Dr Taisiia Yurchuk z grantem NCN dla Naukowców z Ukrainy

Dr Taisiia Yurchuk z Zespołu Immunologii i Patologii Rozrodu Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie zdobyła finansowanie na realizację projektów badawczych w ramach programu NCN dla Naukowców z Ukrainy.

NCN dla Naukowców z Ukrainy to program specjalny skierowany do badaczek i badaczy z Ukrainy, bez względu na obywatelstwo, którzy schronili się lub schronią w Polsce po agresji Rosji na Ukrainę. Jest realizowany przez Narodowe Centrum Nauki (NCN).

Czym dr Yurchuk będzie zajmować się w Instytucie?

Dr Taisiia Yurchuk będzie brała udział w realizacji projektu NCN OPUS „Badania biologiczne oraz modelowanie matematyczne w celu opisania i przewidywania nowych procesów kontrolujących rozwój, funkcje i atrezję pęcherzyków jajnikowych krowy”.

Dr Yurchuk zajmie się m.in.: przeprowadzaniem izolacji i hodowli komórkowych, a także wykonywaniem analiz przy użyciu technik biologii molekularnej. Dr Yurchuk skupi się na modelowaniu procesu prawidłowej i zaburzonej owulacji u bydła. Uzyskane przez nią wnioski mogą posłużyć do stworzenia podobnych modeli u innych zwierząt i człowieka.

Dlaczego to zrozumienie tych mechanizmów jest takie ważne? Owulacja jest procesem uwalniania oocytu z pęcherzyków jajnikowych. Po owulacji, we wczesnej fazie lutealnej, może dojść́ do zapłodnienia oocytu przez plemnik. Czynniki, które regulują rozwój pęcherzyków jajnikowych, procesy owulacji i ich zaburzenia (np. zjawisko wielokrotnych owulacji u zwierząt z pojedynczą owulacją), jakość oocytów nadal pozostają niewyjaśnione.

W hodowli zwierząt (szczególnie bydła) ciąże bliźniacze są trudne do uzyskania poprzez selekcję ze względu na niską odziedziczalność tej cechy, długi okres międzypokoleniowy i niekorzystną korelację z wydajnością mleczną. Czynnikiem, który może odgrywać rolę w pojawianiu się wyższego odsetka ciąż bliźniaczych jest insulinopodobny czynnik wzrostu (IGF-1). Wykazano, że IGF-I odgrywa istotną rolę w rozrodzie krów, wpływa na płodność, na różnych poziomach regulacyjnych osi podwzgórze – przysadka – jajnik, może warunkować podwójną owulację skutkującą ciążami bliźniaczymi. Brak jest jednak danych opisujących mechanizmy doprowadzające do występowania ciąż bliźniaczych/podwójnych owulacji. Badania przeprowadzone w grancie pomogą to zmienić.

W doświadczeniach zostanie określony wpływ IGF-1 na wzrost i funkcje komórek warstwy ziarnistej pęcherzyków jajnikowych in vitro. Ponadto prześledzone zostaną geny i białka związane z procesem nekroptozy, jednego z rodzajów śmierci komórkowej. Dodatkowo, w celu znalezienia nowych markerów jakości pęcherzyków i wskaźników podwójnej owulacji zbadana będzie ekspresja niekodujących RNA, tzw, miRNA. Uzyskane wyniki zostaną wykorzystane do wyjaśnienia występowania zjawiska podwójnej owulacji i przypadków ciąż bliźniaczych w hodowli bydła. Dodatkowo, doświadczenia in vitro zostaną potwierdzone w warunkach in vivo w celach porównania uzyskanych wyników. Uzyskane wyniki zostaną wykorzystane do stworzenia zaplanowanego modelu matematycznego, dotyczącego wyżej opisanych procesów zachodzących w jajniku, a zwłaszcza procesu podwójnej owulacji.

Długa droga do Olsztyna

Dr Taisiia Yurchuk została jedną z pierwszych beneficjentek programu wsparcia naukowców z Ukrainy i otrzymała 3-miesięczne stypendium Polskiej Akademii Nauk. 14 marca 2022 roku rozpoczęła pracę w Zespole Immunologii i Patologii Rozrodu IRZiBŻ PAN.

Dr Taisiia Yurchuk wraz z grupą naukowców, lekarzy i pacjentek przez ponad tydzień chroniła się w piwnicach kliniki niepłodności i szpitala położniczego w bombardowanym przez rosyjskich agresorów Charkowie. W końcu udało się jej uciec z Charkowa i po ponad tygodniowej podróży przez całą Ukrainę dotarła wreszcie do Olsztyna.

Dr Yurchuk pracowała dotychczas w Instytucie Problemów Kriobiologii i Kriomedycyny w Charkowie. Jej specjalnością naukową jest biologia gamet, embriologia oraz biologia komórki i systemy 3D hodowli komórkowych.

Dr Yurchuk utrzymuje kontakty z Instytutem od kilku lat. Wygłaszała referaty na organizowanych przez Instytut konferencjach naukowych: m.in. Biodiversity, a ostatnio wygłosiła wykład podczas konferencji Development of Scientific Cooperation in Reproductive Medicine Research VIII, organizowanej przez Zespół Biologii i Patologii Rozrodu Człowieka w październiku 2021 we Wrocławiu. Dr Yurchuk brała udział w V edycji Sympozjum „Perspektywy w ochronie bioróżnorodności” organizowanym przez Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN. Rozrodu.

 

Czytaj więcej

New grants from NCN

Researchers from the Institute of PAS in Olsztyn received funding for the implementation of research projects under the competition PRELUDIUM BIS 3 announced by the National Centre for Science (NCN). (więcej…)

Czytaj więcej

Nowe granty NCN

ncn logo

Naukowcy z Instytutu PAN w Olsztynie zdobyli finansowanie na realizację projektów badawczych w ramach konkursów PRELUDIUM BIS 3 ogłoszonego przez Narodowe Centrum Nauki (NCN). (więcej…)

Czytaj więcej

Precision farming is coming to Farming Simulator 22. The new free Precision Farming DLC is now available!

April 19 is a big celebration for all virtual farmers. Precision Farming, the free DLC (downloadable content) to the world-popular Farming Simulator 22, has its premiere today! The DLC development was supported by the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences.

Farming Simulator is a simulation game created by the Swiss company Giants Software. It is one of the most advanced and popular simulators in the world, which allows players to learn all the secrets of farming. Its creators – Stefan Geiger and Christian Ammann – grew up in the countryside, so they know the life of a farmer inside out. One day, they decided to create a game that recreates the life of a farmer, simulating all of its most important aspects – from operating machinery through managing the soil to running the farm.

Precision Farming – What is it?

Precision Farming was first introduced in Farming Simulator 19. The free DLC has been downloaded over a million times worldwide. Precision farming is a solution that allows us to run a farm based on collecting and processing various data obtained, among others, thanks to satellite technologies. These allow us to better control the costs of fertilizers, seeds, and plant protection products.

Until recently, only the biggest growers could use such solutions, today this technology is available to everyone.

Precision Farming was introduced to Farming Simulator by John Deere as part of the „Precision Farming” project funded by EIT Food, Europe’s leading food innovation initiative. It focuses on promoting sustainable agriculture and draws attention to the urgency of reducing the human impact on the environment.

– People who live in large metropolitan areas may not know much about modern agricultural technology or how food gets to grocery stores and their tables. Our project aims to promote knowledge about smart agricultural solutions and sustainable food production practices, especially among people who encounter agriculture only virtually,” says Tomasz Jeliński, chief specialist at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn, a research institute engaged in the creation of the Precision Farming DLC.

Precision Farming 22

In the first edition of the Precision Farming DLC, the basis of gameplay was fertilization and planning of field treatments. The obtained soil parameters facilitated the allocation of appropriate amounts of fertilizers and doses of liming. This equates to savings, crucial both in the game and on a real farm.

– We communicate the product especially towards young farmers to familiarize them with the latest technologies, including precision farming, commonly regarded as an expensive technique – says Tomasz Jeliński.

Two years after the premiere, a new version of Precision Farming is released, which is a free DLC to Farming Simulator 22.

In this edition of the DLC, the player can experience all advantages of precision farming. The DLC allows for variable seeding rates, weed control with spot spraying, and variable fertilizer rates using crop sensors, among other things. If players can’t or don’t want to put time into soil sampling themselves, they can purchase soil maps directly from a service provider. New to Farming Simulator 22 is an environmental score that allows you to optimize the impact of your crops on the external environment.

It’s not just a game!

A huge community has grown up around Farming Simulator 22, exchanging insights in online forums and competing in esports matches.

The Precision Farming DLC for Farming Simulator 22 is free to download on PC, PlayStation, and Xbox consoles starting April 19.

Download DLC

Update 1.4

The Precision Farming project is an international initiative of agricultural experts, food technologists, scientists, innovators, and game designers from John Deere, Giants Software, University of Hohenheim, University of Reading, Grupo AN (Spain’s largest grain cooperative), and the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences.

EIT Food is supported by the European Institute of Innovation and Technology (EIT), a body of the European Union.

 

Czytaj więcej

Rolnictwo precyzyjne wkracza do gry Farming Simulator 22. Nowy bezpłatny dodatek Precision Farming już dostępny!

19 kwietnia to wielkie święto wszystkich wirtualnych rolników. Właśnie dzisiaj swoją premierę ma Precision Farming – Rolnictwo Precyzyjne, bezpłatny dodatek do popularnej na całym świecie gry Farming Simulator 22. W pracach nad nim pomagał Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN.

Farming Simulator to gra symulacyjna stworzona przez szwajcarską firmę Giants Software. Jest to jeden z najbardziej zaawansowanych i popularnych symulatorów na świecie, który pozwala graczom poznać wszystkie sekrety rolnictwa. Jej twórcy – Stefan Geiger i Christian Ammann – dorastali na wsi, więc życie rolnika znają od podszewki. Pewnego dnia postanowili stworzyć grę odtwarzającą życie rolnika, symulując jego wszystkie najważniejsze aspekty – od obsługi maszyn, przez zarządzanie glebą, po prowadzenie gospodarstwa.

Rolnictwo precyzyjne – co to takiego?

Rolnictwo precyzyjne po raz pierwszy pojawiło się w grze Farming Simulator 19. Bezpłatny dodatek pobrano na całym świecie ponad milion razy. Rolnictwo precyzyjne to rozwiązania, które umożliwiają nam prowadzenie gospodarstwa rolnego w oparciu o gromadzenie i przetwarzanie różnych danych pozyskiwanych m.in. dzięki technologiom satelitarnym. Te pozwalają nam lepiej kontrolować koszty nawozów, materiału siewnego oraz środków ochrony roślin.

Do niedawna, z takich rozwiązań mogli korzystać tylko najwięksi plantatorzy, dzisiaj ta technologia jest dostępna dla wszystkich.

Rolnictwo precyzyjne pojawiło się w grze Farming Simulator z inicjatywy firmy John Deere, w ramach projektu „Precision Farming” finansowanego przez EIT Food – wiodącą europejską inicjatywę innowacji w dziedzinie żywności. Skupia się ona na promocji rolnictwa zrównoważonego i zwraca uwagę na potrzebę ograniczenia wpływu działalności człowieka na środowisko.

– Osoby, które mieszkają w dużych aglomeracjach, mogą nie wiedzieć zbyt wiele o nowoczesnej technologii rolniczej lub o tym, jak żywność trafia do sklepów spożywczych i na ich stół. Celem naszego projektu jest promowanie wiedzy na temat nowoczesnej technologii rolniczej i zrównoważonych praktyk produkcji żywności właśnie wśród osób, które z rolnictwem spotykają się tylko wirtualnie – mówi Tomasz Jeliński, główny specjalista Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie, placówki badawczej zaangażowanej w tworzenie dodatku Precision Farming.

Precision Farming 22

W pierwszej edycji dodatku Precision Farming podstawą rozgrywki było nawożenie i planowanie zabiegów na polu, a uzyskane parametry gleby ułatwiały przydzielanie odpowiednich ilości nawozów oraz dawek zapotrzebowania przy wapnowaniu. Jest to równoznaczne z oszczędnościami, kluczowymi nie tylko w grze, ale również w prawdziwym gospodarstwie.

– Produkt kierowaliśmy szczególnie do młodych rolników, których oswajamy z najnowszymi technologiami, w tym z rolnictwem precyzyjnym, powszechnie uważanym za drogą technikę – mówi Tomasz Jeliński.

Dwa lata po premierze, na rynek trafia nowa wersja Precision Farming, która stanowi bezpłatny dodatek do gry Farming Simulator 22.

W tej edycji dodatku, gracz może poznać wszystkie zalety rolnictwa precyzyjnego. Dodatek umożliwia m.in. zmienne dawkowanie wysiewu, zwalczanie chwastów za pomocą punktowych oprysków czy zmienne dawki nawożenia z wykorzystaniem czujników upraw. Jeżeli gracz nie może lub nie chce poświęcić czasu na samodzielne pobieranie próbek gleby, może nabyć mapy glebowe bezpośrednio od usługodawcy. Nowością w Farming Simulator 22 jest wynik środowiskowy, który umożliwia optymalizację wpływu upraw na środowisko zewnętrzne.

To nie tylko gra!

Wokół gry Farming Simulator 22 powstała ogromna społeczność, wymieniająca się spostrzeżeniami na forach internetowych, a także rywalizująca podczas rozgrywek e-sportowych.

Dodatek Precision Farming do gry Farming Simulator 22 jest bezpłatny i od 19 kwietnia można go pobrać na PC, konsole PlayStation oraz Xbox.

Uaktualnienie Farming Simulator 1.4

Dodatek Precision Farming

Projekt Precision Farming to międzynarodowa inicjatywa ekspertów ds. rolnictwa, technologów, naukowców, innowatorów i projektantów gier komputerowych z firm John Deere, Giants Software, Uniwersytetu w Hohenheim, Uniwersytetu w Reading, Grupo AN (największej spółdzielni zbożowej w Hiszpanii) oraz Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk.

EIT Food jest wspierany przez Europejski Instytut Innowacji i Technologii (EIT), który jest organem Unii Europejskiej.

 

Czytaj więcej

Interview with Prof. Carsten Carlberg, ERA Chair WELCOME2

„If you love the car you bought, you can drive it your whole life. Treat your body the same way” – interview with Prof. Carsten Carlberg.

Prof. Carsten Carlberg, winner of the prestigious European ERA Chair WELCOME2 grant to create a Center of Excellence in nutrigenomics at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences, talks to a journalist Marcin Powęska. He reveals why vitamin D supplementation is so important for our body and how the technology of digital twins may excel the research on the prevention and treatment of diet-related diseases.

Vitamin D is a group of fat-soluble steroidal organic chemical compounds that exert broad physiological effects. Vitamin D is important for our immunity, healthy bones, cardiovascular system, and cancer prevention and supports many important physiological functions of the body. However, not everyone follows the official recommendations for vitamin D supplementation, especially during winter periods. Moreover, Prof. Carlberg’s previous research has shown that everyone responds to supplementation with vitamin D at different levels, thus determining the optimal dose is crucial to our health. This is why understanding the mechanisms responsible for the distribution of vitamin D in our bodies is so important.

Prof. Carlberg is a world-renowned biochemist who has been working on vitamin D for over 30 years. Within the prestigious European ERA Chair WELCOME2 grant, he will establish the Center of Excellence in nutrigenomics at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences. Prof. Carlberg and his new interdisciplinary team will conduct research on the influence of nutrition on (epi)genetic predispositions to so-called diet-related diseases.

Marcin Powęska: I won’t ask why you chose Olsztyn as a place to continue your scientific career…

Prof. Carsten Carlberg: Maybe it’s better to ask why did Olsztyn choose me?

MP: And why did Olsztyn choose you? What scientific achievement has led you to the institute in Olsztyn?

CC: I have been working on vitamin D for 32 years, so there is no one scientific achievement that I would single out. Everything that has happened in my scientific career is a sequence of certain events and discoveries related to vitamin D. After so many years of focusing on a single molecule, I feel privileged to be asked by many respected European scientists about their research. All of this has led me to where we are now talking.

MP: And your biggest scientific surprise? After all, 30 years is a long time in the world of science…

CC: I wouldn’t call it a surprise, but 20 years ago the human genome was sequenced and everything has changed since then. Literally: everything. I began to divide science into two periods: before the genome was sequenced and after the genome was sequenced. This event completely changed our perception of the world, and it also changed my perception of the world. I started my scientific career in the days before the sequencing of the human genome, and back then our knowledge of genes was very residual. It was a bit like driving a car over unfamiliar terrain, in the dark. Scientists had an idea about many things, but it was more based on prediction, not certainty. Suddenly someone turned on the light and we saw the road. That made a huge difference.

MP: Another important step was a genetic modification, such as the CRISPR technique (so-called genetic scissors, a method of genetic engineering that allows manipulation of the genome of microorganisms, animals, and plants – note a.)?

CC: CRISPR is a very important technique – like PCR – but just a technique. A tool. Without knowing the human genome, its development would not be possible. It’s a bit like someone riding a bicycle all their life, but one day they get a motorcycle. Both will get you from point A to point B, but a motorcycle will get you there faster. CRISPR was not like reinventing the wheel in genetics, and I consider genome sequencing to be just such an event.

MP: So what should be the next major step of genetics? What’s next?

CC: The next major step in genetics will be to understand our epigenome. For that, however, you need the right tools. It is not enough to take one measurement and draw conclusions based on that. Because, although the genome is identical in all of our cells, the epigenome is different in different tissues, and even in cells that make up the same tissue but at a different age. The epigenome is dynamic, so we can measure it all the time and conclude our bodies based on the results. It’s like fitness bands that measure our steps – they show raw data about whether we move more than we did a year ago, but they don’t conclude us. We have to take care of those ourselves. It’s the same with epigenetic data – samples need to be taken regularly and analyzed, and only then can we determine what to do next. We need to observe the patient for a long time and monitor their health, not measure it at a single moment.

MP: One of your projects carried out in Olsztyn is the project of digital twins. What is it based on?

CC: A hundred years ago people were making prototypes of airplanes, but they were acting a bit blindly. Some of them flew, others fell right after the take-off. Through trial and error, they finally figured out what the plane should look like, and that is how it is today. Today such actions are unthinkable. Now engineers digitally create every part of an airplane before they manufacture it. The digital twin is meant to serve the same function – a virtual model for testing diet and drugs.

MP: This, in turn, is the first step towards personalized medicine. If each of us had a digital twin, would we live longer?

CC: I think we would then live longer in health. There’s a big difference between a healthspan and a lifespan. Lifespan is simple to define – from birth to death. Lifespan is increasing globally, especially in developed countries. We are making steady progress on this issue. But when it comes to healthspan – things are much worse. In an ideal world, everyone would be healthy for almost their entire lifespan. The reality, however, is brutal. Statistics show that after the age of 50 the risk of various diseases increases, people start taking medications, and stop being physically active. They begin to suffer, thus not prolonging their period of health. We aim to change the status quo and keep people healthy for as long as possible.

MP: Can your research in Olsztyn bring humanity closer to this goal?

CC: Yes. In terms of extending the time we can enjoy health, it is about responsibility. You can compare our bodies to a car. You buy a car and you get a 5-6 year warranty, which means you can treat it however you want for that time, but probably after the 7th or 8th year of use certain parts will start to fail badly. But if you take a proper care of the car and handle it properly, it can serve you much longer. Evolution created our bodies to last at least 45 years: 20-25 years are needed to give birth to offspring and another 20 to raise them. Therefore, it can be said that each of us gets a body for at least 45 years – what happens after that, we decide for ourselves. We can live to be 120 years old, but not many people make it. If you love the car you bought, you can drive it all your life. Treat your body the same way.

MP: This approach would be useful for everyone in these uncertain, pandemic times we live in. Do you think a better understanding of the role of vitamin D in our bodies will allow us to better fight COVID-19?

CC: Our immune system can be trained by vitamin D in many different ways. So if we provide our body with adequate levels of vitamin D, we will provide our body with a strong immune system that is effective against a variety of pathogens, including SARS-CoV-2. Vitamin D will not protect us from getting COVID-19, it is not a shield of any kind, but it can protect us from a severe form of the disease with a well-trained immune system. The same goes with vaccines. Autoimmune diseases, on the other hand, are the complete opposite of infections. Our body reacts in the wrong way to some agent and attacks itself. Vitamin D helps to mute this process.

MP: How much vitamin D should we take to maintain this balance?

CC: Each of us has different needs and different predispositions. Vitamin D supplementation for everyone should look a little different. With specialized testing, we can find out what dose is right for us. If we don’t want to do this, I recommend taking a low dose of vitamin D, which according to my research is five times more than the pharmacists suggest anyway. We will not harm ourselves and we will meet our body’s need for this compound.

MP: What else will you be doing in Olsztyn?

CC: I will mainly deal with the analysis of gene regulation on the scale of the whole human genome, bearing in mind changes in its epigenome and transcriptome. I am also interested in a close cooperation and integration of research conducted in the two divisions of the Institute: Reproductive Biology and Food Sciences, which will allow us to extend the investigations also to the changes at level of metabolome and proteome. A key element of the activities will be the already mentioned project of digital twins, i.e. models of healthy and sick individuals, which will be tested for the selection of diet, physical activity, and medication. All this will be done within the Center of Excellence in nutrigenomics, established at the Institute.

 

Czytaj więcej

Wywiad z prof. Carstenem Carlbergiem, ERA Chair WELCOME2

„Jeżeli naprawdę kochasz samochód, który kupiłeś, możesz jeździć nim całe życie. Traktuj swój organizm w ten sam sposób” – wywiad z prof. Carstenem Carlbergiem.

Prof. Carsten Carlberg, laureat prestiżowego grantu European ERA Chair WELCOME2, który stworzy w Instytucie Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN Centrum Doskonałości w nutrigenomice, rozmawia z dziennikarzem Marcinem Powęską. Zdradza, dlaczego suplementacja witaminy D jest tak ważna dla naszego organizmu oraz jak technologia cyfrowych bliźniaków może zrewolucjonizować badania dotyczące profilaktyki i terapii chorób dietozależnych.

Mianem witaminy D określamy grupę rozpuszczalnych w tłuszczach steroidowych organicznych związków chemicznych, które wywierają szerokie działanie fizjologiczne. Witamina D jest ważna dla naszej odporności, zdrowych kości, układu sercowo-naczyniowego, zapobiegania nowotworom oraz wspomagania wielu ważnych funkcji fizjologicznych organizmu. Nie wszyscy jednak przestrzegają oficjalnych zaleceń dotyczących suplementacji witaminy D, zwłaszcza w okresach zimowych. Co więcej, wcześniejsze badania prof. Carlberga wykazały, że każdy reaguje na suplementację witaminy D w inny sposób, zatem ustalenie optymalnej dawki jest kluczowe dla naszego zdrowia. Dlatego właśnie zrozumienie mechanizmów odpowiedzialnych za dystrybucję witaminy D w naszym organizmie jest tak ważne.

Prof. Carlberg to światowej sławy biochemik, który witaminą D zajmuje się od ponad 30 lat. W ramach prestiżowego europejskiego grantu ERA Chair WELCOME2 stworzy w Instytucie Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN Centrum Doskonałości w nutrigenomice. Będą tam prowadzone badania nad wpływem odżywiania na (epi)genetyczne predyspozycje do tzw. chorób dietozależnych.

Marcin Powęska: Nie będę pytał o to, dlaczego wybrał Pan Olsztyn jako miejsce na kontynuowanie swojej kariery naukowej…

Prof. Carsten Carlberg: Może lepiej zapytać, dlaczego Olsztyn wybrał mnie?

MP: A dlaczego Olsztyn wybrał Pana? Jakie osiągnięcie naukowe doprowadziło Pana do instytutu w Olsztynie?

CC: Zajmuję się witaminą D od 32 lat, dlatego nie ma jednego osiągnięcia naukowego, które bym wyróżnił. Wszystko, co działo się w mojej karierze naukowej to sekwencja pewnych zdarzeń i odkryć związanych z witaminą D. Po tylu latach skupiania się nad jedną cząsteczką, czuję się zaszczycony, że wielu cenionych europejskich naukowców pyta mnie o zdanie na temat swoich badań. To wszystko doprowadziło mnie do miejsca, w którym teraz rozmawiamy.

MP: A Pana największe naukowe zaskoczenie? 30 lat to w końcu kawał czasu w świecie nauki…

CC: Nie nazwałbym tego zaskoczeniem, ale 20 lat temu został zsekwencjonowany ludzki genom i od tego czasu zmieniło się wszystko. Dosłownie: wszystko. Zacząłem dzielić naukę na dwa okresy: przed zsekwencjonowaniem genomu i po zsekwencjonowaniu genomu. To wydarzenie całkowicie zmieniło nasze postrzeganie świata, zmieniło także moje postrzeganie świata. Zaczynałem karierę naukową w czasach przed zsekwencjonowaniem ludzkiego genomu, a wtedy nasza wiedza o genach była bardzo szczątkowa. To było trochę jak jazda samochodem po nieznanym terenie, po ciemku. Naukowcy o wielu rzeczach mieli pojęcie, ale było to bardziej na zasadzie przewidywania, a nie pewności. Nagle ktoś zapalił światło i zobaczyliśmy drogę. To zrobiło ogromną różnicę.

MP: Kolejnym ważnym etapem były modyfikacje genetyczne, jak technika CRISPR (tzw. genetyczne nożyczki, metoda inżynierii genetycznej, pozwalająca na manipulacje genomem mikroorganizmów, zwierząt i roślin – przyp. a.)?

CC: CRISPR to bardzo ważna technika – jak PCR – ale tylko technika. Narzędzie. Bez poznania ludzkiego genomu, jej opracowanie nie byłoby możliwe. To trochę tak, jakby ktoś całe życie jeździł rowerem, ale pewnego dnia dostał motocykl. Jednym i drugim dostaniesz się z punktu A do punktu B, ale motocyklem szybciej. CRISPR nie było jak wymyślenie koła w genetyce, a zsekwencjonowanie genomu właśnie za takie zdarzenie uważam.

MP: Jaki zatem powinien być kolejny ważny krok genetyki? Co dalej?

CC: Kolejnym ważnym etapem genetyki będzie zrozumienie naszego epigenomu. Do tego jednak potrzebne są odpowiednie narzędzia. Nie wystarczy zrobić jeden pomiar i na tej podstawie wyciągnąć wnioski. Bo, mimo że genom jest identyczny we wszystkich naszych komórkach, to epigenom jest inny w różnych tkankach, a nawet w komórkach tworzących tę samą tkankę, ale w innym wieku. Epigenom jest dynamiczny, więc można mierzyć go cały czas i na podstawie zebranych wyników wyciągać wnioski na temat naszego organizmu. To tak, jak z opaskami fitness, które mierzą nasze kroki – pokazują surowe dane na temat tego, czy ruszamy się więcej niż rok temu, ale nie wyciągną za nas wniosków. O te musimy zadbać sami. Tak samo jest z danymi epigenetycznymi – próbki trzeba pobierać regularnie i analizować, a dopiero na tej podstawie możemy stwierdzić, co dalej. Potrzebne jest długotrwałe obserwowanie pacjenta i monitorowanie jego stanu zdrowia, nie pomiar w jednym momencie.

MP: Jednym z Pana projektów realizowanych w Olsztynie ma być projekt cyfrowych bliźniaków. Na czym on polega?

CC: Sto lat temu ludzie tworzyli prototypy samolotów, ale działali trochę na oślep. Niektóre z nich latały, inne spadały zaraz po starcie. Metodą prób i błędów w końcu wymyślili, jak powinien wyglądać samolot i tak jest do dzisiaj. Obecnie takie działania są nie do pomyślenia. Teraz inżynierowie tworzą cyfrowo każdy element samolotu, zanim go wyprodukują. Cyfrowy bliźniak ma pełnić taką samą funkcję – wirtualnego modelu do testowania diet i leków.

MP: To z kolei pierwszy krok do medycyny spersonalizowanej. Czy jeżeli każdy z nas miałby cyfrowego bliźniaka, żylibyśmy dłużej?

CC: Myślę, że wtedy żylibyśmy dłużej w zdrowiu. Jest duża różnica między zdrowym życiem a długim życiem. Długość życia jest prosta do określenia – od momentu narodzin do śmierci. Długość życia globalnie się wydłuża, zwłaszcza w krajach rozwiniętych. W tej kwestii dokonujemy ciągłych postępów. Ale jeżeli chodzi o jakość życia – tu jest znacznie gorzej. W idealnym świecie każdy przez niemal całą długość swojego życia byłby zdrowy. Rzeczywistość jest jednak brutalna. Statystyka wskazuje, że po 50. roku życia rośnie ryzyko różnych chorób, ludzie zaczynają przyjmować leki, przestają być aktywni fizycznie. Zaczynają cierpieć, nie wydłużają tym samym swojego okresu zdrowia. Naszym celem jest zmiana stanu rzeczy i zapewnienie zdrowia ludziom tak długo, jak to tylko możliwe.

MP: Czy Pana badania w Olsztynie mogą przybliżyć ludzkość do tego celu?

CC: Tak. W kontekście wydłużenia okresu, w którym możemy cieszyć się zdrowiem, chodzi o odpowiedzialność. Można porównać nasze ciało do samochodu. Kupujesz samochód i dostajesz gwarancję na 5-6 lat, co oznacza, że możesz traktować go jak chcesz przez ten czas, ale prawdopodobnie po 7. czy 8. roku użytkowania pewne części zaczną mocno szwankować. Ale jeżeli będziesz odpowiednio dbał o samochód i właściwie się z nim obchodził, może posłużyć ci znacznie dłużej. Ewolucja stworzyła nasze ciała, by przetrwały co najmniej 45 lat: 20-25 lat potrzebne do wydania na świat potomstwa i kolejne 20 niezbędne do jego wychowania. Można zatem powiedzieć, że każdy z nas dostaje ciało na minimum 45 lat – o tym, co dzieje się później, decydujemy już sami. Możemy dożyć i 120 lat, ale przecież niewielu to się udaje. Jeżeli naprawdę kochasz samochód, który kupiłeś, możesz jeździć nim całe życie. Traktuj swoje ciało w ten sam sposób.

MP: Takie podejście przydałoby się wszystkim w tych niepewnych, pandemicznych czasach, w których żyjemy. Czy uważa Pan, że lepsze zrozumienie roli witaminy D w naszym organizmie, pozwoli nam lepiej walczyć z COVID-19?

CC: Nasz układ odpornościowy może być wytrenowany przez witaminę D na wiele różnych sposobów. Jeżeli zatem zapewnimy naszemu organizmowi odpowiedni poziom witaminy D, zapewnimy mu silny układ odpornościowy skuteczny do zwalczania różnych patogenów, także SARS-CoV-2. Witamina D nie ochroni nas przed zachorowaniem na COVID-19, nie jest żadną tarczą, ale może ochronić nas przed ciężką postacią choroby, dzięki dobrze wykształconemu układowi odpornościowemu. Podobnie jest ze szczepionkami. Z kolei choroby autoimmunologiczne to całkowite przeciwieństwo infekcji. Nasz organizm reaguje w niewłaściwy sposób na jakiś czynnik i sam siebie atakuje. Witamina D pomaga wyciszyć ten proces.

MP: Ile witaminy D powinniśmy zażywać, aby tę równowagę zachować?

CC: Każdy z nas ma inne potrzeby, inne predyspozycje. Suplementacja witaminy D u każdego powinna wyglądać nieco inaczej. Dzięki specjalistycznym badaniom, możemy dowiedzieć się, jaka dawka jest odpowiednia dla nas. Jeżeli nie chcemy tego robić, rekomenduję przyjmowanie niskiej dawki witaminy D, która według moich badań i tak wynosi pięć razy więcej niż sugestie farmaceutów. Nie zaszkodzimy sobie tym, a zaspokoimy zapotrzebowanie naszego organizmu na ten związek.

MP: Czym jeszcze będzie się Pan zajmował w Olsztynie?

CC: Będę zajmował się głównie analizą regulacji genów w skali całego genomu człowieka, mając na uwadze zmiany w jego epigenomie i transkryptomie. Zależy mi też na ścisłej współpracy i integracji badań prowadzonych w dwóch oddziałach Instytutu: Biologii Rozrodu i Nauk o Żywności, która pozwoli nam poszerzyć te badania również o aspekty zmian na poziomie metablomicznym i proteomicznym.  Kluczowym elementem działań będzie wspomniany już projekt cyfrowych bliźniaków, czyli modeli zdrowych i chorych osób, które będą testowane pod kątem doboru diety, aktywności fizycznej i leków. Wszystko to w ramach utworzonego w instytucie Centrum Doskonałości w obszarze nutrigenomiki.

 

Czytaj więcej

Call for a position of a Post-doctoral Researcher in an NCN project SONATA 15

Name of the Institute:

Institute of Animal Reproduction and Food Research Polish Academy of Sciences

Name of the position:

Post-doctoral Researcher in an NCN project SONATA 15 entitled „The interaction of T helper cell subsets with endometrial fibroblasts in processes associated to development of mare endometrosis”.

Description of the position:

The candidate will participate in the following research tasks:

  1. Investigation of changes in percentages of endometrial subsets of Th 17 cells in the course of endometrosis.
  2. Investigation of the role of Th 17 cell subsets in processes associated to the development of mare endometrosis
  3. Determination of the effect of IL-17 on ECM remodeling and fibrogenesis in mare endometrial fibroblast.

Conditions of work:

  • The elected candidate will receive a monthly salary of around 5000 zł per month (netto),
  • Location of the workplace: Zespół Patologii i Medycyny Translacyjnej Rozrodu – IRZiBŻ ul. Bydgoska 7, 10-243 Olsztyn,
  • Date of beginning of the employment: 01.07.2022,
  • Length of work contract: 11 months.

Qualifications:

  1. Ph.D. in biotechnology, biology, veterinary or related discipline (obtained not earlier than 7 years before the date of the announcement, a degree should be obtained outside the Institution where the project will be carried out);
  2. Knowledge in the field of molecular biology, reproduction and immunology;
  3. Experience with the following techniques: ELISA, Western blot, qPCR, and immunofluorescence staining of proteins in the cell;
  4. Experience with primary cell isolation and culture;
  5. At least one international internship (minimum 3 months in length);
  6. First authorship of at least 5 scientific papers;
  7. Ability to communicate easily in English;
  8. Ability to work in a group.

Interested candidates are asked to provide the following documents:

  1. Motivation letter;
  2. CV including a list of publications, conference presentations, and other awards;
  3. Ph.D. diploma or certificate of participation in studies at the moment;
  4. Recommendation letter from a scientific mentor, confirming skills necessary for completing the project;
  5. Documents confirming proficiency in foreign languages;
  6. Other documents, that in the opinion of the candidate are important when considering him/her for the position.

Applications should be sent to:

Dr. Anna Szóstek-Mioduchowska
a.szostek-mioduchowska@pan.olsztyn.pl
Deadline: 13.05.2022 until 3:00 p.m
The subject of the message should be „Call for Post-doc Researcher/SONATA”.

In your CV, please include a consent clause for the processing of personal data in the recruitment process:

„I consent to the processing of my personal data contained in the application documents by the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn, 10-748 Olsztyn, ul. Tuwima 10, in order to carry out the recruitment process and publishing the full results of the competition on the Institute’s website”.

Information clause:

  1. The administrator of personal data processed as part of the recruitment process is the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn, 10-748 Olsztyn, ul. Tuwima 10, phone no. 89 523 46 86, e-mail: instytut@pan.olsztyn.pl.
  2. Contact with the personal data protection officer is possible at the above-mentioned address.
  3. The provided personal data will be processed in order to carry out the current recruitment process and kept until its completion on the basis of expressed consent (in accordance with Article 6 (1) (a) of the GDPR).
  4. You have the right to withdraw consent at any time without affecting the lawfulness of the processing which was carried out on the basis of consent before its withdrawal.
  5. You have the right to access your personal data, request their rectification or removal. Submitting a request to delete data is tantamount to resignation from participation in the recruitment process. In addition, you have the right to request the restriction of processing in the cases specified in art. 18 GDPR.
  6. You have the right to lodge a complaint with the President of the Personal Data Protection Office against the unlawful processing of his personal data. This authority will be competent to consider the complaint, provided that the right to file a complaint concerns only the lawfulness of the processing of personal data, and not the recruitment process.
  7. Your data will not be profiled or made available to entities or third countries. The recipients of the data may be institutions authorized by law.
  8. Providing your personal data is not obligatory, but it is a necessary condition to participate in the recruitment process. 

Czytaj więcej

Konkurs na stanowisko Post-doc w projekcie NCN SONATA 15

Nazwa jednostki:

Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk w Olsztynie

Nazwa stanowiska:

Post-doc w projekcie NCN SONATA 15 pt. „The interaction of T helper cell subsets with endometrial fibroblasts in processes associated to development of mare endometrosis”.

Opis zadań:

Kandydat będzie uczestniczył w realizacji następujących zadaniach badawczych:

  1. Określenie zmian w populacji limfocytów pomocniczych Th17 w endometrium w przebiegu endometrosis;
  2. Określenie roli limfocytów pomocniczych Th17 w procesach związanych z rozwojem endometrosis;
  3. Badanie wpływu IL-17 na fibroblasty podczas przebudowy tkanki i fibrogenezy.

Warunki zatrudnienia:

  • wynagrodzenie w wysokości 5000 zł netto miesięcznie,
  • miejsce pracy: Zespół Patologii i Medycyny Translacyjnej Rozrodu IRZiBŻ, ul. Bydgoska 7, 10-243 Olsztyn,
  • data rozpoczęcia: 01.07.2022,
  • czas trwania umowy: 11 miesięcy.

Kwalifikacje:

  1. Stopień naukowy doktora: biotechnologii, biologii, weterynarii lub pokrewny (uzyskany nie wcześniej niż 7 lat przed ogłoszeniem konkursu na stanowisko post-doc nadany przez inny podmiot niż podmiot, który jest miejscem realizacji projektu);
  2. Wiedza z zakresu biologii molekularnej, rozrodu i immunologii;
  3. Doświadczenie w posługiwaniu się następującymi technikami: ELISA, Western blot, qPCR oraz barwienia immunofluorescencyjne;
  4. Doświadczenie w izolacji i hodowli komórek pierwotnych;
  5. Przynajmniej 1 zagraniczny staż naukowy (min. 3 miesiące);
  6. Pierwszy autor przynajmniej 5 publikacji naukowych;
  7. Znajomość języka angielskiego na poziomie umożliwiającym swobodną komunikację;
  8. Umiejętność pracy w zespole.

Osoby zainteresowane proszone są o przesłanie następujących dokumentów:

  1. List motywacyjny;
  2. Życiorys naukowy z wykazem publikacji, konferencji oraz innych osiągnięć;
  3. Kopia dyplomu uzyskania stopnia doktora lub zaświadczenie realizacji studiów doktoranckich;
  4. Opinia opiekuna naukowego poświadczająca posiadanie umiejętności, niezbędnych przy realizacji projektu;
  5. Dokumenty potwierdzające znajomość języków obcych;
  6. Inne dokumenty, które wg Kandydata są istotne przy rozpatrzeniu jego Kandydatury;

Zgłoszenie zawierające komplet dokumentów powinno zostać wysłane do dnia 13.05.2022 do godziny 15:00 pocztą elektroniczną na adres: a.szostek-mioduchowska@pan.olsztyn.pl. W temacie wiadomości należy podać następujący tytuł „Konkurs na post-doc researcher/SONATA”.

W CV prosimy o umieszczenie klauzuli zgody na przetwarzanie danych osobowych w procesie rekrutacji:

„Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych zawartych w dokumentach aplikacyjnych przez Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie z siedzibą 10-748 Olsztyn ul. Tuwima 10, w celu realizacji procesu rekrutacji wraz z publikacją na stronie internetowej Instytutu pełnych wyników konkursu”.

Klauzula informacyjna:

  1. Administratorem danych osobowych przetwarzanych w ramach procesu rekrutacji jest Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie z siedzibą 10-748 Olsztyn ul. Tuwima 10, tel. 89 523 46 86, e-mail: instytut@pan.olsztyn.pl.
  2. Kontakt z inspektorem ochrony danych osobowych jest możliwy pod w/w adresem.
  3. Podane dane osobowe przetwarzane będą w celu realizacji obecnego procesu rekrutacji i przechowywane do czasu jego zakończenia na podstawie wyrażonej zgody (zgodnie z art. 6 ust. 1 lit. a RODO).
  4. Osobie której dane dotyczą przysługuje prawo do cofnięcia zgody w dowolnym momencie bez wpływu na zgodność z prawem przetwarzania, którego dokonano na podstawie zgody przed jej cofnięciem.
  5. Osobie, której dane dotyczą przysługuje prawo dostępu do swoich danych osobowych, żądania ich sprostowania lub usunięcia. Wniesienie żądania usunięcia danych jest równoznaczne z rezygnacją z udziału w procesie niniejszej rekrutacji. Ponadto przysługuje jej prawo do żądania ograniczenia przetwarzania w przypadkach określonych w art. 18 RODO.
  6. Osobie, której dane dotyczą, przysługuje prawo do wniesienia skargi do prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych na niezgodne z prawem przetwarzanie jej danych osobowych. Organ ten będzie właściwy do rozpatrzenia skargi z tym, że prawo wniesienia skargi dotyczy wyłącznie zgodności z prawem przetwarzania danych osobowych, nie dotyczy zaś przebiegu rekrutacji.
  7. Dane udostępnione nie będą podlegały profilowaniu ani udostępnieniu podmiotom czy państwom trzecim. Odbiorcami danych mogą być instytucje upoważnione z mocy prawa.
  8. Podanie danych zawartych w dokumentach rekrutacyjnych nie jest obowiązkowe, jednak jest warunkiem koniecznym do udziału w procesie rekrutacji.

 

Czytaj więcej