Projekt Moms in Charge, czyli kiedy doświadczenia matki wpływają na dziecko

Czy matka może przekazać dziecku informacje o przebytych chorobach lub naturalnych drapieżnikach? Projekt Moms in Charge, realizowany przez naukowców z naszego Instytutu, ma na celu zbadanie, w jakim stopniu czynniki niegenetycznego dziedziczenia wpływają na zdolności adaptacyjne potomstwa. Wiedza ta może przydać się do ulepszenia hodowli ryb, ale także głębszego poznania rybiej odporności.

Moms in Charge to projekt który realizuje dr Taina Rocha de Almeida, laureatka konkursu stypendialnego PASIFIC zarządzanego przez Polską Akademię Nauk i współfinansowanego ze środków Programu H2020 „Marie Skłodowska-Curie Actions Co-funding of regional, national and international programmes” i Ministerstwa Edukacji i Nauki. Jej opiekunem naukowym jest dr hab. Daniel Żarski z Zespołu Biologii Gamet i Zarodka Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie.

Celem projektu jest monitorowanie tzw. czynników niegenetycznego dziedziczenia u ryb i określenie, w jakim stopniu wpływają one na zdolności adaptacyjne potomstwa (od zarodka po stadia młodociane) do warunków hodowlanych. Badania zostaną przeprowadzone na trzech polskich liniach hodowlanych pstrąga tęczowego z największej w Polsce wylęgarni ryb „Dąbie”.

  • Nasz projekt nazywa się Moms in Charge, czyli w wolnym tłumaczeniu „matki rządzą”, bo skupia się na roli matek w życiu młodych ryb. Zgodnie z głównym założeniem projektu, doświadczenie matki jest przekazywane potomstwu za pomocą molekuł (w naszym przypadku RNA), które samica wbudowuje w ikrę w trakcie procesu jej formowania. Chcemy sprawdzić, przed czym w ten sposób matka może ochronić swoje dzieci – mówi dr Taina Rocha de Almeida.

Czym są niegenetyczne czynniki dziedziczenia?

Dziedziczenie niegenetyczne (NGI) obejmuje różne mechanizmy, które nie są bezpośrednio związane z genami, ale oddziałują na niego lub z niego wynikają. Zawartość komórki jajowej jest konsekwencją mechanizmów NGI, które będą odgrywały istotną rolę w rozwoju zarodka i wczesnym rozwoju larwy. Są źródłem transkryptów, białek i składników odżywczych, które będą kierować i wspierać rozwój nawet w późniejszych stadiach rozwojowych.

– Ryba akumuluje „ważne” doświadczenia ze swojego życia. Wiadomo, że u ryb dotyczy to najczęściej przebytych chorób lub preferencji termicznych, które warunkują profil specyficznych cząsteczek informacyjnych – białek lub RNA – które wbudowuje w ikrę – mówi dr hab. Daniel Żarski z Zespołu Biologii Gamet i Zarodka.

Projekt Moms in Charge ma zbadać, w jakim stopniu matczyne czynniki NGI (mRNA, miRNA lub białka) wpływają na wydajność potomstwa od zarodków do młodych osobników.

  • Chcemy sprawdzić profil molekularny ikry z trzech różnych linii hodowlanych pstrąga tęczowego, pochodzących z wylęgarni „Dąbie”, koło Bytowa. Chcemy przeprowadzić badania na poziomie molekularnym, ale i osobniczym. Wyniki mogą być wykorzystane w przyszłości w hodowlach różnych ryb, dzięki czemu będziemy w stanie uzyskać lepsze osobniki, obdarzone ważnymi dla hodowców cechami – dodaje dr Taina Rocha de Almeida.

Badania będą prowadzone na trzech szczepach pstrąga tęczowego (różniących się fenotypowo) hodowanych w Polsce. Ponieważ projekt będzie realizowany we współpracy z hodowlą ryb, w dłuższej perspektywie będzie miał wpływ na zarządzanie rybami i selekcję opartą na wydajności potomstwa, co może pomóc w zwiększeniu produkcji ryb.

  • Podobny proces zachodzi także na linii ojciec-potomstwo, ale nie zamierzamy go na tym etapie sprawdzać, gdyż mechanizm przekazywania tych informacji jest nieco inny. Na chwilę obecną skupiamy się na ikrze – komórki jajowe są większe, zawierają więcej molekuł i ich wpływ na rozwój potomstwa u ryb jest znacznie większy, aniżeli plemników. W tej kwestii, wpływ matki na potomstwo jest większy niż w przypadku ojca. Jesteśmy też ograniczeni czasowo, bo projekt potrwa zaledwie 2 lata – wyjaśnia dr Taina Rocha de Almeida.

Dlaczego pstrąg tęczowy?

Pstrąg tęczowy (Oncorhynchus mykiss), wywodzący się z Północnej Ameryki, jest najpowszechniejszym gatunkiem pstrąga hodowanym w akwakulturze słodkowodnej w Europie. Preferuje wartko płynące wody z dość stabilnymi warunkami termicznymi, tolerujący wysokie zagęszczenia. Optymalna temperatura wzrostu dla hodowli to 8-18°C, z maksimum wynoszącym 20°C.

Pstrąg tęczowy jest sprzedawany jako ryba porcyjna, ale również jako duża ryba zwana także pstrągiem łososiowym. Sektor pstrąga tęczowego boryka się ze specyficznymi problemami, które przyczyniają się do stagnacji produkcji na przestrzeni lat. W tym kontekście, specyficzny i skuteczny program selektywnej hodowli mógłby być bardzo pomocny.

  • Istnieje duża potrzeba usprawnienia protokołów hodowlanych, np. ze względu na zwiększoną odporność na choroby czy lepszą żywotność. W długiej perspektywie, wpływ badań na branżę rybacką może być ogromny – mówi dr hab. Daniel Żarski.

Dr Taina Rocha de Almeida przyjechała do Instytutu z Brazylii i otrzymała prestiżowe stypendium programu PASIFIC MSCA COFUND. Konkurencja była duża – na jedno miejsce kandydowało około 10 osób. Aby wybrać zwycięskie wnioski, eksperci dokonywali oceny w trzech głównych kategoriach – doskonałość, wpływ oraz wykonalność. Każdy projekt musiał również przejść przez ocenę etyczną. Stypendium potrwa 24 miesiące, ale jak sama dr de Almeida przyznaje: „w Polsce czuje się bardzo dobrze”, więc trzymamy kciuki, by pobyt w naszym kraju się wydłużył.

 

Czytaj więcej

EIT Food InformPack na ScienceCom w Gdyni

​

Już 18 listopada spotkacie naszych naukowców na #ScienceCom, cyklicznej imprezie łączącej świat nauki ze społeczeństwem, którą organizuje Centrum Nauki Experyment w Gdyni.

Tegoroczna edycja jest poświęcona tematom zrównoważonego rozwoju miast i społeczeństwa oraz odpowiedzialnej konsumpcji i produkcji.

Badacze z naszego Instytutu, dr Joanna Fotschki, dr Marta Kopcewicz i mgr Marzena Lenkiewicz w ramach projektu EIT Food InformPack przygotują warsztaty na temat racjonalnego podejścia do zakupów, gospodarowania i utylizacji opakowań po żywności. Dowiemy się jak my, konsumenci, możemy dać im drugie życie i przyczynić się do budowania gospodarki obiegu zamkniętego.

Szczegóły na stronie wydarzenia.

Czytaj więcej

Konkurs na stanowisko stypendysty w projekcie NCN SONATA 17

Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk w Olsztynie ogłasza konkurs na:

  • stanowisko stypendysty w projekcie badawczym (1 lub 2 stypendia)

finansowanym w ramach konkursu NCN SONATA 17 pt. „Rola lipidów matrycy mleka w programowaniu immunoreaktywności białek pochodzących z bakterii kwasu mlekowego” realizowanego w Zespole Immunologii i Mikrobiologii Żywności pod kierunkiem dr Anny Marii Ogrodowczyk.

Stypendysta będzie uczestniczył w następujących zadaniach badawczych:

  • optymalizacja warunków hodowli bakterii z rodzaju Lactobacillus w podłożu z dodatkiem lipidów,
  • izolacja białek bakteryjnych i ocena ich profilu jakościowego oraz ilościowego,
  • ocena immunoreaktywności białek bakteryjnych stosując surowicę ludzką,
  • ocena in vitro właściwości immunoreaktywnych/immunomodulujących białek bakteryjnych z wykorzystaniem linii komórkowych nabłonka jelitowego oraz ex vivo z wykorzystaniem limfocytów izolowanych od zwierząt modelowych,
  • czynny udział w konferencjach naukowych,
  • udział w przygotowaniu manuskryptów publikacji naukowych.

Wymagania stawiane kandydatowi:

  1. W chwili rozpoczęcia realizacji zadań w projekcie Kandydat powinien spełniać którekolwiek z poniższych kryteriów kwalifikujących:
    • Kandydat jest studentem studiów: pierwszego stopnia, drugiego stopnia lub jednolitych studiów magisterskich na kierunku: biologia, biotechnologia, mikrobiologia, technologia żywności lub pokrewne, realizowanych w uczelniach na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej,
    • Kandydat jest uczestnikiem studiów doktoranckich,
    • Kandydat jest doktorantem w szkole doktorskiej;
  2. Podstawowa wiedza z zakresu biologii, biotechnologii lub mikrobiologii;
  3. Entuzjazm badawczy, cierpliwość i silna motywacja do pracy;
  4. Praktyczne umiejętności laboratoryjne;
  5. Umiejętność pracy indywidualnej jak i w zespole;
  6. Dobra organizacja czasu;
  7. Dyspozycyjność;
  8. Znajomość języka angielskiego na poziomie umożliwiającym komunikowanie się oraz korzystanie z literatury naukowej.

Konkurs zostanie przeprowadzony zgodnie z zasadami przedstawionymi w Regulaminie przyznawania stypendiów naukowych w projektach badawczych finansowanych ze środków Narodowego Centrum Nauki, będącym załącznikiem do uchwały Rady NCN nr 25/2019 z dnia 14 marca 2019 r.

Informacje dodatkowe:

  • Umowa stypendialna na okres min. 6 miesięcy,
  • Stypendium naukowe w wysokości 2 000 – 4 000 zł/miesiąc w zależności od zakresu zadań realizowanych w projekcie,
  • Data rozpoczęcia: styczeń 2023 roku,
  • Miejsce realizacji projektu: Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk, Zespół Immunologii i Mikrobiologii Żywności, ul. Tuwima 10, 10-748 Olsztyn.

Osoby zainteresowane proszone są o przesłanie następujących dokumentów:

  1. List motywacyjny;
  2. Życiorys (CV) (zawierający dorobek naukowy, w tym publikacje, informacje o wyróżnieniach wynikających z prowadzenia badań naukowych, np. stypendia, nagrody, doświadczenie naukowe zdobyte poza jednostką macierzystą, udział w warsztatach, szkoleniach naukowych, realizacji projektów naukowych);
  3. W przypadku aplikantów będących studentami – wykaz ocen ze studiów I stopnia lub wykaz ocen z pierwszego roku studiów II stopnia (jeśli aplikant jest na drugim roku studiów II stopnia);
  4. Zaświadczenie z uczelni potwierdzające obecny status studenta (kierunek studiów, stopień studiów, rok studiów) lub doktoranta (nazwa studiów doktoranckich/szkoły doktorskiej, rok);
  5. Opinia opiekuna naukowego (np. opiekuna stażu/promotora pracy dyplomowej) poświadczająca posiadanie umiejętności, kompetencji do realizacji zadań w projekcie;
  6. Inne dokumenty, które wg Kandydata są istotne przy rozpatrzeniu jego Kandydatury.

Zgłoszenia/dokumenty w formacie PDF proszę przesłać pocztą elektroniczną na adres: a.ogrodowczyk@pan.olsztyn.pl do dnia 2 grudnia 2022 roku, do godziny 15.00. W tytule wiadomości należy wpisać „Konkurs na stanowisko stypendysty SONATA”. Rozstrzygnięcie konkursu nastąpi w terminie do 9 grudnia 2022 roku. Instytut zastrzega sobie prawo do skontaktowania się z wybranymi kandydatami.

W CV prosimy o umieszczenie klauzuli zgody na przetwarzanie danych osobowych w procesie rekrutacji:

„Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych zawartych w dokumentach aplikacyjnych przez Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie z siedzibą 10-748 Olsztyn ul. Tuwima 10, w celu realizacji procesu rekrutacji wraz z publikacją na stronie internetowej Instytutu pełnych wyników konkursu”.

Klauzula informacyjna:

  1. Administratorem danych osobowych przetwarzanych w ramach procesu rekrutacji jest Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie z siedzibą 10-748 Olsztyn ul. Tuwima 10, tel. 89 523 46 86,
    e-mail: instytut@pan.olsztyn.pl.
  2. Kontakt z inspektorem ochrony danych osobowych jest możliwy pod w/w adresem.
  3. Podane dane osobowe przetwarzane będą w celu realizacji obecnego procesu rekrutacji i przechowywane do czasu jego zakończenia na podstawie wyrażonej zgody (zgodnie z art. 6 ust. 1 lit. a RODO).
  4. Osobie której dane dotyczą przysługuje prawo do cofnięcia zgody w dowolnym momencie bez wpływu na zgodność z prawem przetwarzania, którego dokonano na podstawie zgody przed jej cofnięciem.
  5. Osobie, której dane dotyczą przysługuje prawo dostępu do swoich danych osobowych, żądania ich sprostowania lub usunięcia. Wniesienie żądania usunięcia danych jest równoznaczne z rezygnacją z udziału w procesie niniejszej rekrutacji. Ponadto przysługuje jej prawo do żądania ograniczenia przetwarzania w przypadkach określonych w art. 18 RODO.
  6. Osobie, której dane dotyczą, przysługuje prawo do wniesienia skargi do prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych na niezgodne z prawem przetwarzanie jej danych osobowych. Organ ten będzie właściwy do rozpatrzenia skargi z tym, że prawo wniesienia skargi dotyczy wyłącznie zgodności z prawem przetwarzania danych osobowych, nie dotyczy zaś przebiegu rekrutacji.
  7. Dane udostępnione nie będą podlegały profilowaniu ani udostępnieniu podmiotom czy państwom trzecim. Odbiorcami danych mogą być instytucje upoważnione z mocy prawa.
  8. Podanie danych zawartych w dokumentach rekrutacyjnych nie jest obowiązkowe, jednak jest warunkiem koniecznym do udziału w procesie rekrutacji.

Pytania w sprawie konkursu proszę kierować na adres kierownika projektu dr Anna Maria Ogrodowczyk a.ogrodowczyk@pan.olsztyn.pl lub kontaktować się telefonicznie +48 89 523 46 57.

 

Czytaj więcej

Ewa Wasilewska Ph.D. with a prestigious award

Ewa Wasilewska, Ph.D. from the Department of Food Immunology and Microbiology at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences, has received the prestigious JDS Highly Cited Award from American Dairy Science Association (ADSA).

The ADSA is an international organization of lecturers, scientists, and business representatives involved in developing the dairy industry. Members of ADSA has discovered methods and technologies that have revolutionized the dairy industry.

An official journal of ADSA, Journal of Dairy Science, is the leading general dairy research journal in the world. Highly Cited Award program was established to formally recognize JDS authors whose efforts significantly impact research and the dairy industry.

The JDS Highly Cited Award 2022 was awarded to Ewa Wasilewska and co-authors (Dagmara Zlotkowska and Barbara Wróblewska) for their paper entitled „Yogurt starter cultures of Streptococcus thermophilus and Lactobacillus bulgaricus ameliorate symptoms and modulate the immune response in a mouse model of dextran sulfate sodium-induced colitis,” published in 2019.

The number of citations of the published study is an excellent indicator of its importance to the scientific community. Moreover, the highlighted work has been linked to the UN Sustainable Development Goals, which can help address major global threats.

Czytaj więcej

Dr inż. Ewa Wasilewska z prestiżową nagrodą

Dr inż. Ewa Wasilewska z Zespołu Immunologii i Mikrobiologii Żywności Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN otrzymała prestiżową nagrodę JDS Highly Cited Award przyznawaną przez American Dairy Science Association (ADSA).

ADSA to międzynarodowa organizacja zrzeszająca wykładowców, naukowców i przedstawicieli biznesowych, zaangażowanych w rozwój przemysłu mleczarskiego. Członkowie ADSA opracowali metody i technologie, które zrewolucjonizowały przemysł mleczarski.

Oficjalne czasopismo ADSA, Journal of Dairy Science (JDS), jest wiodącym czasopismem o tematyce mleczarskiej na świecie. W celu formalnego wyróżnienia autorów JDS, których działania znacząco wpływają na badania i przemysł mleczarski, ustanowiono program JDS Highly Cited Award.

Nagroda JDS Highly Cited Award 2022 została przyznana Ewie Wasilewskiej i współautorom (Dagmarze Złotkowskiej i Barbarze Wróblewskiej) za pracę zatytułowaną „Yogurt starter cultures of Streptococcus thermophilus and Lactobacillus bulgaricus ameliorate symptoms and modulate the immune response in a mouse model of dextran sulfate sodium-induced colitis”, opublikowaną w 2019.

Liczba cytowań opublikowanego badania stanowi idealny wyznacznik jego znaczenia dla społeczności naukowej. Co więcej, wyróżniona praca została powiązana z celami zrównoważonego rozwoju ONZ, które mogą być pomocne w rozwiązywaniu największych globalnych zagrożeń.

Czytaj więcej

Nabór uzupełniający na projekt z zakresu prac przedwdrożeniowych

Informujemy, że w związku z niewykorzystaniem pełnej kwoty środków na wewnętrzne projekty z zakresu prac przedwdrożeniowych w ramach projektu „Inkubator Innowacyjności 4.0” do rozdysponowania jest kwota 35 700 zł na jeden projekt.

Prace badawcze mogą być realizowane do 31.03.2023 r. według zasad przewidzianych Regulaminem projektu.

Nabór wniosków trwa od daty ogłoszenia do 30.11.2022 do godziny 14.00.

Program „Inkubator Innowacyjności 4.0” został ustanowiony przez MNISW, finansowany jest ze środków europejskich w ramach projektu „Wsparcie zarządzania badaniami naukowymi i komercjalizacja wyników prac B+R w jednostkach naukowych i przedsiębiorstwach” w ramach Programu Operacyjnego Inteligentny Rozwój 2014-2020 (Działanie 4.4).

Celem projektów jest zwiększenie szans na rynkową komercjalizację wyników prac badawczych poprzez dofinansowanie prac przedwdrożeniowych, w tym dodatkowych testów laboratoryjnych lub dostosowania wynalazku do potrzeb zainteresowanego nabywcy.

Wnioski będzie oceniał Komitet Inwestycyjny złożony z niezależnych ekspertów w tym naukowców, przedstawicieli biznesu i Venture Capital.

Szczegóły w zakładce projektu.

FE logo
RP logo
UE logo

 

Czytaj więcej

AQUAENT – akwakultura w dobie globalnych wyzwań

AQUAENT – akwakultura w dobie globalnych wyzwań – pod takim tytułem 12 października w Gdyni odbyły się warsztaty zorganizowane przez naszych naukowców w ramach projektu EIT Food AQUAENT- Support for small and medium enterprises in RIS regions in aquaculture.

Tematyka warsztatów poruszała najbardziej aktualne zagadnienia związane ze zrównoważoną hodowlą organizmów wodnych. Konrad Ocalewicz z Uniwersytetu Gdańskiego przedstawił omówił temat genetycznego zanieczyszczenia środowiska i biotechnologicznych metod ochrony pul genowych dziko-żyjących ryb. Ziemowit Pirtań z Gospodarstwa rybackiego Pstrąg-Tarnowo przedstawił aspekty dotyczące  energii odnawialnej oraz możliwości magazynowania energii w akwakulturze – futurologia czy też działania niezbędne dla przetrwania branży w dobie kryzysu energetycznego?

Z kolei Radosław Kowalski z Zespołu Biologii Gamet i Zarodka IRZiBŻ PAN skupił się na zagadnieniu akwakultury multitroficznej i związanej z tym możliwości intensyfikacji produkcji w wodach słodkich i słonych. Tomasz Kolankowski z KOL-tech Solutions omówił możliwości monitoringu jakości wody wlotowej w gospodarstwach rybackich, które zabezpieczają hodowlę przed katastrofami ekologicznymi. Wśród prelegentów znaleźli się również naukowcy i eksperci z Islandii, m.in. z instytutu badawczego Matis. Hildur Inga Sveinsdottir poruszyła temat wykorzystania enzymów i białek w odpadach rybnych do tworzenia innowacyjnych produktów leczniczych i suplementów diety. Z kolei Saemundur Eliasson przedstawił możliwości wykorzystania energii geotermalnej w rybołówstwie i akwakulturze.

Każdej prezentacji towarzyszyła dyskusja z uczestnikami.

Dziękując ekspertom i uczestnikom za zaangażowanie już teraz zapraszamy na kolejne szkolenie, które odbędzie się 17 listopada w formie online (w języku angielskim). Poruszymy na nim tematy omawiane na szkoleniu 12 października, ale poznamy również założenia innowacyjnego projektu Salmocross i jego możliwości wdrożenia do akwakultury, który przedstawi Martyna Sas z Gospodarstwa rybackiego Pstrąg Tarnowo. Link do rejestracji.

Program warsztatów 17 listopada 2022

10.00 – 10.10 Welcoming the participants, Marek Bogacki, Institute of Animal Reproduction and Food Research, Polish Academy of Sciences, Olsztyn, Poland

10.10 – 10.50 Renewable energy and the potential of energy storage in aquaculture – futurology or activities necessary for the survival of the industry in times of energy crisis? Ziemowit Pirtań, The fishing farm „PSTRĄG TARNOWO”, Tarnowo, Poland

10.50 – 11.30 Salmocross – an innovative research and implementation project in aquaculture. Martyna Sas The fishing farm „PSTRĄG TARNOWO”, Tarnowo, Poland

11.30 – 12.10 Multitrophic aquaculture – possibilities of intensifying production in fresh and salt waters. Radosław Kowalski, Institute of Animal Reproduction and Food Research, Polish Academy of Sciences, Olsztyn, Poland

12.10 – 12.50 Genetic pollution of the environment and biotechnological methods of protecting gene pools of wild-living fish. Konrad Ocalewicz, University of Gdańsk, Gdańsk, Poland

12.50 – 13.30 The use of enzymes and proteins in fish waste to create innovative medical products and dietary supplements. Margret Geirsdottir, Lysi-Life, Zymtech Enzymatica Aktieägare, Icelandic Food and Biotech R&D, Reykjavík, Iceland

13.30 – 14.10 The use of geothermal energy in fisheries and aquaculture. Saemundur Eliasson, HS Orka and Haustak, Icelandic Food and Biotech R&D, Reykjavík, Iceland

 

Czytaj więcej

Job title: Bioinformatician-data analyst

Institute of Animal Reproduction and Food Research of Polish Academy of Sciences (IARFR PAS) is looking for a Bioinformatician- data analyst to join Molecular Biology Laboratory (Core Facility).

Institution:

IARFR PAS is located in Olsztyn and is one of the top ranked Polish research institutes that performs interdisciplinary research in agricultural and biological sciences, booth basic and applied (https://pan.olsztyn.pl/projects). The Institute is equipped with state-of-the-art technology, has excellent core facilities and supportive administration. IARFR PAS provides stimulating scientific environment, especially due to its cooperative, multidisciplinary character (https://pan.olsztyn.pl/research-dissemination). Collaboration and exchange of knowledge and techniques between scientists from different disciplines is common and encouraged.

Bioinformatician- data analyst will join Molecular Biology Laboratory (Core Facility), which is focused on the assistance in molecular biology experimental approaches at both Divisions – Reproductive Biology and Food Science (https://pan.olsztyn.pl/institute/general-information/structure).

City:

Olsztyn would be a good choice for living and working if you appreciate close contact with nature and quiet life. Within the administrative bounds of the city you will find more than 10 lakes with a very well-developed tourist and sport infrastructure, as well as leisure facilities. Each year the calendar is filled with a number of cultural and sports events (more @ Wikipedia).

Responsibilities:

  • bioinformatics and analytical support of high-throughput molecular biology methods;
  • organization, maintenance and development of IT infrastructure – Unix environment;
  • active and constructive participation in research projects carried out at the Institute;
  • visualization and presentation of the results of bioinformatics analyzes;
  • preparation of the results and materials for scientific publications.

Requirements:

  • M.Sc. degree in mathematics, bioinformatics, IT or biology;
  • knowledge of bioinformatics and statistics;
  • interest in self-development in bioinformatics/systems biology/functional genomics;
  • good knowledge of scripting languages, i.e., R, Python;
  • good knowledge of English (minimum B1/B2 level);
  • previous experience in next-generation sequencing data analysis will be advantageous.

Expectations:

  • goal orientation;
  • ability to work individually and in a team;
  • communicativeness and open-mindedness;
  • independence in acquiring knowledge and willingness to share it;
  • ability to solve problems.

We offer:

  • a contract of employment;
  • salary dependent on the experience and skills;
  • the opportunity to work on the interesting research topics (e.g., regulation of gene expression, epigenetics, analysis of RNA/DNA structures, microRNAs);
  • the opportunity to work in the interdisciplinary team;
  • professional development and improvement of qualifications;
  • a stable work environment.

Required documents:

  • CV, cover letter with a list of scientific achievements, completed projects, publications.

Recruitment process:

  • sending the required documents, evaluation of the submitted documentation, interview with selected candidates, employment decision;
  • interviews will be held in Polish and English.

Deadline for applications: December 3, 2022 (The Institute reserves the right to extend the deadline for submitting competition documents if there are no candidates who meet the above-mentioned requirements)

Interested candidates are kindly asked to contact prof. Monika M. Kaczmarek by e-mail: m.kaczmarek@pan.olsztyn.pl (postscript/e-mail title: recruitment_bioinformatician) and provide requested documents.

In your CV, please include a consent clause for the processing of personal data in the recruitment process:

„I consent to the processing of my personal data contained in the application documents by the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn, 10-748 Olsztyn, ul. Tuwima 10, in order to carry out the recruitment process and publishing the full results of the competition on the Institute’s website.”

Information clause:

  1. The administrator of personal data processed as part of the recruitment process is the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn, 10-748 Olsztyn, ul. Tuwima 10, phone no. 89 523 46 86, e-mail: instytut@pan.olsztyn.pl.
  2. Contact with the personal data protection officer is possible at the above-mentioned address.
  3. The provided personal data will be processed in order to carry out the current recruitment process and kept until its completion on the basis of expressed consent (in accordance with Article 6 (1) (a) of the GDPR).
  4. You have the right to withdraw consent at any time without affecting the lawfulness of the processing which was carried out on the basis of consent before its withdrawal.
  5. You have the right to access your personal data, request their rectification or removal. Submitting a request to delete data is tantamount to resignation from participation in the recruitment process. In addition, you have the right to request the restriction of processing in the cases specified in art. 18 GDPR.
  6. You have the right to lodge a complaint with the President of the Personal Data Protection Office against the unlawful processing of his personal data. This authority will be competent to consider the complaint, provided that the right to file a complaint concerns only the lawfulness of the processing of personal data, and not the recruitment process.
  7. Your data will not be profiled or made available to entities or third countries. The recipients of the data may be institutions authorized by law.
  8. Providing your personal data is not obligatory, but it is a necessary condition to participate in the recruitment process.

 

Czytaj więcej

Ogłoszenie o rekrutacji: bioinformatyk-analityk danych

Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności Polskiej Akademii Nauk (IRZBŻ PAN) w Olsztynie zatrudni bioinformatyka-analityka danych w Laboratorium Biologii Molekularnej.

Instytut:

IRZBŻ PAN w Olsztynie jest jednym z czołowych polskich instytutów badawczych kategorii A/A+, który prowadzi interdyscyplinarne badania w dziedzinie nauk rolniczych i biologicznych, zarówno o charakterze podstawowym, jak i stosowanym (https://pan.olsztyn.pl/granty). Instytut posiada najnowocześniejszą infrastrukturę naukowo-badawczą i ma doskonałe zaplecze administracyjne. IRZBŻ PAN zapewnia pracę w stymulującym środowisku naukowym, kładąc nacisk na wzajemną współpracę oraz przekraczanie granic poszczególnych dyscyplin (https://pan.olsztyn.pl/dzialalnosc-naukowa). Współpraca, wymiana wiedzy między naukowcami z różnych dyscyplin jest powszechna i doceniana.

Bioinformatyk, analityk danych dołączy do zespołu Laboratorium Biologii Molekularnej, który zajmuje się wsparciem badań z zakresu biologii molekularnej zarówno w oddziale Biologii Rozrodu Zwierząt, jak i Oddziale Nauk o Żywności (https://pan.olsztyn.pl/instytut/informacje-ogolne/struktura).

Miasto:

Olsztyn to świetne miejsce pracy, jeśli cenisz sobie bliski kontakt z naturą i spokojne życie. W granicach administracyjnych miasta znajduje się ponad 10 jezior, bardzo dobrze rozwinięta infrastruktura turystyczna i sportowa, a także zaplecze rekreacyjne. W kalendarzu nie brakuje również wydarzeń kulturalnych i sportowych (więcej na: Wikipedia).

Zakres obowiązków:

  • wsparcie bioinformatyczne, analityczne wysokoprzepustowych metod biologii molekularnych;
  • organizacja, utrzymywanie i rozwijanie infrastruktury informatycznej w środowisku Unix;
  • aktywny i konstruktywny udział w projektach badawczych realizowanych w Instytucie;
  • wizualizacja oraz prezentacja wyników analiz bioinformatycznych;
  • przygotowywanie wyników i materiału do publikacji naukowych.

Wymagania:

  • wykształcenie minimum wyższe matematyczne, bioinformatyczne, informatyczne lub biologiczne;
  • znajomość zagadnień bioinformatyki i statystyki;
  • zainteresowanie rozwojem w kierunku bioinformatyka/biologia systemowa/genomika funkcjonalna;
  • dobra znajomość języków skryptowych, tj.: R, Python;
  • dobra znajomość j. angielskiego (minimum poziom B1/B2);
  • dodatkowym atutem będzie doświadczenie w analizie danych sekwencjonowania nowej generacji.

Oczekiwania:

  • zorientowanie na cel;
  • umiejętność pracy indywidualnej i zespołowej;
  • komunikatywność i otwartość;
  • samodzielność w zdobywaniu wiedzy i zdolność do dzielenia się nią;
  • umiejętność rozwiązywania problemów.

Oferujemy:

  • zatrudnienie w oparciu o umowę o pracę;
  • wynagrodzenie uzależnione od doświadczenia i posiadanych umiejętności;
  • możliwość pracy nad ciekawą tematyką badawczą (np. regulacja ekspresji genów, epigenetyka, analiza struktur RNA/DNA, mikroRNA);
  • możliwość pracy w zespołach interdyscyplinarnych;
  • możliwość rozwoju zawodowego i podnoszenia kwalifikacji, w tym staże zagraniczne;
  • stabilne środowisko pracy.

Wymagane dokumenty:

  • CV, list motywacyjny wraz listą dokonań naukowych, zrealizowanych projektów, publikacji.

Jak wygląda proces rekrutacji:

  • wysłanie wymaganych dokumentów, ocena przesłanej dokumentacji, rozmowa kwalifikacyjna z wybranymi kandydatami, decyzja o zatrudnieniu;
  • rozmowy kwalifikacyjne odbędą się w języku polskim i angielskim.

Termin składania aplikacji: do dnia 3 grudnia br. (Instytut zastrzega sobie prawo do wydłużenia terminu składania dokumentów konkursowych w przypadku braku kandydatów spełniających w/w wymagania).

Dokumenty należy przesłać pocztą elektroniczną na adres m.kaczmarek@pan.olsztyn.pl z dopiskiem rekrutacja_bioinformatyk.

W CV prosimy o umieszczenie klauzuli zgody na przetwarzanie danych osobowych w procesie rekrutacji:

„Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych zawartych w dokumentach aplikacyjnych przez Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie z siedzibą 10-748 Olsztyn ul. Tuwima 10, w celu realizacji procesu rekrutacji wraz z publikacją na stronie internetowej Instytutu pełnych wyników konkursu”.

Klauzula informacyjna:

  1. Administratorem danych osobowych przetwarzanych w ramach procesu rekrutacji jest Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie z siedzibą 10-748 Olsztyn ul. Tuwima 10, tel. 89 523 46 86, e-mail: instytut@pan.olsztyn.pl.
  2. Kontakt z inspektorem ochrony danych osobowych jest możliwy pod w/w adresem.
  3. Podane dane osobowe przetwarzane będą w celu realizacji obecnego procesu rekrutacji i przechowywane do czasu jego zakończenia na podstawie wyrażonej zgody (zgodnie z art. 6 ust. 1 lit. a RODO).
  4. Osobie której dane dotyczą przysługuje prawo do cofnięcia zgody w dowolnym momencie bez wpływu na zgodność z prawem przetwarzania, którego dokonano na podstawie zgody przed jej cofnięciem.
  5. Osobie, której dane dotyczą przysługuje prawo dostępu do swoich danych osobowych, żądania ich sprostowania lub usunięcia. Wniesienie żądania usunięcia danych jest równoznaczne z rezygnacją z udziału w procesie niniejszej rekrutacji. Ponadto przysługuje jej prawo do żądania ograniczenia przetwarzania w przypadkach określonych w art. 18 RODO.
  6. Osobie, której dane dotyczą, przysługuje prawo do wniesienia skargi do prezesa Urzędu Ochrony Danych Osobowych na niezgodne z prawem przetwarzanie jej danych osobowych. Organ ten będzie właściwy do rozpatrzenia skargi z tym, że prawo wniesienia skargi dotyczy wyłącznie zgodności z prawem przetwarzania danych osobowych, nie dotyczy zaś przebiegu rekrutacji.
  7. Dane udostępnione nie będą podlegały profilowaniu ani udostępnieniu podmiotom czy państwom trzecim. Odbiorcami danych mogą być instytucje upoważnione z mocy prawa.
  8. Podanie danych zawartych w dokumentach rekrutacyjnych nie jest obowiązkowe, jednak jest warunkiem koniecznym do udziału w procesie rekrutacji.

 

Czytaj więcej

The success of our staff at the 3rd International Conference on Tissue Repair, Regeneration, and Fibrosis

Dr. Marta Kopcewicz and Dr. Joanna Wiśniewska from the Regenerative Biology Team were awarded the Aegean Conference Trainee Travel Award at the 3rd International Conference on Tissue Repair, Regeneration, and Fibrosis, held October 10 – 15, 2022, in Greece.

The 3rd International Conference on Tissue Repair, Regeneration, and Fibrosis is one of the most important scientific events bringing together scientists interested in various aspects of repairing and regenerating damaged tissues and organs. Understanding the molecular mechanisms underlying the repair and regeneration of the liver, lungs, skin, kidneys, and bone marrow, among others, is key to the progress of modern medicine.

The winners of this year’s conference were Dr. Marta Kopcewicz and Dr. Joanna Wiśniewska from the Regenerative Biology Team led by Prof. Barbara Gawrońska-Kozak, MD. The Organizing Committee awarded the Trainee Travel Award ($1,000) to the oral presentations of our female scientists’ research results:

Sex, individual age and transcription factor Foxn1 affect the condition of healthy and post injured mice and human skin

Marta Kopcewicz, Sylwia Machcińska-Zielińska, Katarzyna Walendzik, Joanna Wiśniewska, Joanna Rutkowska, Piotr Malinowski, Tomasz Waśniewski, Justyna Drukała, and Barbara Gawrońska-Kozak

Pig adipose-derived stem cells (pASCs) pre-conditioned with hypoxia. Characterization and validation for wound healing therapy

Joanna Wiśniewska, Magda Słyszewska, Marta Kopcewicz, Katarzyna Walendzik, Sylwia Machcińska-Zielińska, Patrycja Dudek, Karolina Stałanowska, and Barbara Gawrońska-Kozak

The research presented at the conference was carried out as part of the following:

    1. research projects funded by the National Science Center:
      • Opus 14 no. 2017/27/b/nz5/02610,
      • Sonata 13 nr 2017/26/D/NZ5/00556;
    2. the KNOW grant of the Scientific Consortium „Healthy Animal – Safe Food,”
      Dec. No.: 05-1/KNOW2/2015;
    3. own research fund 14/FBW/22.

 

Czytaj więcej