Najczęściej cytowani w Theriogenology

Publikacja zespołu badawczego kierowanego przez dr hab. inż. Radosława Kowalskiego z Zespołu Biologii Gamet i Zarodka naszego Instytutu znalazła się wśród najczęściej cytowanych artykułów opublikowanych w latach 2018-2022 w czasopiśmie Theriogenology.

Praca przeglądowa „Sperm quality in fish: Determinants and affecting factors” autorstwa dr hab. inż. Radosława Kowalskiego oraz dr hab. inż. Beaty Cejko opisuje najnowsze osiągnięcia diagnostyczne w badaniu jakości nasienia ryb z uwzględnieniem występujących między nimi różnic międzygatunkowych, wskazując kierunek ich rozwoju. Krytycznie opisano w niej zasadę analizy CASA (Computer Assisted Semen Analysis) oraz wyjaśniono na przykładzie wyników własnych oraz wyników innych badaczy, dlaczego w tej analizie pojawiają się znaczne rozbieżności.

Autorzy wskazali na krytyczną rolę FPS (klatek na sekundę) kamery stosowanej w badaniu CASA w otrzymywaniu rzetelnych danych ruchliwości plemników. Ponadto po raz pierwszy przedstawiono wizualizację zasady powstawania błędów w analizie CASA w przypadku zbyt małej wartości FPS.

– Publikacja jest pracą podsumowującą wiedzę zdobytą na przestrzeni ostatnich 20 lat przez Zespół Andrologii Molekularnej. Konfrontuje ona wyniki uzyskane przez nasz zespół z pracami innych badaczy, systematyzując wiedzę na temat czynników, które wpływają na jakość plemników ryb. Zawarte w pracy wnioski, a także dalsze pytania, które stoją przed badaczami zajmującymi się rozrodem ryb, stanowią istotną wartość naukową publikacji, czyniąc ją przydatną dla każdego, kto rozpoczyna pracę naukową z gametami ryb – powiedział dr hab. inż. Radosław Kowalski, główny autor publikacji.

Pełna lista najczęściej cytowanych publikacji jest pod tym adresem.

 

Czytaj więcej

Scientists of our Institute are most frequently cited in Theriogenology

The research team’s publication led by Radosław Kowalski, Ph.D., from the Department of Gamete and Embryo Biology of our Institute was among the most cited articles published from 2018 to 2022 in Theriogenology.

The review paper „Sperm quality in fish: Determinants and affecting factors” by dr Radosław Kowalski and dr Beata Cejko, describes the latest diagnostic developments in the study of fish sperm quality taking into account interspecies differences, indicating the direction of their development. The paper critically describes the principle of Computer Assisted Semen Analysis (CASA) and explains, based on our own and other researchers’ results, why there are significant discrepancies in this analysis.

The authors pointed out the critical role of the FPS (frames per second) of the camera used in the CASA study in obtaining reliable sperm motility data. In addition, a visualization of the error rule in CASA analysis when the FPS value is too low is presented for the first time.

This publication is a summary of the knowledge gained over the last 20 years by the Molecular Andrology Team. It confronts the results obtained by our team with the works of other researchers, systematizing the knowledge on the factors that affect the quality of fish spermatozoa. The conclusions included in the paper, as well as further questions facing researchers dealing with fish reproduction, constitute an important scientific value of the publication, making it useful for anyone who starts their scientific work with fish gametes,” said Radosław Kowalski, Ph.D., lead author of the publication.

The full list of most cited publications is at this link.

 

Czytaj więcej

​Distinctions of the Committee of Animal Sciences and Aquaculture

Two scientific achievements of interdisciplinary research teams involving scientists from the Institute of Animal Reproduction and Research PAS have been honored by the Committee of Animal Sciences and Aquaculture of the Polish Academy of Sciences – one with the main prize and the other with an honorable distinction.

The main prize of the Committee of Animal and Aquaculture Sciences of the Polish Academy of Sciences was awarded for the scientific achievement „Antioxidant and immunostimulating effect of different levels and the mutual ratio of lysine, arginine, and methionine in mixtures for turkeys for slaughter”.

The authors of the paper are:

  • Prof. Dariusz Mikulski, Ph.D;
  • Prof. Katarzyna Ognik, Ph.D;
  • Paweł Konieczka, Ph.D;
  • Magdalena Krauze, Ph.D;
  • Anna Stępniowska, Ph.D;
  • Ewelina Cholewińska, Ph.D;
  • Bartłomiej Tykałowski, Ph.D;
  • Prof. Zenon Zduńczyk, Ph.D;
  • Prof. Jerzy Juśkiewicz, Ph.D.

The study aimed to determine the optimal ratio of lysine (Lys), arginine (Arg), and methionine (Met) in diets of turkeys for fattening, taking into account different intensities of feeding and multidirectional metabolic effects of amino acids analyzed. The researchers considered a wide range of indicators, including production performance, metabolic responses, immune system responses, possible oxidative damage to lipids, proteins, and DNA and protein nitration, epigenetic changes, repair mechanisms conditioning the intestinal integrity of turkeys infected with C. perfringens bacteria, and selected metabolic indicators illustrating the degree of lipid, protein and DNA oxidation.

Apart from cognitive aspects, appreciated by reviewers appointed by editors of renowned worldwide scientific journals, the results obtained were useful for turkey compound feed manufacturers.

The overriding aim of the conducted research is the possibility of using the results from economic entities involved in the production of turkey feed. Implementation of the research results may significantly contribute to improving the rearing efficiency of turkeys for fattening and also reducing the number of antibiotics used in their treatment.

The distinction of the Committee for Animal Sciences and Aquaculture of the Polish Academy of Sciences was honored to the scientific achievement „Development of a standardized method for cryopreservation of fish semen”.

The authors of the work are scientists from the Department of Gamete and Embryo Biology of our Institute:

  • Prof. Andrzej Ciereszko, Ph.D;
  • Sylwia Judycka, Ph.D.;
  • Joanna Nynca, Ph.D;
  • Mariola Dietrich, Ph.D;
  • Daniel Żarski, Ph.D;
  • Ewa Liszewska, M.Sc.

The research concerns the development and improvement of procedures for the cryopreservation of semen from salmonid fish (rainbow trout, alpine pike, rainbow trout neo-spawning, and spring trout) and perch fish (perch and pike-perch). Establishing semen banks for these fish is an important element of the strategy to protect the biodiversity of local species, as well as providing an opportunity to secure semen from the most valuable individuals in terms of breeding.

The research project has developed a novel, standardized (in terms of a constant number of sperm in the straw and final concentration of cryoprotectants) methodology for cryopreservation of fish semen using a simple glucose-methanol diluent. The researchers confirmed that an appropriate cryopreservation protocol must be used for each of the species studied.

The results of the study were published in a series of papers published in prestigious international aquaculture journals and summarized in a review paper („Opportunities and challenges related to the implementation of sperm cryopreservation into breeding of salmonid fishes”) published in a special issue of Theriogenology on fish reproduction.

 

Czytaj więcej

Nagrody Komitetu Nauk Zootechnicznych i Akwakultury PAN

Dwa osiągnięcia naukowe interdyscyplinarnych zespołów badawczych z udziałem naukowców z Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Zrywności PAN w Olsztynie zostały uhonorowane przez Komitet Nauk Zootechnicznych i Akwakultury Polskiej Akademii Nauk – jedna nagrodą główną, a druga wyróżnieniem.

Nagroda Główna Komitetu Nauk Zootechnicznych i Akwakultury Polskiej Akademii Nauk została przyznana za osiągnięcie naukowe „Antyoksydacyjne i immunostymulujące oddziaływanie zróżnicowanych poziomów i wzajemnego stosunku lizyny, argininy i metioniny w mieszankach dla indyków rzeźnych”.

Autorami pracy są:

  • prof. dr hab. Dariusz Mikulski
  • prof. dr hab. Katarzyna Ognik
  • dr hab. Paweł Konieczka
  • dr hab. Magdalena Krauze, prof. uczelni
  • dr Anna Stępniowska
  • dr Ewelina Cholewińska
  • dr Bartłomiej Tykałowski
  • prof. dr hab. Zenon Zduńczyk
  • prof. dr hab. Jerzy Juśkiewicz

Celem badań uznanych przez Komitet PAN za wybitne i odznaczające się dużym potencjałem wdrożeniowym było ustalenie optymalnej relacji lizyny (Liz), argininy (Arg) i metioniny (Met) w dietach indyków rzeźnych z uwzględnieniem zróżnicowanej intensywności żywienia oraz wielokierunkowego oddziaływania metabolicznego analizowanych aminokwasów. Naukowcy uwzględnili szeroki zakres wskaźników, w tym wyniki produkcyjne, reakcje metaboliczne, reakcje układu odpornościowego, możliwe uszkodzenia oksydacyjne lipidów, białek i DNA oraz nitracyjne białek, zmiany epigenetyczne, mechanizmy naprawcze warunkujące integralność jelit indyków zakażonych bakteriami C. perfringens oraz wybrane wskaźniki metabolizmu ilustrujące stopień oksydacji lipidów, białek i DNA.

Poza aspektami poznawczymi, docenionymi przez recenzentów powołanych przez redakcje renomowanych czasopism naukowych o zasięgu światowym, uzyskano wyniki przydatne producentom mieszanek paszowych dla indyków.

Nadrzędnym celem przeprowadzonych badań jest możliwość wykorzystania wyników przez podmioty gospodarcze zajmujące się produkcją pasz dla indyków. Wdrożenie wyników badań może znacząco przyczynić się do poprawy efektywności odchowu indyków rzeźnych, także do zmniejszenia ilości stosowanych w ich leczeniu antybiotyków.

Z kolei Wyróżnieniem Komitetu Nauk Zootechnicznych i Akwakultury Polskiej Akademii Nauk zostało uhonorowane osiągnięcie naukowe „Opracowanie wystandaryzowanej metody kriokonserwacji nasienia ryb”.

Autorami pracy są naukowcy z Zespołu Biologii Gamet i Zarodka IRZiBŻ:

  • prof. dr hab. Andrzej Ciereszko
  • dr Sylwia Judycka
  • dr hab. Joanna Nynca
  • dr hab. Mariola Dietrich
  • dr hab. Daniel Żarski
  • mgr inż. Ewa Liszewska

Wyróżnione badania dotyczą opracowania i doskonalenia procedur kriokonserwacji nasienia ryb łososiowatych (pstrąga tęczowego, palii alpejskiej, neosamców pstrąga tęczowego oraz źródlanego) oraz okoniowatych (okonia i sandacza). Stworzenie banków nasienia dla tych ryb jest ważnym elementem strategii ochrony bioróżnorodności lokalnych gatunków, jak również daje możliwość zabezpieczenia nasienia pochodzącego od najcenniejszych pod względem hodowlanym osobników.

W ramach projektu badawczego została opracowana nowatorska, wystandaryzowana (pod względem stałej liczby plemników w słomce oraz końcowego stężenia krioprotektantów) metodyka kriokonserwacji nasienia ryb z zastosowaniem prostego rozrzedzalnika glukoza-metanol. Naukowcy potwierdzili, że dla każdego z badanych gatunków trzeba zastosować odpowiedni protokół kriokonserwacji.

Wyniki badań zostały opublikowane w szeregu artykułów opublikowanych w prestiżowych międzynarodowych czasopismach dotyczących akwakultury i podsumowane w pracy przeglądowej („Opportunities and challenges related to the implementation of sperm cryopreservation into breeding of salmonid fishes”) opublikowanej w specjalnym numerze Theriogenology poświęconym rozrodowi ryb.

Czytaj więcej

Licealiści poznali biologię molekularną w praktyce

Po dłuższej przerwie wynikającej z sytuacji epidemicznej i związanych z nią obostrzeń, drzwi Instytutu ponownie otworzyły się na gości. W laboratoriach pojawili się uczniowie, a wraz z nimi wiele pytań, na które z radością odpowiadali nasi naukowcy.

19 maja br. uczniowie pierwszej klasy XII Uniwersyteckiego Liceum Ogólnokształcącego im. Marii i Georga Dietrichów wraz z wychowawczynią Agnieszką Nowicką odwiedzili Zespół Biologii Gamet i Zarodka IRZiBŻ, gdzie mieli niepowtarzalną okazję samodzielnie przeprowadzić doświadczenia z wykorzystaniem technik biologii molekularnej.

Wspierani przez dr inż. Ilonę Kowalczyk-Ziębę oraz dr Dorotę Boruszewską licealiści wyizolowali RNA z tkanki zwierzęcej, a za pomocą elektroforezy – techniki wykorzystywanej do separacji związków chemicznych i biomolekuł – ocenili jego jakość. Następnie uczestniczyli w warsztatach technik in vitro, gdzie pod okiem prof. dr hab. Izabeli Wocławek-Potockiej i mgr Mileny Traut założyli hodowlę zarodków bydlęcych, a z pomocą dr Sylwii Judyckiej zbadali ruchliwość plemników z wykorzystaniem komputerowej analizy ruchu plemników (CASA).

Wycieczka do Instytutu jest okazją do poszerzenia wiedzy, ale także przyjrzenia się pracy naukowców z bliska. Praktyczny charakter zajęć cieszy się zawsze dużym zainteresowaniem uczniów.



 

Czytaj więcej

Top Scientists Ranking

Research.com, an academic platform for scientists, published ranking lists of leading researchers in a given scientific discipline in 2022. The list includes 166,880 scientists from around the world. Among them are professors Ryszard Amarowicz and Andrzej Ciereszko.

Research.com lists are created based on the data from the Microsoft Academic Graph and Google Scholar websites, taking into account three bibliometric indicators (Hirsch index, h; number of citations; number of publications) relating to individual scientific disciplines. The list covered the years 2014-2021.

In the discipline of chemistry, Prof. Ryszard Amarowicz, head of the Department of Chemical and Physical Properties of Food, was classified 12th in Poland. Prof. Amarowicz owns this success to h = 60, over 12,000 citations and 288 publications.

Ranking: https://research.com/scientists-rankings/chemistry/pl

In the discipline of biology and biochemistry, the 16th position in Poland was taken by Prof. Andrzej Ciereszko, head of the Department of Gamete and Embryo Biology. His high position in the ranking was guaranteed by h= 44, over 6,000 citations and 209 publications.

Ranking: https://research.com/scientists-rankings/biology-and-biochemistry/pl

It is also worth noticing that the bibliometric achievements of Prof. Carsten Carlberg, who joined the scientific staff of our Institute in March this year, would give him the no. 1 position in Poland in the field of genetics and molecular biology (h = 75, nearly 15,000 citations, 195 publications).

 

Czytaj więcej

Naukowcy Instytutu w światowym rankingu

Research.com, platforma akademicka dla naukowców, opublikowała listy rankingowe wiodących badaczek i badaczy w poszczególnych dyscyplinach naukowych w 2022 roku. Zestawienie objęło 166 880 naukowców z całego świata. Wśród nich są profesor Ryszard Amarowicz oraz profesor Andrzej Ciereszko.

Listy Research.com tworzone są w oparciu o dane pochodzące z serwisów Microsoft Academic Graph oraz Google Scholar przy uwzględnieniu trzech wskaźników bibliometrycznych (wskaźnik Hirscha, h; ilość cytowań; liczba publikacji) odnoszących się do poszczególnych dyscyplin naukowych. Zestawienie objęło lata 2014-2021.

W dziedzinie chemii, prof. Ryszard Amarowicz, kierownik Zespołu Chemicznych i Fizycznych Właściwości Żywności, został sklasyfikowany na 12. pozycji w Polsce. Ten sukces profesor Amarowicz osiągnął dzięki h=60, ponad 12 tyś. cytowań oraz 288 publikacji.

Ranking: https://research.com/scientists-rankings/chemistry/pl

W dyscyplinie biologii i biochemii na pozycji 16. w Polsce uplasował się prof. Andrzej Ciereszko, kierownik Zespołu Biologii Gamet i Zarodka. Wysoką pozycję w rankingu zagwarantował mu h=44, ponad 6 tyś. cytowań i 209 publikacji.

Ranking: https://research.com/scientists-rankings/biology-and-biochemistry/pl

Warto również odnotować, że osiągnięcia bibliometryczne prof. Carstena Carlberga, który dołączył do grona naukowców naszego Instytutu w marcu br., uplasowałyby go na 1. pozycji w Polsce w dziedzinie genetyki i biologii molekularnej (h=75, blisko 15 tyś. cytowań, 195 publikacji).

 

Czytaj więcej

Dr. Taisiia Yurchuk with NCN grant for Ukrainian Scientists

Dr. Taisiia Yurchuk from the Department of Team of Reproductive Pathology and Translational Medicine at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn has received funding for the implementation of research projects under the NCN program for Ukrainian scientists.

NCN for Ukrainian Scientists is a special NCN program aimed at Ukrainian scientists, regardless of citizenship, who took or will take refuge in Poland after the Russian aggression against Ukraine. It is led by the National Science Center (NCN).

What will Dr. Yurchuk do at the Institute?

Dr. Taisiia Yurchuk will be involved in the NCN OPUS project „Biological research and mathematical modeling to describe and predict new processes controlling development, function, and atresia of bovine ovarian follicles”.

Dr. Yurchuk’s work will include but is not limited to: performing cell isolations and cultures and performing analyses using molecular biology techniques. Dr. Yurchuk will focus on modeling the process of normal and disrupted ovulation in cattle. Her findings may be used to create similar models in other animals and humans.

Why is this understanding of these mechanisms so important? Ovulation is the process of releasing an oocyte from ovarian follicles. After ovulation, in the early luteal phase, fertilization of the oocyte by the sperm can occuŕ. The factors that regulate ovarian follicle development, ovulation processes and their disorders (e.g., the phenomenon of multiple ovulations in animals with single ovulation), and oocyte quality are still unexplained.

In animal breeding (especially cattle), twin pregnancies are difficult to obtain by selection because of the low heritability of this trait, the long intergenerational period, and the unfavorable correlation with milk yield. A factor that may play a role in the appearance of higher twin pregnancy rates is the insulin-like growth factor (IGF-1). It has been shown that IGF-I plays an important role in the reproduction of cows, influences fertility, at different regulatory levels of the hypothalamic-pituitary-ovarian axis, and may condition double ovulation resulting in twin pregnancies. However, no data are describing the mechanisms that lead to twin pregnancies/double ovulation. The NCN-funded research will help change this.

The experiments will determine the effects of IGF-1 on the growth and function of ovarian follicle granular layer cells in vitro. In addition, genes and proteins involved in the process of necroptosis, one type of cell death, will be traced. In addition, the expression of non-coding RNAs, the so-called miRNAs, will be investigated to find new markers of follicle quality and indicators of double ovulation. The results obtained will be used to explain the occurrence of double ovulation and twin pregnancy cases in cattle breeding. In addition, in vitro experiments will be confirmed under in vivo conditions to compare the results obtained. The obtained results will be used to create a planned mathematical model of the above-described processes occurring in the ovary, especially the process of double ovulation.

A long way to Olsztyn

Dr. Taisiia Yurchuk became one of the first beneficiaries of the program to support scientists from Ukraine and received a 3-month scholarship from the Polish Academy of Sciences. On March 14, 2022, she started work at the Department of Immunology and Reproductive Pathology.

Dr. Taisiia Yurchuk, along with a group of scientists, doctors, and patients, sheltered for over a week in the basement of an infertility clinic and maternity hospital in Kharkiv, which was bombed by Russian aggressors. She finally managed to escape from Kharkiv and after more than a week’s journey across Ukraine she finally arrived in Olsztyn.

Dr. Yurchuk has previously worked at the Institute of Problems of Cryobiology and Cryomedicine in Kharkiv. Her scientific specialties are gamete biology, embryology, cell biology, and 3D cell culture systems. Dr. Yurchuk has been in contact with the Institute for several years. She has presented papers at scientific conferences organized by the Institute: including Biodiversity, and recently gave a lecture at the conference Development of Scientific Cooperation in Reproductive Medicine Research VIII, organized by the Department of Biology and Pathology of Human Reproduction in October 2021 in Wroclaw. Dr. Yurchuk participated in the 5th edition of the Symposium „Perspectives in Biodiversity Conservation” organized by the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences. She is a member of the Reproduction Committee.

 

Czytaj więcej