Call for a position of LAB MANAGER in project SONATA BIS

Name of the Institute:

Institute of Animal Reproduction and Food Research of Polish Academy of Sciences

Name of the position:

LAB MANAGER in an NCN project SONATA BIS „Exploring mechanisms of congenital HCMV infection: replication, spread and latency establishment”

Project description:

Infection with human cytomegalovirus (HCMV) is a cause of congenital disease. As is the case for all the herpesviruses the life cycle of HCMV can be divided into lytic phase, when the virus is replicating, and the latent phase, in which virus persists in the cell. Part of the project focuses on molecular aspects of HCMV latency and its goal is to determine, if IE1x4 is the main protein of the latent phase responsible for persistence of the virus.

Thus far HCMV latency was mainly studied in hematopoietic progenitor cells, but recently it was shown that the virus can establish latency also in neuronal progenitors, discovery which is important in relation to HCMV-associated congenital disease. Therefore we would like to compare latent viral transcripts expressed in hematopoietic and neuronal progenitors. We also plan to study conditions and stage of differentiation at which neuronal progenitors become the reservoir of latent virus.

HCMV viral particles were shown to have distinct characteristics with regard to infection of and replication in different cell types, depending on the cell of the origin of the viral particle. Thus we intend to examine the influence of the type of virus producing cell on efficiency of infection of different target cells.

Project will combine methods of virology, cell and molecular biology. Following procedures will be used: infections, cloning, RNA sequencing, immunofluorescence staining, fluorescence in situ hybridization (FISH), confocal microscopy and image quantification, chromosome spreads, sucrose gradients and primary cell isolation. Our main interest is to study the mechanisms of congenital infection with HCMV, therefore in majority of experiments two latency models will be used: well established model of hematopoietic progenitors (CD34+), as a control, and the neuronal precursor model, which is not fully established yet and has not been studied much. Part of the project is devoted to developing the neuronal precursor model. To that end we will use iPSC (induced pluripotent stem cells) obtained by reprogramming of fibroblasts.

Description of the position:

Candidate will participate in the following research tasks:

  1. Establishment of a protocol for reproducible differentiation of iPSC (induced pluripotent stem cells) into primitive pre-rosette neuronal stem cells and further into neurons;
  2. Identification of the differentiation stage of neuronal lineage cells, at which HCMV is able to infect them, replicate and establish latency;
  3. Investigation of the influence of the type of virus producing cell on efficiency of infection of different target cells.

Type of grant: Sonata BIS – NZ6

Deadline for job application: 22.09.2020, 23:59

Form of application: email

Conditions of work:

  1. Location of the work place: Zespół Patologii i Medycyny Translacyjnej Rozrodu – IRZiBŻ Olsztyn, ul. Bydgoska 7, POLAND;
  2. Date of beginning of the employment: 01.10.2020;
  3. Length of work contract: until 30.04.2023.

Qualifications:

  1. Masters or PhD in microbiology, biotechnology, biology or related discipline;
  2. Knowledge in the field of molecular and cellular biology;
  3. Knowledge in the field of virology or microbiology and in vitro cultures;
  4. Ability to use the following techniques: Western blot, PCR and immunofluorescence staining of proteins in the cell;
  5. Experience with cell differentiation or working with stem cells is advantageous;
  6. Ability to communicate easily in English;
  7. Ability to communicate well and work in a group.

Interested candidates are asked to provide the following documents:

  1. Motivation letter;
  2. CV including list of publications, conference presentations, membership in scientific organizations and other awards;
  3. MS degree certificate, PhD diploma or certificate of participation in studies at the moment;
  4. Recommendation letter from a scientific mentor, confirming skills necessary for completing the project;
  5. Other documents, that in the opinion of the candidate are important when considering him/her for the position.

Applications should be sent to:

Dr. Magdalena Weidner-Glunde
m.weidner-glunde@pan.olsztyn.pl
Institute of Animal Reproduction and Food Research of Polish Academy of Sciences
Department of Team of Reproductive Pathology and Translational Medicine
ul. Bydgoska 7, 10-243 Olsztyn
Poland.

Please include in your application the following, signed statement:

„I agree to the processing of personal data provided in this document for realising the recruitment process pursuant to the Personal Data Protection Act of 10 May 2018 (Journal of Laws 2018, item 1000) and in agreement with Regulation (EU) 2016/679 of the European Parliament and of the Council of 27 April 2016 on the protection of natural persons with regard to the processing of personal data and on the free movement of such data, and repealing Directive 95/46/EC (General Data Protection Regulation)”.

Information clause

According to Art. 12 Para. 1 and 2 of the Regulation (EU) 2016/679 of the European Parliament and of the Council of 27 April 2016 on the protection of natural persons with regard to the processing of personal data and on the free movement of such data, and repealing Directive 95/46/EC (General Data Protection Regulation- hereinafter referred to as GDPR), we would like to inform you that:

  1. The administrator of your personal data is the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn, 10 Tuwima Str., 10-748 Olsztyn, NIP 739-05-04-515, REGON 001289340, phone: +48 89 523 46 86, e-mail: instytut@pan.olsztyn.pl.
  2. You can contact our Data Protection Officer by e-mail: instytut@pan.olsztyn.pl.
  3. Your personal data will be processed on the basis of art. 6 par. 1 lit. a general regulation on data protection and the Labor Code – Act of June 26, 1974 (Journal of Laws of 2018, item 108) for recruitment to work at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn .
  4. Personal data will be kept during the recruitment period.
  5. You have the right to request the administrator to access your personal data, the right to rectify it, delete or limit the processing and the right to withdraw consent to its processing.
  6. You have the right to lodge a complaint with the supervisory body, the President of the Office for Personal Data Protection.
  7. Providing personal data is a statutory requirement and is mandatory due to the provisions of labor law, and is voluntary in the remaining scope.
  8. Your data will not be processed in an automated way.
  9. The provision of your personal data is voluntary, but the refusal to provide such data may result in the inability to attend the recruitment process.

The results of the competition will be available on the website:

https://pan.olsztyn.pl/institute/results-of-competitions

The recruitment rules for research positions are available at:

https://pan.olsztyn.pl/institute/hr-excellence-in-research

 

Read more

Konkurs na stanowisko LAB MANAGER w projekcie SONATA BIS NCN

Nazwa jednostki:

Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk w Olsztynie

Nazwa stanowiska:

LAB MANAGER w projekcie SONATA BIS NCN „Badanie mechanizmów wrodzonej infekcji wirusem cytomegalii – replikacji, rozprzestrzeniania się oraz ustalania latencji”.

Opis projektu:

Infekcja wirusem cytomegalii (HCMV – human cytomegalovirus) jest przyczyną chorób wrodzonych. Jak w przypadku wszystkich herpeswirusów cykl życiowy HCMV zawiera fazę lityczną, kiedy wirus się namnaża oraz fazę latentną, w której wirus utrzymuje się w komórce w formie utajonej. Część projektu skupia się na zgłębianiu molekularnych aspektów latencji wirusa cytomegalii i ma na celu zbadanie czy białko IE1x4 jest głównym białkiem fazy latencji, odpowiedzialnym za persystencję tego wirusa.

Dotąd latencja HCMV była badana głównie w komórkach prekursorów hematopoetycznych, ale od niedawna wiadomo, że wirus ten może ustalić latencję również w komórkach prekursorów neuronalnych, co jest ważne w przypadku chorób wrodzonych związanych z infekcją HCMV. W związku z tym chcielibyśmy porównać latentne transkrypty wirusowe ulegające ekspresji w komórkach prekursorów hematopoetycznych oraz neuronalnych. Planujemy też zbadać warunki oraz etap różnicowania, w których komórki prekursorów neuronalnych stają się rezerwuarem latentnego wirusa.

Wykazano, że cząsteczki wirusa cytomegalii mają odmienne właściwości w zakresie, infekcji oraz replikacji w różnych typach komórek, w zależności od rodzaju komórek, w których zostały wytworzone.W związku z czym zamierzamy zbadać wpływ typu komórek, w których produkowany jest wirus na efektywność infekcji różnych komórek docelowych.

W projekcie połączone zostaną metody wirusologii oraz biologii molekularnej i komórkowej. Stosowane będą m.in.:. infekcje, klonowanie, RNA seq, znakowanie immunoflorescencyjne, FISH (fluorescence in situ hybridization), mikroskopia konfokalna i kwantyfikacja obrazów, rozprowadzanie metafaz, gradienty sacharozowe oraz izolacja komórek pierwotnych. Naszym głównym punktem zainteresowania są mechanizmy wrodzonej infekcji wirusem cytomegalii, w większości eksperymentów będziemy więc używali dwóch modeli latencji: dobrze ugruntowanego modelu komórek CD34+ jako kontroli oraz jak dotąd mało zbadanego i nie w pełni opracowanego modelu prekursorów neuronalnych. Część projektu będzie poświęcona dopracowaniu modelu prekursorów neuronalnych. W tym celu użyjemy iPSC (indukowanych pluripotencjalnych komórek macierzystych), które będą otrzymane przez przeprogramowane fibroblastów.

Opis zadań:

Kandydat będzie uczestniczył w zadaniach badawczych:

  1. Opracowanie protokółu różnicowania iPSC (indukowanych pluripotencjalnych komórek macierzystych) do etapu „primitive pre-rossette” nerwowych komórek macierzystych, a następnie do neuronów.
  2. Identyfikacja etapu różnicowania komórek linii nerwowej, na którym HCMV (ludzki wirus cytomegalii) może je infekować, ulegać replikacji oraz ustalać latencję.
  3. Badanie wpływu typu komórki wytwarzającej wirus HCMV na efektywność infekcji różnych typów komórek.

Typ konkursu NCN: Sonata BIS – NZ6

Termin składania ofert: 22.09.2020, 23:59

Forma składania ofert: email

Warunki zatrudnienia:

  1. Miejsce pracy: Zespół Patologii i Medycyny Translacyjnej Rozrodu – IRZiBŻ Olsztyn, ul. Bydgoska 7;
  2. Data rozpoczęcia: 01.10.2020;
  3. Czas trwania umowy: do 30.04.2023.

Kwalifikacje:

  1. Tytuł magistra lub stopień naukowy doktora: mikrobiologii, biotechnologii, biologii, lub pokrewnych;
  2. Wiedza z zakresu biologii molekularnej i komórkowej;
  3. Wiedza z zakresu wirusologii bądź mikrobiologii oraz kultur in vitro;
  4. Umiejętność wykonywania badań metodą western blotting, PCR oraz znajomość znakowania immunofluorescencyjnego białek w komórce;
  5. Doświadczenie w różnicowaniu komórek, bądź pracy z komórkami macierzystymi mile widziane;
  6. Znajomość języka angielskiego na poziomie umożliwiającym swobodne komunikowanie się;
  7. Komunikatywność i umiejętność pracy w zespole.

Osoby zainteresowane proszone są o przesłanie następujących dokumentów:

  1. List motywacyjny;
  2. Życiorys naukowy z wykazem publikacji, konferencji, członkostw w towarzystwach i kołach naukowych oraz innych osiągnięć;
  3. Kopia dyplomu ukończenia studiów magisterskich/studiów II stopnia, kopia dyplomu uzyskania stopnia doktora lub zaświadczenie realizacji studiów doktoranckich;
  4. Opinia opiekuna naukowego poświadczająca posiadanie umiejętności, niezbędnych przy realizacji projektu;
  5. Inne dokumenty, które wg Kandydata są istotne przy rozpatrzeniu jego Kandydatury.

Zgłoszenia zawierające komplet dokumentów powinny zostać dostarczone do dnia 22.09.2020 roku, do godziny 23:59, pocztą elektroniczną na adres: m.weidner-glunde@pan.olsztyn.pl.

W temacie wiadomości należy podać „Konkurs na specjalistę/SONATA BIS”.

Ewentualne pytania dotyczące konkursu prosimy kierować do kierownika projektu:

Dr Magdalena Weidner-Glunde
Zespół Patologii i Medycyny Translacyjnej Rozrodu,
Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk w Olsztynie
10-243 Olsztyn, ul. Bydgoska 7,
e-mail: m.weidner-glunde@pan.olsztyn.pl
tel.: +48 89 539 31 38.

W CV prosimy o umieszczenie klauzuli zgody na przetwarzanie przez nas danych osobowych w procesie rekrutacji:

„Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych zawartych w dokumentach aplikacyjnych przez Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie z siedzibą 10-748 Olsztyn ul. Tuwima 10, w celu realizacji procesu rekrutacji (zgodnie z art. 6 ust. 1 lit. a Rozporządzenia Parlamentu Europejskiego i Rady (UE) 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w związku z przetwarzaniem danych osobowych i w sprawie swobodnego przepływu takich danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46/WE)”.

Informujemy, że:

  1. Administratorem Pani/Pana danych osobowych jest Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie z siedzibą 10-748 Olsztyn ul. Tuwima 10. Z administratorem można się skontaktować drogą elektroniczną na adres e-mail: instytut@pan.olsztyn.pl lub pisemnie na adres siedziby administratora.
  2. Pani/Pana dane osobowe przetwarzane będą w celu realizacji obecnego procesu rekrutacji i przechowywane do czasu jej zakończenia.
  3. Przysługuje Pani/Panu prawo dostępu do treści danych oraz ich sprostowania, usunięcia lub ograniczenia przetwarzania, a także prawo sprzeciwu, zażądania zaprzestania przetwarzania i przenoszenia danych, jak również prawo do cofnięcia zgody w dowolnym momencie oraz prawo do wniesienia skargi do organu nadzorczego, tj. Prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych.
  4. Dane udostępnione przez Panią/Pana nie będą podlegały profilowaniu ani udostępnieniu podmiotom czy państwom trzecim. Odbiorcami danych mogą być instytucje upoważnione z mocy prawa.
  5. Podanie przez Pana/Panią danych osobowych jest dobrowolne.

Wyniki konkursu dostępne będą na stronie:

https://pan.olsztyn.pl/instytut/wyniki-konkursow

Zasady rekrutacji na stanowiska naukowe dostępne są na stronie:

https://pan.olsztyn.pl/instytut/hr-excellence-in-research

 

Read more

2,5 mln euro dla Instytutu na powołanie Centrum Doskonałości w obszarze nutrigenomiki

Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie zdobył 2,5 miliona euro w programie ERA Chairs H2020 na realizację 6-letniego projektu „Welcoming ERA Chair to Centre of Excellence in nutrigenomics for optimising health and well-being”, akronim: WELCOME2. Jego celem jest powołanie w Instytucie interdyscyplinarnego centrum doskonałości w badaniach wykorzystujących narzędzia nutrigenomiki do oceny wpływu odżywiania na genetyczne predyspozycje do tzw. chorób dietozależnych. (więcej…)

Read more

„Cudze chwalicie, swoje poznajcie”

Ministerstwo Rolnictwa i Rozwoju Wsi wraz z jednostkami doradztwa rolniczego realizuje kampanię informacyjną pod nazwą „Cudze chwalicie, swoje poznajcie”, która promuje polskiebazarek.pl. Polskiebazarek.pl jest odpowiedzią na utrudnienia występujące w dobie koronawirusa z tradycyjnym sposobem sprzedaży produktów – pomaga w nawiązywaniu bezpośrednich kontaktów przez rolników i producentów żywności z konsumentami. Można na nim bezpłatnie zamieszczać ogłoszenia o sprzedaży swoich produktów a konsument płaci dokładnie tyle, ile proponuje rolnik – nie ma marży pobieranej przez pośredników.

 

Read more

Wyniki konkursu na stanowisko Post-doc w projekcie NCN SONATA 15

Dyrektor Instytutu informuje, że konkurs na stanowisko Post-doc w projekcie NCN SONATA 15 pt. pt. „The interaction of T helper cell subsets with endometrial fibroblasts in processes associated to development of mare endometrosis” został rozstrzygnięty i wybrana została Pani dr Agnieszka Sadowska.

 

Read more

Kurs MOOC na temat bezpieczeństwa żywności

Opakowania odgrywają kluczową rolę w procesie zachowania bezpieczeństwa żywności w całym łańcuchu dostaw. Powinny chronić ją przed czynnikami zewnętrznymi, takimi jak wilgoć, temperatura czy promieniowanie oraz spełniać wymogi szczelności oraz odporności na uszkodzenia pod wpływem czynników mechanicznych. Opakowania mogą być jednak źródłem szkodliwych związków chemicznych, które mogą migrować do żywności i wpływać na funkcjonowanie naszego organizmu. Na szczególną uwagę zasługują tu związki chemiczne i pierwiastki obecne w małych dawkach, których długotrwałe spożycie może wpływać na układ hormonalny. (więcej…)

Read more

MOOC on food safety and consumer protection

Food safety is a highly controlled in the European Union. One aspect that is often underestimated is the migration of chemicals from food contact materials and packaging into food and drinks that we consume daily. In particular, the chemicals that – at low doses and for extended time – may impact our vulnerable endocrine system. The effects become evident when we think about the reduced male fertility, the anticipated female puberty and the thyroid and metabolic disturbances on the rise in our societies. (więcej…)

Read more