PL

Pracownia Mikrobiologii i Wirusologii Molekularnej

Laboratorium posiada:

  • Status Zespołu Inżynierii Genetycznej klasy II,
  • Zgodę na zamknięte użycie mikroorganizmów genetycznie modyfikowanych (GMM) klasy II

oraz następujące stanowiska robocze:

  1. Stanowisko robocze do pracy z kulturami in vitro oraz GMM klasy II;
  2. Stanowisko robocze do izolacji fibroblastów z tkanek ludzkich;
  3. Stanowisko robocze do analizy ekspresji białek (SDS PAGE + Western blot);
  4. Stanowisko robocze do hodowli bakterii na podłożach płynnych i stałych oraz kokultur bakterii z tkankami.

Profil badań:

Głównym celem naukowo-badawczym Pracowni Mikrobiologii i wirusologii molekularnej jest wyjaśnienie mechanizmów wrodzonej infekcji wirusem cytomegalii – replikacji, rozprzestrzeniania się oraz ustalania latencji.

Infekcja ludzkim wirusem cytomegalii (HCMV– human cytomegalovirus) jest bardzo powszechna. Pierwotne zakażenie HCMV u zdrowych ludzi jest zazwyczaj bezobjawowe, jednak u pacjentów z niedoborem odporności, np. po transplantacji bądź chorych na AIDS, może spowodować poważną chorobę. HCMV jest też przyczyną chorób wrodzonych, ponieważ wirus ten jest w stanie przeniknąć z krwiobiegu infekowanej matki przez łożysko do płodu. Choroba będąca skutkiem wrodzonego zakażenia HCMV związana jest z zakażeniem centralnego układu nerwowego, i co za tym idzie, neuronalnymi wadami rozwoju. Symptomy związane z wrodzoną chorobą wywołaną przez HCMV to np.: utrata słuchu, uszkodzenie wzroku oraz problemy z nauką.

Jak w przypadku wszystkich herpeswirusów cykl życiowy HCMV zawiera fazę lityczną, kiedy wirus się namnaża oraz fazę latentną, w której wirus utrzymuje się w komórce w formie utajonej. Część naszych badań skupia się na zgłębianiu molekularnych aspektów latencji wirusa cytomegalii i ma na celu badanie głównego białka fazy latencji, odpowiedzialnego za persystencję tego wirusa.

Dotąd latencja HCMV była badana głównie w komórkach prekursorów hematopoetycznych, ale od niedawna wiadomo, że wirus ten może ustalić latencję również w komórkach prekursorów neuronalnych, co jest ważne w przypadku chorób wrodzonych związanych z infekcją HCMV. W związku z tym chcielibyśmy porównać latentne transkrypty wirusowe ulegające ekspresji w komórkach prekursorów hematopoetycznych oraz neuronalnych. Badamy też warunki oraz etap różnicowania, w których komórki prekursorów neuronalnych stają się rezerwuarem latentnego wirusa.

Wykazano, że cząsteczki wirusa cytomegalii mają odmienne właściwości w zakresie, infekcji oraz replikacji w różnych typach komórek, w zależności od rodzaju komórek, w których zostały wytworzone. W związku z czym badamy też wpływ typu komórek, w których produkowany jest wirus na efektywność infekcji różnych komórek docelowych.

Czytaj więcej

Patronat honorowy

Patronat honorowy

Patronat honorowy Marszałka Województwa Warmińsko-Mazurskiego, Gustaw Marek Brzezin
Herb

Patronat Starosty Powiatu Piskiego, Andrzej Nowicki
Logo Pisz

Patronat Burmistrza Ruciane – Nida, Piotr Ryszard Feliński
Logo Ruciane-Nida

Patronat Prezesa Polskiej Akademii Nauk, prof. Jerzy Duszyński
Logo PAN

Patronat Prezesa Polskiego Związku Hodowców Koni, Paweł Mazurek
logo PZHK

Patronat Dyrekcji Generalnej Lasów Państwowych
Logo Lasy Panstwowe

Patronat medialny Hodowca i Jeździec, kwartalnik Polskiego Związku Jeździeckiego
logo Hodowca i jezdziec

Czytaj więcej

Warsztaty Bilateralne

Wspólnie działamy na rzecz Europy zielonej,
konkurencyjnej i sprzyjającej integracji społecznej

30 maja 2019 w Olsztynie w ramach pierwszych warsztatów bilateralnych odbyło się Seminarium Środowiskowe dot. możliwości zagospodarowania ścieków i odpadów poprodukcyjnych. W wydarzeniu wzięli udział przedstawiciele przemysłu, samorządowcy, naukowcy, start-upy oraz przedsiębiorcy z Islandii i Polski, którzy podzielili się swoimi doświadczeniami i poznali obecne trendy, dobre praktyk, tendencje rozwojowe i innowacje w tym zakresie.

Prezentacje przedstawione w trakcie Seminarium:

  1. European Economic Area (EEA) and Norway Grants Project: Innovation, business creation and valorization of side streams of food production and food processing – Tomasz Jelinski, Institute of Animal Reproduction and Food Research PAS; Poland;
  2. Innovative, cost-effective and sustainable valorisation of agri-food side streams. Exploiting the opportunities provided by European Economic Area (EEA) and Norway Grants – Gudjon Thorkelsson senior scientist Matis ohf; professor University of Iceland, Iceland;
  3. Innovation in cross-sectoral bioeconomy – Björn Viðar Aðalbjörnsson, Faculty of Food Science and Nutrition, University of Iceland, Iceland;
  4. Role of genetic analysis in value creation in the blue and green bioeconomy – Sæmundur Sveinsson, Matis ohf, Iceland;
  5. From microbiology to a HACKATHON – Justine VANHALST , Matís ohf, Iceland;
  6. Quality optimisation of frozen Atlantic mackerel (Scomber scombrus) products – Paulina E. Wasik, Matis ohf/University of Iceland, Iceland;

Czytaj więcej

Fundusze norweskie i EOG

Wspólnie działamy na rzecz Europy zielonej,
konkurencyjnej i sprzyjającej integracji społecznej

Innowacje, podnoszenie wartości i tworzenie firm w zakresie zagospodarowania odpadów produkcji i przetwórstwa żywności

W Polsce jak i na całym świecie coraz większym problemem staje się zarówno ilość jak i różnorodność powstających odpadów. Sytuacja ta stanowi ogromne wyzwanie szczególnie dla producentów przemysłu spożywczego, nie tylko pod względem kosztów utylizacji, ale także w kontekście ochrony środowiska i zrównoważonego rozwoju. Efektywne zagospodarowanie odpadów to oszczędność, ale także przejaw działania zgodnego z nowoczesnymi trendami. W takiej sytuacji nowe sposoby wykorzystania odpadów są oczekiwanym przez producentów i przetwórców kierunkiem wsparcia, które może dostarczyć środowisko naukowe, szczególnie w zakresie pobudzania przedsiębiorczości, komercjalizacji i wdrażania najlepszych rozwiązań dla przemysłu.

W ramach współpracy bilateralnej wspartej przez Mechanizm Finansowy Europejskiego Obszaru Gospodarczego i Norweski Mechanizm Finansowy w ramach Funduszu Współpracy Dwustronnej, Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie oraz Islandzki Instytut Badawczy Żywości i Biotechnologii MATIS oraz Uniwersytet Islandzki podjęły się wspólnych działań w dziedzinie badań i innowacji żywności. Zadania zaplanowane w projekcie będą dedykowane w szczególności studentom oraz młodym pracownikom nauki, którzy zdobędą wiedzę i doświadczenie w zakresie interdyscyplinarnych innowacji w sektorze rolno-spożywczym. Producenci, przetwórcy i przedsiębiorcy uczestniczący w działaniach projektowych poznają współczesne trendy w zagospodarowaniu odpadów oraz produkcji i przetwórstwa żywności. Z kolei naukowcy będą mogli wykorzystać zdobytą wiedzę w nowych międzynarodowych projektach z zakresu zrównoważonego wykorzystywania zasobów naturalnych.

Zaproszenie do współpracy partnerów z Islandii, takich jak MATIS i Uniwersytet Islandzki, pozwoli przekazać ich wieloletnie doświadczenie i podejście do zagospodarowania odpadów do regionów, które w skali ogólnoeuropejskiej uznawane są za najmniej innowacyjne i przedsiębiorcze. Islandzki MATIS współpracując z producentami i przetwórcami biologicznych zasobów morza, wprowadził przemysł przetwórczy Islandii do grona najbardziej konkurencyjnych na świecie. Osiągnięto to maksymalizując wartość tradycyjnych produktów poprzez poprawę ich jakości, optymalizację procesów produkcji i logistyki. Najważniejszym jednak okazało się zagospodarowanie odpadów poprzez ich bio‑przetwarzanie i wykorzystanie produktów otrzymanych z drobnoustrojów żyjących w ekstremalnym środowisku Islandii. Ważnym czynnikiem sukcesu było również przeszkolenie studentów oraz młodej kadry naukowej w zakresie przedsiębiorczości. Partnerzy projektu są przekonani, że współpraca realizowana w ramach inicjatywy przyczyni się do powstania analogicznej sytuacji w Polsce.

 

Czytaj więcej

Ważne informacje

Ważne informacje

# Prosimy o przesyłanie tytułów i abstraktów prezentacji wyłącznie w języku angielskim. Język wygłoszenia prezentacji jest do wyboru: polski lub angielski;

# Streszczenia wykładów plenarnych i komunikatów naukowych będą opublikowane w materiałach konferencyjnych w wersji elektronicznej;

# Konferencja „Metabolomics Circle 2019” odbędzie się w hotelu HP Park w Olsztynie (al. Warszawska 119; www.olsztyn.hotelepark.pl);

# Organizacja i opłata za noclegi podczas konferencji odbywa się w zakresie uczestników;

# W HP Park w Olsztynie (hpolsztynrez@hotelepark.pl) na hasło „Metabolomika” istnieje możliwość zarezerwowania noclegów o obniżonej opłacie.

Ważne daty

# do 30.09.2019 – zgłoszenie uczestnictwa i przesłanie abstraktów;

# do 07.10.2019 – informacja o zaakceptowaniu prezentacji;

# do 14.10.2019 – wniesienie opłaty konferencyjnej.

Czytaj więcej

Program konferencji

Program konferencji

15th November 2019
09.00-13.00 Workshops on the use of mass spectrometry in metabolomics. Company: BioAnalytic – Maciej Stopa (Institute of Animal Reproduction and Food Research, PAS, Olsztyn, 10 Tuwima Str.)
12.00-14.00 Registration (Hotel HP Park, Olsztyn, 119 Warszawska Str.)
13.15-14.15 Welcome Reception
14.15-14.30 Conference Opening
SESSION 1, Chairpersons: Bogusław Buszewski, Piotr Młynarz
PLENARY LECTURE (25 MIN)
15:15 – 15:35 Ralf Weber, University of Birmingham, United Kingdom
„Computational metabolomics in human health, disease and toxicology: challenges, opportunities and lessons learned”
ORAL PRESENTATION (15 MIN)
15.00-15.15 Joanna Giebułtowicz, Medical University of Warsaw, Poland
„Use of LC-MS based metabolic fingerprinting for prediction the response to the anticoagulant therapy in atrial fibrillation”
15.20-15.35 Michał Ciborowski, Medical University of Bialystok, Poland
“Oxidative stress in non-small cell lung cancer: changes in the early oxidation products in plasma and lung tissue”
15.40-15.55 Łukasz Boguszewicz, Maria Sklodowska-Curie Institute – Oncology Center Gliwice Branch, Poland
“Systemic response to chemo- and radiochemotherapy by means of 1H NMR based metabolomics”
E-POSTER (5 MIN)
16.00-16.05 Emilia Fornal, Medical University of Lublin, Poland
“Exploratory LC-QTOF plasma metabolomic profiling in patients with systemic lupus erythematosus”
16.07-16.12 Natalia Drabińska, Institute of Animal Reproduction and Food Research, Polish Academy of Sciences in Olsztyn, Poland
„Towards the detection of bladder cancer using urinary volatolomics and different statistical approaches”
16.14-16.19 Badr Qasem, Wroclaw University of Science and Technology, Poland
„Metabolomics approach by 1H NMR spectroscopy of serum of rats with endometriosis treatment”
16.21-16.26 Emilia Raćkowska, Medical University of Warsaw, Poland
'Targeted metabolomic profiling of amino acids in serum of severe obese patients undergoing bariatric surgery”
16.28-16.33 Tomasz Kowalczyk, Medical University of Bialystok, Poland
“Spectral Quality Controller: semi-automated tool to assess the quality of MS/MS spectra”
16.35-16.40 Karol Jelonek, Maria Sklodowska-Curie Institute – Oncology Center Gliwice Branch, Poland
“Application of serum metabolome profiles in monitoring the systemic effects of concomitant chemo-radiotherapy and radiotherapy alone in head and neck cancer patients”
16.42-16.47 Jakub Idkowiak, Medical University of Warsaw, Poland
“Effects of supplementation with micro- and nanozinc particles on the blood serum metabolites profile in the case of DMBA-induced breast cancer in rats – a pilot study”
16.49-16.54 Karolina Anna Mielko, Wroclaw University of Science and Technology, Poland
“Comparison of Pseudomonas aeruginosa strains from different sources”
16.56-17.01 Kacper Jabłonowski, Medical University of Bialystok, Poland
“The influence of different types of plastic tubes used to store plasma in the biobanking settings on the plasma metabolome”
17.03-17.08 Natalia Korytowska, Medical University of Warsaw, Poland
“The utility of targeted metabolomics of saliva in the monitoring of uremic toxins level in plasma of kidney transplant recipients”
17.10-17.50 Coffee break/poster session
DISCUSSION PANEL
17.50-18.40 „Standard and non-standard approaches to the development of LC and GC-MS/MS methods”
Moderator: Ryszard T. Smoleński
Experts: Konrad Kowalski, Rafał Szewczyk, Łukasz Nowicki, Marcin Gawryś, Bartosz Rasiński, Jacek Loth
18.40-19.30 „Statistical analysis in biomedical sciences”
Moderator: Piotr Młynarz
Experts: Michał Ciborowski, Michał Startek, Michał Seweryn
20.00-23.00 Conference dinner

16th November 2019
SESSION 2, Chairpersons: Michał Markuszewski, Ryszard T. Smoleński
PLENARY LECTURE (25 MIN)
09.00-09.25 Norman Ratcliffe, University of the West of England, Bristol, United Kingdom
“The smell of disease-can volatiles from the human body be used to rapidly diagnose disease?”
09.30-09.55 Piotr Młynarz, Wroclaw University of Science and Technology, Poland
“Monitoring of kidney graft adaptation processes by NMR based metabolomics”
ORAL PRESENTATION (15 MIN)
10.00-10.15 Jan Matysiak, Poznan University of Medical Sciences, Poland
“Metabolomic characterization of honeybee venom”
10.20-10.35 Małgorzata Szultka-Młyńska, Nicolaus Copernicus University, Toruń, Poland
“Application of EC LC-MS/MS as a tool in metabolism studies”
E-POSTER (5 MIN)
10.40-10.45 Piotr Minkiewicz, University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Poland
“BIOPEP-UWM database as a tool supporting research on peptide metabolism”
10.47-10.52 Patrycja Mojsak, Medical University of Bialystok, Poland
“Impact of the supplementation of Lactobacillus Plantarum on the metabolic profile of patients with the depression with insight into the L- and D-amino acids quantification”
10.54-10.59 Agata Sumara, Medical University of Lublin, Poland
“Application of LC-QTOF and chemometric methods in metabolite profiling of unrafined, cold pressed milk thistle and black cumin seeds oils”
11.01-11.06 Joanna Godzień, Medical University of Bialystok, Poland
“Tentative+: knowledge-based annotation approach for lipids in LC/MS metabolomics”
11.08-11.13 Wojciech Wojtowicz, Wroclaw University of Science and Technology, Poland
“Different approach, same results. The non-invasive screening for breast cancer”
11.15-11.50 Coffee break/poster session
DISCUSSION PANEL
11.50-12.35 „Analytical techniques used in metabolomics”
Moderator: Tomasz Bieńkowski
Experts: Bogusław Buszewski, Piotr Młynarz, Maciej Stopa, Łukasz Nowicki, Marcin Gawryś, Jakub Idkowiak
12.35-13.20 „Pharmacokinetics and metabolism in in vitro and in vivo studies”
Moderator: Piotr J. Rudzki
Experts: Tomasz Grabowski, Jan Matysiak, Damian Smuga
13.20-14.20 Lunch
SESSION 3, Chairperson: Ewa Słomińska, Michał Ciborowski
 PLENARY LECTURE (25 MIN)
14.20-14.45 Piotr J. Rudzki, Łukasiewicz Research Network – Pharmaceutical Research Institute, Warsaw, Poland
“How does a pharmacist confirm bioanalytical method reliability?”
ORAL PRESENTATION (15 MIN)
14.50-15.05 Anna Iwaniak, University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Poland
“Studying of bioactive peptides based on sequence analysis”
15.10-15.25 Joanna Bogusiewicz, Collegium Medicum in Bydgoszcz, Nicolaus Copernicus University, Toruń, Poland
“Lipidomics in Histological and Genetic Differentiation of Brain Tumors”
15.30-15.45 Michał Startek, University of Warsaw, Poland
“Masstodon – a tool for assigning peaks and deconvolution of fragmentation spectra”
E-POSTER (5 MIN)
15.50-15.55 Marta Turło, University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Poland
“Databases of metabolites and metabolic pathways”
15.57-16.02 Katarzyna Miniewska, Medical University of Bialystok, Poland
“Plasma metabolic profiles are related to activity and volume of brown adipose tissue in lean and obese individuals”
16.04-16.09 Magdalena Surma, University of Agriculture in Krakow, Poland
“Contamination of selected food products with perfluoroalkyl substances”
16.11-16.16 Dariusz Kruszka, Institute of Plant Genetics of the Polish Academy of Science, Poznań, Poland
“Induction of phytohormones and polyphenols in Hypericum perforatum cell culture by metal nanoparticles”
16.18-16.23 Ewa Parfieniuk, Medical University of Bialystok, Poland
“Quantification of statins in different types of tissue using validated LC-MS/MS method”
DISCUSSION PANEL
16.25-17.15 “Implementation of scientific research in medical diagnostics”
Moderator: Konrad Kowalski
Experts: Michał Markuszewski, Karol Majewski, Tomasz Bieńkowski, Maciej Stopa
17.15-17.30 Conference Closing
17.30-18.30 Dinner

TRADITIONAL POSTER SESSION 

15th November 2019 – 13.15 – 14.15; 17.10 – 17.50

16th November 2019 – 11.15 – 11.50)

  1. Szymon Plewa, Poznan University of Medical Sciences, Poland “Implementation of LC-MS/MS method of analysis bile acids in biological matrices”;
  2. Agnieszka Stawarska, Medical University of Warsaw, Poland “The effect of selected oils on the activity of desaturases and fatty acids profile in rats”;
  3. Natalia Witaszak, Institute of Plant Genetics of Polish Academy of Sciences, Poznań, Poland “Care for good pets’ nutrition – Is the pet food free of mycotoxins?”;
  4. Izabela Turkowska, Technical University of Białystok, Poland „Biotransformation od xenobiotics”;
  5. Gulyaim Sagandykova, Nicolaus Copernicus University, Toruń, Poland “Target-based drug discovery through inversion of quantitative structure-drug-property relationships and molecular simulation: CA IX-sulphonamide complexes”;
  6. Monika Pliszka, University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Poland „Angiotensin I-converting enzyme inhibitory activity of oat proteins hydrolysates”;
  7. Joanna Dawidowska, Medical University of Gdańsk, Poland “Metabolomic studies in search for ethyl alcohol abuse biomarkers in blood and evaluation of the usefulness of the obtained results in forensic medicine”;
  8. Damir Mogut, University of Warmia and Mazury in Olsztyn, Poland, Poland “Gouda cheese with the modified content of β-casein as the source of metabolic syndrome preventive peptides”;
  9. Alicja Pakiet, University of Gdansk, Poland “Evaluating the effect of the one anastomosis gastric bypass on amino acid and fatty acid metabolism using mass spectrometry”;
  10. Mariola Słowińska, Institute of Animal Reproduction and Food Research, Polish Academy of Sciences in Olsztyn, Poland “Metabolomic analysis of white and yellow seminal plasma in turkeys (Meleagris gallopavo)”;
  11. Katarzyna Pauter, Nicolaus Copernicus University, Toruń, Poland “Salivary microbiome profiling with the use of matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry”;
  12. Mariola Dietrich, Institute of Animal Reproduction and Food Research, Polish Academy of Sciences in Olsztyn, Poland “Metabolic fingerprinting of carp and rainbow trout seminal plasma”;
  13. Patrycja Jabłońska, Medical University of Gdańsk, Poland “Determination of nicotinamide metabolites in lung cancer patients”;
  14. Justyna Mielnik, Wroclaw University of Science and Technology, Poland “Development of extraction method and analysis of endocannabinoids using LC-MS/MS”;
  15. Magdalena Buszewska-Forajta, Medical University of Gdańsk, Poland “Are fatty acids correlated with CaP developement?”;
  16. Izabela Turkowska, Technical University of Białystok, Poland “Diseases connected to glycogen storage”;
  17. Joanna Raczak-Gutknecht, Medical University of Gdańsk, Poland “Validation of the metabolic profiles determination method of serum samples from women with PCOS using LC-MS/GC-MS techniques”;
  18. Natalia Płatosz, Institute of Animal Reproduction and Food Research, Polish Academy of Sciences in Olsztyn, Poland „Chokeberry anthocyanin’s and their metabolite’s ability to cross the blood-brain barrier”;
  19. Angela Sessitsch, Austrian Institute of Technology GmbH, Austria „MicrobiomeSupport: Towards coordinated microbiome R&I activities in the food system to support (EU and) international bioeconomy goals”.

Czytaj więcej

Organizatorzy

Komitet Naukowy

Dr hab. n. farm. Barbara Bojko – Collegium Medicum UMK
Prof. dr hab. Bogusław Buszewski – UMK w Toruniu
Dr hab. Michał Ciborowski – Uniwersytet Medyczny w Białymstoku
Prof. dr hab. n. farm. Michał Markuszewski – Gdański Uniwersytet Medyczny
Dr hab. Piotr Młynarz, prof. nadzw. – Politechnika Wrocławska
Prof. dr hab. Mariusz K. Piskuła – IRZiBŻ PAN Olsztyn
Dr hab. Ewa Słomińska – Gdański Uniwersytet Medyczny
Prof. dr hab. med. Ryszard Smoleński – Gdański Uniwersytet Medyczny
Prof. dr hab. Maciej Stobiecki – IBCh PAN Poznań
Dr Rafał Szewczyk – Centrum Badawczo-Rozwojowe DiMedical, Łódź
Dr hab. Wiesław Wiczkowski – IRZiBŻ PAN Olsztyn

Komitet Organizacyjny

Dr hab. Wiesław Wiczkowski, IRZiBŻ PAN Olsztyn – przewodniczący
Dr Konrad Kowalski – Laboratorium Diagnostyczne Masdiag Sp. z o.o.
Dr inż. Joanna Honke – IRZiBŻ PAN Olsztyn
Dr inż. Tomasz Jeliński – IRZiBŻ PAN Olsztyn
Mgr Natalia Płatosz – IRZiBŻ PAN Olsztyn
Dr Małgorzata Starowicz – IRZiBŻ PAN Olsztyn
Dr inż. Dorota Szawara-Nowak – IRZiBŻ PAN Olsztyn
Mgr inż. Joanna Topolska – IRZiBŻ PAN Olsztyn

Czytaj więcej