m.kaczmarek@pan.olsztyn.pl z dopiskiem rekrutacja_bioinformatyk.

W CV prosimy o umieszczenie klauzuli zgody na przetwarzanie danych osobowych w procesie rekrutacji:

„Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych zawartych w dokumentach aplikacyjnych przez Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie z siedzibą 10-748 Olsztyn ul. Tuwima 10, w celu realizacji procesu rekrutacji wraz z publikacją na stronie internetowej Instytutu pełnych wyników konkursu”.

Klauzula informacyjna:

  1. Administratorem danych osobowych przetwarzanych w ramach procesu rekrutacji jest Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie z siedzibą 10-748 Olsztyn ul. Tuwima 10, tel. 89 523 46 86, e-mail: instytut@pan.olsztyn.pl.
  2. Kontakt z inspektorem ochrony danych osobowych jest możliwy pod w/w adresem.
  3. Podane dane osobowe przetwarzane będą w celu realizacji obecnego procesu rekrutacji i przechowywane do czasu jego zakończenia na podstawie wyrażonej zgody (zgodnie z art. 6 ust. 1 lit. a RODO).
  4. Osobie której dane dotyczą przysługuje prawo do cofnięcia zgody w dowolnym momencie bez wpływu na zgodność z prawem przetwarzania, którego dokonano na podstawie zgody przed jej cofnięciem.
  5. Osobie, której dane dotyczą przysługuje prawo dostępu do swoich danych osobowych, żądania ich sprostowania lub usunięcia. Wniesienie żądania usunięcia danych jest równoznaczne z rezygnacją z udziału w procesie niniejszej rekrutacji. Ponadto przysługuje jej prawo do żądania ograniczenia przetwarzania w przypadkach określonych w art. 18 RODO.
  6. Osobie, której dane dotyczą, przysługuje prawo do wniesienia skargi do prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych na niezgodne z prawem przetwarzanie jej danych osobowych. Organ ten będzie właściwy do rozpatrzenia skargi z tym, że prawo wniesienia skargi dotyczy wyłącznie zgodności z prawem przetwarzania danych osobowych, nie dotyczy zaś przebiegu rekrutacji.
  7. Dane udostępnione nie będą podlegały profilowaniu ani udostępnieniu podmiotom czy państwom trzecim. Odbiorcami danych mogą być instytucje upoważnione z mocy prawa.
  8. Podanie danych zawartych w dokumentach rekrutacyjnych nie jest obowiązkowe, jednak jest warunkiem koniecznym do udziału w procesie rekrutacji.

 

Czytaj więcej

The success of our staff at the 3rd International Conference on Tissue Repair, Regeneration, and Fibrosis

Dr. Marta Kopcewicz and Dr. Joanna Wiśniewska from the Regenerative Biology Team were awarded the Aegean Conference Trainee Travel Award at the 3rd International Conference on Tissue Repair, Regeneration, and Fibrosis, held October 10 – 15, 2022, in Greece.

The 3rd International Conference on Tissue Repair, Regeneration, and Fibrosis is one of the most important scientific events bringing together scientists interested in various aspects of repairing and regenerating damaged tissues and organs. Understanding the molecular mechanisms underlying the repair and regeneration of the liver, lungs, skin, kidneys, and bone marrow, among others, is key to the progress of modern medicine.

The winners of this year’s conference were Dr. Marta Kopcewicz and Dr. Joanna Wiśniewska from the Regenerative Biology Team led by Prof. Barbara Gawrońska-Kozak, MD. The Organizing Committee awarded the Trainee Travel Award ($1,000) to the oral presentations of our female scientists’ research results:

Sex, individual age and transcription factor Foxn1 affect the condition of healthy and post injured mice and human skin

Marta Kopcewicz, Sylwia Machcińska-Zielińska, Katarzyna Walendzik, Joanna Wiśniewska, Joanna Rutkowska, Piotr Malinowski, Tomasz Waśniewski, Justyna Drukała, and Barbara Gawrońska-Kozak

Pig adipose-derived stem cells (pASCs) pre-conditioned with hypoxia. Characterization and validation for wound healing therapy

Joanna Wiśniewska, Magda Słyszewska, Marta Kopcewicz, Katarzyna Walendzik, Sylwia Machcińska-Zielińska, Patrycja Dudek, Karolina Stałanowska, and Barbara Gawrońska-Kozak

The research presented at the conference was carried out as part of the following:

    1. research projects funded by the National Science Center:
      • Opus 14 no. 2017/27/b/nz5/02610,
      • Sonata 13 nr 2017/26/D/NZ5/00556;
    2. the KNOW grant of the Scientific Consortium „Healthy Animal – Safe Food,”
      Dec. No.: 05-1/KNOW2/2015;
    3. own research fund 14/FBW/22.

 

Czytaj więcej

AQUAENT – aquaculture in the age of global challenges

AQUAENT – aquaculture in times of global challenges – under such a title, a workshop organized by our scientists within the framework of the EIT Food project AQUAENT- Support for small and medium enterprises in RIS regions in aquaculture, was held in Gdynia on October 12.

Go to AQUAENT website

The workshop topics touched on the most current issues related to the sustainable breeding of aquatic organisms. Konrad Ocalewicz from the University of Gdansk discussed the topic of genetic pollution of the environment and biotechnological methods of protecting gene pools of wild-living fish. Ziemowit Pirtań from the Trout-Tarnowo Fish Farm presented aspects of renewable energy and the possibility of energy storage in aquaculture – futurology or actions necessary for the industry’s survival in the energy crisis.

In turn, Radosław Kowalski of the Department of Gamete and Embryo Biology of the Institute of Animal Reproduction and Food Research Polish Academy of Sciences focused on the issue of multitrophic aquaculture and the related possibility of intensifying production in fresh and salt waters. Tomasz Kolankowski of KOL-tech Solutions discussed the options of inlet water quality monitoring in fish farms, which protects farming from environmental disasters. Other speakers included scientists and experts from Iceland, including from the Matis research institute. Hildur Inga Sveinsdottir touched on using enzymes and proteins in fish waste to create innovative medicinal products and dietary supplements. Saemundur Eliasson, on the other hand, presented the possibilities of using geothermal energy in fisheries and aquaculture.

A discussion with the participants accompanied each presentation.

Thanking the experts and participants for their involvement, we already invite you to the next training, which will be held on November 17 in the online form (in English). We will touch on the topics discussed at the October 12 training. Still, we will also learn about the assumptions of the innovative Salmocross project and its potential for implementation in aquaculture, which Martyna Sas will present from the Tarnowo Trout Fish Farm. Registration link.

Program of the workshop on November 17, 2022

10.00 – 10.10 Welcoming the participants, Marek Bogacki, Institute of Animal Reproduction and Food Research, Polish Academy of Sciences, Olsztyn, Poland

10.10 – 10.50 Renewable energy and the potential of energy storage in aquaculture – futurology or activities necessary for the industry’s survival in times of energy crisis? Ziemowit Pirtań, The fishing farm „PSTRĄG TARNOWO”, Tarnowo, Poland

10.50 – 11.30 Salmocross – an innovative research and implementation project in aquaculture. Martyna Sas The fishing farm „PSTRĄG TARNOWO”, Tarnowo, Poland

11.30 – 12.10 Multitrophic aquaculture – possibilities of intensifying production in fresh and salt waters. Radosław Kowalski, Institute of Animal Reproduction and Food Research, Polish Academy of Sciences, Olsztyn, Poland

12.10 – 12.50 Genetic pollution of the environment and biotechnological methods of protecting gene pools of wild-living fish. Konrad Ocalewicz, University of Gdańsk, Gdańsk, Poland

12.50 – 13.30 The use of enzymes and proteins in fish waste to create innovative medical products and dietary supplements. Margret Geirsdottir, Lysi-Life, Zymtech Enzymatica Aktieägare, Icelandic Food and Biotech R&D, Reykjavík, Iceland

13.30 – 14.10 The use of geothermal energy in fisheries and aquaculture. Saemundur Eliasson, HS Orka and Haustak, Icelandic Food and Biotech R&D, Reykjavík, Iceland

 

Czytaj więcej

Institute with Erasmus Charter for higher education

​The Institute has received the Erasmus Charter for Higher Education – ERASMUS CHARTER FOR HIGHER EDUCATION 2021-2027 (ECHE), and thus the opportunity to participate in international educational mobility and cooperation programs for innovation and exchange of good practices.

The ECHE Charter is a confirmation of the Institute’s compliance with the quality standards required for the organization of student and university staff mobility and the implementation of international educational projects.

ECHE entitles the Institute to apply for funds to implement all international activities under the Erasmus+ program. It defines an institution’s basic principles when organizing and implementing high-quality mobility and cooperation. It specifies the conditions the institution agrees to meet to ensure high-quality services and procedures and provide reliable and transparent information.

By applying for ECHE, the Institute has taken on the obligation to follow the principles referred to in the Erasmus Charter’s contents and implement the developed Erasmus Policy Statement.

 

Czytaj więcej

First Marie Skłodowska-Curie COFUND program fellow at the Institute

Dr. Taina Rocha de Almeida is the first fellow of the Marie Skłodowska-Curie COFUND program at the Institute.

Taina is the winner of the PACIFIC scholarship competition administered by the Polish Academy of Sciences and co-funded by the H2020 Program „Marie Skłodowska-Curie Actions Co-funding of regional, national and international programs” and the Ministry of Education and Science.

Taina came to the Institute from Brazil, and her research supervisor is Dr. Daniel Żarski from the Department of Gamete and Embryo Biology. The fellow’s research aims to determine to what extent non-genetic inheritance factors affect the adaptability of offspring (from embryo to juvenile stages) to breeding conditions. The study will be conducted on three Polish rainbow trout breeding lines.

The prestigious scholarship of the PACIFIC MSCA COFUND program was awarded to 49 candidates from 60 countries worldwide. The competition was fierce – there were about ten candidates per place. To select the winning proposals, evaluators assessed them in three main categories – excellence, impact, and feasibility. Each project also had to pass an ethical evaluation.

The scholarship was awarded for a period of 24 months.

Welcome to the Institute, and congratulations to the scholarship winner and the research supervisor on this prestigious award.

 

Czytaj więcej

Wyniki konkursu na stanowisko stypendysty w projekcie NCN OPUS 19

Dyrektor Instytutu informuje, że konkurs na stanowiska stypendystów w projekcie NCN OPUS 19 pt. „Ultra-czułe narzędzia do wykrywania antybiotyków jako nowa strategia kontroli leczenia i okresu karencji po antybiotykoterapii bydła” został rozstrzygnięty.

Wybrane zostały: Pani Aleksandra ADAMICKA oraz Pani Agnieszka JACKOWSKA.

 

Czytaj więcej

Sukces naszych pracowników na 3rd International Conference on Tissue Repair, Regeneration, and Fibrosis

Dr Marta Kopcewicz oraz dr Joanna Wiśniewska z Zespołu Biologii Regeneracyjnej zostały wyróżnione nagrodą Aegean Conference Trainee Travel Award podczas 3rd International Conference on Tissue Repair, Regeneration, and Fibrosis, która odbyła się 10 – 15 października 2022 r. w Grecji.

The 3rd International Conference on Tissue Repair, Regeneration, and Fibrosis jest jednym z ważniejszych wydarzeń naukowych skupiających naukowców zainteresowanych różnymi aspektami naprawy oraz regeneracji uszkodzonych tkanek oraz narządów. Zrozumienie mechanizmów molekularnych, które leżą u podstaw naprawy i regeneracji m.in. wątroby, płuc, skóry, nerek czy szpiku kostnego jest kluczem do postępu nowoczesnej medycyny.

Wśród laureatów tegorocznej konferencji znalazły się dr Marta Kopcewicz oraz dr Joanna Wiśniewska z Zespołu Biologii Regeneracyjnej kierowanego przez prof. dr hab. n. med. Barbarę Gawrońską – Kozak. Komitet Organizacyjny wyróżnił nagrodami Trainee Travel Award (1000 USD) ustne prezentacje wyników badań naszych naukowczyń:

Sex, individual age and transcription factor Foxn1 affect the condition of healthy and post injured mice and human skin

Marta Kopcewicz, Sylwia Machcińska-Zielińska, Katarzyna Walendzik, Joanna Wiśniewska, Joanna Rutkowska, Piotr Malinowski, Tomasz Waśniewski, Justyna Drukała, and Barbara Gawrońska-Kozak

Pig adipose-derived stem cells (pASCs) pre-conditioned with hypoxia. Characterization and validation for wound healing therapy

Joanna Wiśniewska, Magda Słyszewska, Marta Kopcewicz, Katarzyna Walendzik, Sylwia Machcińska-Zielińska, Patrycja Dudek, Karolina Stałanowska, and Barbara Gawrońska-Kozak

Przedstawione na konferencji badania zostały zrealizowane w ramach: 

    1. projektów badawczych finansowanych ze środków Narodowego Centrum Nauki:
      • Opus 14 no. 2017/27/b/nz5/02610,
      • Sonata 13 nr 2017/26/D/NZ5/00556;
    2. grantu KNOW Konsorcjum Naukowego „Zdrowe Zwierzę – Bezpieczna Żywność”,
      Dec Nr: 05-1/KNOW2/2015;  
    3. funduszu badań własnych 14/FBW/22.

 

Czytaj więcej

Instytut z Kartą Erasmusa dla szkolnictwa wyższego

​Instytut otrzymał Kartę Erasmusa dla szkolnictwa wyższego – ERASMUS CHARTER FOR HIGHER EDUCATION 2021-2027 (ECHE), a tym samym możliwość uczestniczenia w międzynarodowych programach mobilności edukacyjnej i współpracy na rzecz innowacji i wymiany dobrych praktyk.

Przyznawana przez Komisję Europejską Karta ECHE jest potwierdzeniem spełnienia przez Instytutu standardów jakościowych wymaganych przy organizacji mobilności studentów i pracowników uczelni oraz realizacji międzynarodowych projektów edukacyjnych.

ECHE uprawnia Instytut do ubiegania się o fundusze na realizację wszystkich działań międzynarodowych w ramach programu Erasmus+. Określa podstawowe zasady, jakie instytucja powinna spełniać przy organizowaniu i realizacji wysokiej jakości mobilności i współpracy. Wyszczególnia warunki, jakie dana instytucja zgadza się spełnić w celu zapewniania wysokiej jakości usług i procedur, a także dostarczania rzetelnych i przejrzystych informacji.

Wnioskując o ECHE, Instytut przyjął na siebie zobowiązanie do przestrzegania zasad, o których mowa w treści Karty Erasmusa oraz do realizacji opracowanej Deklaracji Polityki Erasmusa.

Erasmus Charter for Higher Education 2021-2027 [PDF]

 

Czytaj więcej