Fish Proteomics – pod taką nazwą odbył się kurs przeprowadzony w Oddziale Biologii Rozrodu IRZiBŻ PAN w dniach 26-30 września 2016 w ramach Akcji COST AQUAGAMETE.
W skład komitetu organizacyjnego weszli pracownicy Zespołu Biologii Gamet i Zarodka: prof. dr hab. Andrzej Ciereszko, dr hab. Mariola Dietrich, dr Joanna Nynca, dr Mariola Słowińska, mgr Agnieszka Mostek oraz mgr Błażej Westfalewicz. Dodatkowo, wykłady prowadzili prof. Serhiy Souchelnytskyi (College of Medicine, Qatar University) oraz dr Thomas Fröhlich (Laboratory for Functional Genome Analysis, Gene Center of the University of Munich).
Podczas kursu wygłoszono 9 wykładów obejmujących m.in. wprowadzenie do proteomiki, analizę natywnych białek przy pomocy elektroforezy dwukierunkowej (2DE) oraz spektrometrii mas typu MALDI, przygotowanie prób do analiz proteomicznych, związek pomiędzy proteomiką a genomiką, bioinformatykę (Prof. Serhiy Souchelnytskyi); elektroforezę 2D DIGE (mgr Błażej Westfalewicz); proteomikę w badaniach rozrodu ryb (Prof. Andrzej Ciereszko); proteomikę w badaniach rozrodu ssaków, bazy danych sekwencji białowych oraz proteomikę ilościową (dr Thomas Fröhlich).
Kurs ukierunkowany był również na intensywne zajęcia praktyczne umożliwiające studentom nabycie umiejętności przeprowadzenia podstawowych analiz proteomicznych. Zajęcia były prowadzone przez pracowników Zespołu Biologii Nasienia ZBGiZ oraz prof. Serhiy’a Souchelnytskyi’ego. Na początku studenci przygotowali preparaty białkowe z różnych tkanek ryb, które następnie poddali izoelektroogniskowaniu oraz elektroforezie SDS-PAGE. Po elektroforezie żele utrwalono, wybarwiono i przeprowadzono komputerową analizę uzyskanych obrazów żeli. Wyselekcjonowane spoty białkowe zostały poddane trawieniu i zidentyfikowane przy pomocy spektrometrii mas. W ostatnim dniu treningu każdy z uczestników zaprezentował uzyskane w trakcie kursu obrazy żeli 2DE oraz wyniki identyfikacji białek, które szczegółowo omówiono i analizowano.
Uczestnikami kursu było 9 studentów z Brazili, Chin, Czech, Węgier, Iranu, Włoch i Polski.
http://aquagamete.webs.upv.es/7th-training-school-olsztyn-poland-september-2016/
