Niegenetyczne dziedziczenie u pstrąga tęczowego – badania stypendystki programu PASIFIC

We wnętrzu ikry znajdują się zakodowane informacje, które matka chce przekazać swojemu potomstwu, a które mogą dotyczyć np. przebytych przez nią chorób. Mechanizm ten – nazywany niegenetycznym dziedziczeniem – jest naukowcom znany, ale jeszcze nie do końca poznany. Zgłębia go dr Taina Rocha de Almeida z Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie.

Dr Taina Rocha de Almeida jest stypendystką programu PASIFIC – programu Marie Skłodowska-Curie COFUND. Jest to konkurs stypendialny zarządzany przez Polską Akademię Nauk i współfinansowany ze środków Programu H2020 „Marie Skłodowska-Curie Actions Co-funding of regional, national and international programmes” oraz Ministerstwa Edukacji i Nauki.

Jej prace badawcze skupiają się wokół określenia, w jakim stopniu czynniki niegenetycznego dziedziczenia wpływają na zdolność adaptacyjną potomstwa (od embrionu do stadiów młodocianych) do warunków hodowlanych. Opiekunem naukowym badaczki jest dr hab. Daniel Żarski z Zespołu Biologii Gamet i Zarodka IRZiBŻ PAN.

– Wiedza ta może przydać się do poprawy hodowli ryb, ale także głębszego poznania rybiej odporności – podkreśla dr Taina Rocha de Almeida.

Celem jej obecnie trwających badań jest sprawdzenie, w jaki sposób transkryptom ikry jest powiązany z wydajnością potomstwa – poprzez zbadanie zarodków i młodych osobników dwóch odmian pstrąga tęczowego, hodowanych w Polsce.

Pstrąg tęczowy to jeden z najbardziej popularnych gatunków hodowlanych na świecie; drugi pod względem produkcji w Europie. Jak wskazuje dr Taina Rocha de Almeida, mimo rozwoju wiedzy produkcja wciąż nie jest tak wydajna jaka mogłaby być. – Kwestii utrudniających wzrost produkcji pstrąga tęczowego jest wiele, natomiast w tych badaniach skupiłam się na dwóch: wydajności potomstwa i odporności na chorobę jersinioza (ang. Enteric Redmouth), wywołanej bakterią Yersinia ruckeri, która jest jedną z najgroźniejszych chorób ryb łososiowatych, dotykającą głównie pstrąga tęczowego – tłumaczy.

Transkryptom to zestaw cząsteczek RNA w komórkach, który zmienia się w zależności od różnych czynników np. choroby. Aby zbadać transkryptom ikry (czyli informacje tam zakodowane – w tym przypadku na temat choroby jersinioza na podstawie mRNA) i jego powiązanie z wydajnością potomstwa, naukowczyni przeprowadziła cały proces – od inkubacji, poprzez okres wylęgu i wzrost ryb. Następnie podzielono ryby na dwie grupy – jedna była grupą kontrolną, a drugą zainfekowano wspomnianą bakterią Yersinia ruckeri.

Wywołana przez nią choroba powoduje zmiany w takich organach jak m.in. wątroba, śledziona i skrzela. Od zainfekowanych ryb naukowcy pobrali więc próbki tych organów, aby zbadać ekspresję znajdujących się tam genów odpowiedzialnych za odpowiedź immunologiczną.

W badaniach molekularnych ikry naukowczyni wytypowała 10 genów, które odgrywają kluczową rolę w odpowiedzi immunologicznej układu odpornościowego. Teraz porówna je z genami z pobranych tkanek. Dr Taina Rocha de Almeida w planach ma również analizę cząsteczek mikroRNA, proteomu (czyli zestawu białek występujących w komórce w danym momencie) oraz zbadanie trzeciej odmiany pstrąga tęczowego, która również już została poddana całemu procesowi badawczemu.

Wyniki pokażą, w jakim stopniu informacja w ikrze wpływa na wydajność potomstwa, w przypadku zachorowania na popularną wśród pstrąga tęczowego chorobę. Nowa wiedza nie tylko przyczyni się do rozwoju nauki w temacie rozrodu pstrąga tęczowego, ale też w przyszłości może znaleźć realne zastosowanie w hodowli.

Badania były prowadzone we współpracy z Wylęgarnią Ryb Dąbie oraz Wydziałem Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego w Olsztynie.

Wyniki dotychczasowych badań stypendystki zostały przedstawione w trakcie Seminarium Liderów, które odbyło się 2 lutego br.

Więcej o jej badaniach pisaliśmy tutaj. Więcej o programie PASIFIC na stronie PAN.

Czytaj więcej

Prebiotykiem w łuszczycę

Mikrobiota jelitowa odgrywa fundamentalną rolę w kształtowaniu naszego zdrowia. Gdy jej struktura i funkcjonowanie zostaną zaburzone, mogą pojawić się kłopoty zdrowotne. W przywróceniu jej równowagi pomocne są prebiotyki i probiotyki. Naukowcy Instytutu sprawdzają, jak suplementacja prebiotykiem pochodzącym z cykorii wpływa na poprawę zdrowia pacjentów z łuszczycą.

Czytaj więcej

Biological clock genes, insulin and obesity – what do they have in common?

The biological clock helps regulate the timing of various processes in the body. Diurnal variation is shown, among others, by genes regulating insulin sensitivity. Researchers at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn have shown that the expression of biological clock genes in subcutaneous adipose tissue is linked to insulin action, and is lower in obese people than in those of normal body weight.

Two genes in particular are involved in insulin action: NR1D2 and DBP. – The higher the expression of these genes in adipose tissue, the higher the body’s sensitivity to insulin. And the higher the body’s sensitivity to insulin, the better the regulation of blood glucose levels – explains Professor Marek Strączkowski, head of the Department of Prophylaxis of Metabolic Diseases at the Institute of Animal Reproduction and Food Research (IAR&FR) of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn.

The findings of the team led by him were published in the journal Nutrition.

INSULIN AND CIRCADIAN RHYTHM

Insulin is a hormone that increases the transport of glucose into cells, which in turn lowers blood glucose levels. Insulin resistance is a reduced sensitivity of tissues to the action of insulin.

– Insulin resistance in itself is not a disease, but it is a condition that can lead to the development of many diseases: first and foremost type 2 diabetes, but also cardiovascular disease, certain cancers or neurodegenerative diseases – recalls the scientist who is researching the pathogenesis of insulin resistance in people at risk of type 2 diabetes.

The biological clock, on the other hand, is a circadian complex of biochemical processes occurring in the body. The circadian rhythm is controlled centrally and by peripheral clocks in tissues such as subcutaneous adipose tissue. It is an oscillator that stimulates the expression of successive genes encoding proteins responsible for specific biological processes, depending on the time of day or night. Also among the genes regulating insulin sensitivity are those showing diurnal variation, so that the insulin sensitivity of adipose tissue is highest around midday and lowest around midnight.

IMPROVED RESULTS FOLLOWING WEIGHT REDUCTION

Researchers from the IAR&FR PAS decided to combine these issues. To do so, they analysed the expression of subcutaneous adipose tissue clock genes in relation to obesity and insulin sensitivity.

The study group consisted of 38 overweight or obese people. They were examined before and after a 12-week programme of weight reduction through diet. The control group consisted of 16 normal-weight subjects examined only at baseline. Tissue insulin sensitivity was tested using the so-called metabolic clamp method, which is nowadays considered the best method for assessing insulin action in the body.

– Initially, obese subjects had lower expression of biological clock genes in subcutaneous adipose tissue than controls. After weight reduction in the subjects, this expression increased – the researcher reports.

Two genes related to insulin sensitivity in particular are involved: NR1D2 and DBP.

– We have shown that the aforementioned subcutaneous adipose tissue clock genes can be a starting point for further studies to better understand the pathogenesis of insulin resistance. We will explore the problem in further studies, already in cell cultures. This is a developmental topic – concludes Professor Marek Strączkowski.

On the topic of insulin resistance, a previous publication by researchers from the Department of Prophylaxis of Metabolic Diseases at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences, we wrote here.

Czytaj więcej

Geny zegara biologicznego, insulina i otyłość – co mają wspólnego?

Zegar biologiczny pomaga regulować czas różnych procesów zachodzących w organizmie. Zmienność dobową wykazują m.in. geny regulujące wrażliwość na insulinę. Naukowcy z Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie wykazali, że ekspresja genów zegara biologicznego w podskórnej tkance tłuszczowej jest związana z działaniem insuliny, a u osób otyłych jest niższa niż u tych z prawidłową masą ciała.

Chodzi szczególnie o dwa geny związane z działaniem insuliny: NR1D2oraz DBP. – Im wyższa ekspresja tych genów w tkance tłuszczowej, tym wyższa wrażliwość organizmu na insulinę. A im wyższa wrażliwość organizmu na insulinę, tym lepsza regulacja poziomu glukozy we krwi – tłumaczy prof. Marek Strączkowski, kierownik Zespołu Profilaktyki Chorób Metabolicznych Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności (IRZiBŻ) PAN w Olsztynie.

Wyniki badań zespołu pod jego kierunkiem opublikowano w czasopiśmie „Nutrition”.

INSULINA A RYTM DOBOWY

Insulina to hormon zwiększający transport glukozy do wnętrza komórek, co z kolei obniża poziom glukozy we krwi. Insulinooporność jest obniżoną wrażliwością tkanek na działanie insuliny.

– Insulinooporność sama w sobie nie jest chorobą, natomiast jest to stan, który może doprowadzić do rozwoju wielu chorób: przede wszystkim cukrzycy typu 2, ale też chorób układu krążenia, niektórych nowotworów czy chorób neurodegeneracyjnych – przypomina naukowiec, który zajmuje się badaniami nad patogenezą insulinooporności u osób z grup ryzyka cukrzycy typu 2.

Z kolei zegar biologiczny to okołodobowy zespół procesów biochemicznych zachodzących w organizmie. Rytm okołodobowy jest kontrolowany centralnie oraz przez zegary obwodowe w tkankach m.in. w podskórnej tkance tłuszczowej. Jest to oscylator, który pobudza ekspresję kolejnych genów kodujących białka odpowiedzialne za określone procesy biologiczne, w zależności od pory dnia czy nocy. Również wśród genów regulujących wrażliwość na insulinę znajdują się te wykazujące zmienność dobową, dzięki czemu wrażliwość tkanki tłuszczowej na insulinę jest największa koło południa, a najmniejsza koło północy.

LEPSZE WYNIKI PO REDUKCJI MASY CIAŁA

Badacze z IRZiBŻ PAN postanowili połączyć te zagadnienia. W tym celu przeanalizowali ekspresję genów zegarowych podskórnej tkanki tłuszczowej w odniesieniu do otyłości i wrażliwości na insulinę.

Grupę badaną stanowiło 38 osób z nadwagą lub otyłością. Zbadano ich przed 12-tygodniowym programem redukcji masy ciała poprzez dietę oraz po nim. Grupę kontrolną stanowiło 16 osób z prawidłową masą ciała, zbadanych tylko w warunkach wyjściowych.

Badanie wrażliwości tkanek na insulinę odbyło się metodą tzw. klamry metabolicznej, która współcześnie jest uznawana za najlepszą metodę oceny działania insuliny w organizmie.

– Początkowo osoby otyłe miały niższą ekspresję genów zegara biologicznego w podskórnej tkance tłuszczowej niż osoby z grupy kontrolnej. Po redukcji masy ciała u badanych ta ekspresja wzrosła – podaje badacz.

Chodzi szczególnie o dwa geny związane z działaniem insuliny: NR1D2oraz DBP.

– Wykazaliśmy, że wspomniane geny zegarowe podskórnej tkanki tłuszczowej mogą być punktem wyjścia do kolejnych badań nad lepszym poznaniem patogenezy insulinooporności. Będziemy zgłębiać problem w dalszych badaniach, już w hodowlach komórkowych. Jest to temat rozwojowy – podsumowuje prof. Marek Strączkowski.  

O wcześniejszej publikacji w temacie insulinooporności, autorstwa naukowców z Zespołu Profilaktyki Chorób Metabolicznych IRZiBŻ PAN, pisaliśmy tutaj.

Czytaj więcej

Konkurs na stanowisko stypendysty w projekcie NCN OPUS 21

Nazwa jednostki:

Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie

Nazwa stanowiska:

Stypendystka/Stypendysta

Wymagania:

  1. Status studenta studiów drugiego stopnia lub czwartego-piątego roku jednolitych studiów magisterskich lub status studenta studiów doktoranckich. Preferowane kierunki: dietetyka, technologia żywności, biologia, chemia lub pokrewne.
  2. Znajomość obsługi podstawowych urządzeń laboratoryjnych (pipeta automatyczna, vortex, wirówka).
  3. Chęć zdobycia dodatkowej wiedzy nt. wpływu żywności na organizm oraz umiejętności laboratoryjnych.

Mile widziane:

  • Znajomość technik chromatograficznych.
  • Dorobek naukowy, w tym publikacje w renomowanych wydawnictwach /czasopismach naukowych.
  • Osiągnięcia wynikające z prowadzenia badań naukowych, stypendia, nagrody oraz doświadczenie naukowe zdobyte w kraju lub za granicą, warsztaty i szkolenia naukowe, udział w projektach badawczych.

Zgłoszenia oceniane będą zgodnie z kryteriami podanymi w Regulaminie przyznawania stypendiów naukowych w projektach badawczych finansowanych ze środków NCN.

Rezultaty konkursu zostaną ogłoszone na stronie Instytutu do dnia 20 lutego 2024 roku.

Opis zadań:

Stypendystka/stypendysta wyłoniona/y w ramach niniejszego konkursu będzie uczestniczyła/uczestniczył w zadaniach badawczych realizowanych w ramach projektu OPUS NCN pt. „KETO-MINOX: Wpływ izokalorycznej, redukcyjnej diety ketogenicznej na metabolizm, stan zapalny, wybrane parametry odżywienia i stres  oksydacyjny kobiet z nadwagą i otyłością” kierowanego przez dr Natalię Drabińską.

Zadaniem Stypendystów będzie analiza aminokwasów w surowicy oraz moczu zebranym w ramach badania klinicznego KETO-MINOX z zastosowaniem technik derywatyzacji oraz chromatografii gazowej sprzężonej ze spektrometrią mas.

Możliwość wykonania zadań w ramach pracy magisterskiej.

Typ konkursu NCN:

OPUS 21 – NZ

Termin składania ofert:

11 luty 2024 roku, 23:59

Forma składania ofert:

Dokumenty aplikacyjne należy przesyłać na adres email: n.drabinska@pan.olsztyn.pl w tytule proszę wpisać „Rekrutacja stypendysty –  OPUS21”.

Wszystkie wymagane dokumenty/załączniki należy przesłać w formie plików PDF.

Warunki stypendium:

Liczba stypendiów: 2

Przewidywany okres finansowania: 12 miesięcy

Wysokość stypendium naukowego: 1000 zł miesięcznie

Miejsce realizacji:

Pracownia Badania Związków Lotnych i Aktywnych Sensorycznie
Katedra Technologii Żywności Pochodzenia Roślinnego
Wydział Nauk o Żywności i Żywieniu
Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu
ul. Wojska Polskiego 31, 60-624 Poznań

Data rozpoczęcia: 1 marca 2024 roku.

Wykaz dokumentów:

  1. Dyplom ukończenia studiów pierwszego stopnia (lic/inż.) na kierunku dietetyka, biologia lub nauki pokrewne oraz poświadczony aktualny status studenta szkoły wyższej studiów drugiego stopnia na kierunkach wymienionych powyżej lub poświadczony aktualny status studenta szkoły wyższej jednolitych studiów magisterskich na kierunkach wymienionych powyżej (mile widziana informacja o wysokości średniej ocen z ostatnich dwóch lat akademickich) lub poświadczony aktualny status studenta szkoły doktorskiej.
  2. List motywacyjny.
  3. CV kandydata z przebiegiem kariery naukowej, wykazem dorobku naukowego (lista publikacji naukowych i popularno-naukowe, doniesień konferencyjnych, rozdziałów w książkach i monografiach, etc.), osiągnięć naukowych (nagrody i wyróżnienia, staże i stypendia, doświadczenie naukowe zdobyte w kraju lub za granicą, ect.) potwierdzonych w postaci np. skanu oraz wykazem kompetencji do realizacji zadań w projekcie (m.in. potwierdzenie znajomości języka angielskiego w stopniu umożliwiającym pisanie manuskryptów naukowych, dobra obsługa MS Office, warsztaty, kursy i szkolenia naukowe, udział w projektach badawczych, ect.)
  4. Przynajmniej jedna rekomendacja lub referencja wraz z danymi kontaktowymi osób, które ich udzieliły

Do CV należy dołączyć podpisaną klauzulę RODO – informację o przetwarzaniu danych osobowych (pobierz).

Czytaj więcej

2024 CALL FOR PHD STUDENTS IN „RESEARCH ON EPIGENETIC MEMORY MECHANISMS BASED ON THE EXAMPLE OF THE RESPONSE OF HUMAN IMMUNE CELLS TO VITAMIN D”

Name of the scientific unit:

Institute of Animal Reproduction and Food Research of Polish Academy of Sciences in Olsztyn (IAR&FR PAS), Poland

Position:

Ph.D. Student

Position description:

The scholarship holder selected under this competition will participate in research tasks carried out as part of the OPUS NCN project entitled „Research on epigenetic memory mechanisms based on the example of the response of human immune cells to vitamin D” led by prof. Carsten Carlberg. The most relevant duties could be described as:

  • Isolation of human immune cells from blood donors for direct use and cell culture
  • Library preparation of RNA and chromatin samples using methods like RNA-seq, ATAC-seq and ChIPmentation,
  • Analysis and integration of next-generation sequencing data obtained from these assay,

Requirements:

  • Master Degree (MSc) in Biosciences (Biology/ Biochemistry/ Biotechnology);
  • Experience in molecular biology;
  • Experience with analysis of high-throughput ‘omics data;
  • Scientific achievements, including publications in renowned scientific journals;
  • Achievements resulting from:
    • conducting scientific research,
    • scholarships,
    • awards,workshops and scientific training,
    • participation in research projects.
  • Precise pipetting;
  • Proficiency in carrying out methods like:
    • PCR,
    • RNA isolation,
    • cell culture.

Additional skills:

  • High motivation to work in a multidisciplinary team;
  • Excellent communication skills for effective interaction with the multidisciplinary cohort of researchers;
  • Proactive, motivated, showing initiative;
  • Good work organization;
  • Fluency in English in writing and speaking;
  • Good writing and presentation skills;

Recruitment process:

  • Applications will be assessed in accordance with the criteria set out in the regulations for awarding research scholarships in research projects financed by the National Science;
  • Only on-line applications will be considered;
  • Selected candidates will be invited to an on-line interview;
  • Candidates evaluated with the highest score will be invited to an actual interview, which will take place face-to-face or online
  • During the interview, the candidate will be asked to deliver a 10-minute speech. presenting his/her Master thesis and research interests
  • Final results of the recruitment will be published on IAR&FR PAS webpage within 10 days after final decision.
  • Candidates selected in the course of recruitment will be asked to apply to the Interdisciplinary Doctoral School at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn – admission to the doctoral school is a prerequisite for receiving a scholarship.
  • Admissions to the doctoral school will be announced on the doctoral school website.
  • Note: Candidates are entitled to a right of complaint within 14 days from the final results announcement. Complaints (with justification) should be addressed to the Institute’s HR Manager. HR Manager is obliged to respond the complaint within 14 working days. 

Important information:

  • Application deadline: 11 Feb 2024, 23:59 (Eastern European Time);
  • Applications should be sent to: c.carlberg@pan.olsztyn.pl;
  • Location: Olsztyn, Poland;
  • Duration of the scholarship: 48 months;
  • Scholarship amount: 5,000 PLN per month;
  • Date of position opening: 26 Feb 2024;
  • Number of positions: 2.

Application documents:

  • Cover letter describing how they fit the position and their scientific interests and philosophy;
  • CV – degrees and other completed courses, work experience and a list of degree projects/theses;
  • Degree certificates and grades confirming that you meet the general and specific entry requirements;
  • Contact information of 3 referees.
  • Please read the list of required documents;
  • Please include application form;
  • Please include consent to the processing of personal data;

Czytaj więcej

2024 CALL FOR PHD STUDENTS IN „RESEARCH ON EPIGENETIC MEMORY MECHANISMS BASED ON THE EXAMPLE OF THE RESPONSE OF HUMAN IMMUNE CELLS TO VITAMIN D”

Name of the scientific unit:

Institute of Animal Reproduction and Food Research of Polish Academy of Sciences in Olsztyn (IAR&FR PAS), Poland

Position:

Ph.D. Student

Position description:

The scholarship holder selected under this competition will participate in research tasks carried out as part of the OPUS NCN project entitled „Research on epigenetic memory mechanisms based on the example of the response of human immune cells to vitamin D” led by prof. Carsten Carlberg. The most relevant duties could be described as:

  • Isolation of human immune cells from blood donors for direct use and cell culture
  • Library preparation of RNA and chromatin samples using methods like RNA-seq, ATAC-seq and ChIPmentation,
  • Analysis and integration of next-generation sequencing data obtained from these assay,

Requirements:

  • Master Degree (MSc) in Biosciences (Biology/ Biochemistry/ Biotechnology);
  • Experience in molecular biology;
  • Experience with analysis of high-throughput ‘omics data;
  • Scientific achievements, including publications in renowned scientific journals;
  • Achievements resulting from:
    • conducting scientific research,
    • scholarships,
    • awards,workshops and scientific training,
    • participation in research projects.
  • Precise pipetting;
  • Proficiency in carrying out methods like:
    • PCR,
    • RNA isolation,
    • cell culture.

Additional skills:

  • High motivation to work in a multidisciplinary team;
  • Excellent communication skills for effective interaction with the multidisciplinary cohort of researchers;
  • Proactive, motivated, showing initiative;
  • Good work organization;
  • Fluency in English in writing and speaking;
  • Good writing and presentation skills;

Recruitment process:

  • Applications will be assessed in accordance with the criteria set out in the regulations for awarding research scholarships in research projects financed by the National Science;
  • Only on-line applications will be considered;
  • Selected candidates will be invited to an on-line interview;
  • Candidates evaluated with the highest score will be invited to an actual interview, which will take place face-to-face or online
  • During the interview, the candidate will be asked to deliver a 10-minute speech. presenting his/her Master thesis and research interests
  • Final results of the recruitment will be published on IAR&FR PAS webpage within 10 days after final decision.
  • Candidates selected in the course of recruitment will be asked to apply to the Interdisciplinary Doctoral School at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn – admission to the doctoral school is a prerequisite for receiving a scholarship.
  • Admissions to the doctoral school will be announced on the doctoral school website.
  • Note: Candidates are entitled to a right of complaint within 14 days from the final results announcement. Complaints (with justification) should be addressed to the Institute’s HR Manager. HR Manager is obliged to respond the complaint within 14 working days. 

Important information:

  • Application deadline: 11 Feb 2024, 23:59 (Eastern European Time);
  • Applications should be sent to: c.carlberg@pan.olsztyn.pl;
  • Location: Olsztyn, Poland;
  • Duration of the scholarship: 48 months;
  • Scholarship amount: 5,000 PLN per month;
  • Date of position opening: 26 Feb 2024;
  • Number of positions: 2.

Application documents:

  • Cover letter describing how they fit the position and their scientific interests and philosophy;
  • CV – degrees and other completed courses, work experience and a list of degree projects/theses;
  • Degree certificates and grades confirming that you meet the general and specific entry requirements;
  • Contact information of 3 referees.
  • Please read the list of required documents;
  • Please include application form;
  • Please include consent to the processing of personal data;

Czytaj więcej

Yet unexplored protein – a new player of innate immunity in turkey semen

One in ten turkeys may be affected by yellow semen syndrome that causes reduced fertilising ability. The molecular mechanisms of how this condition arises are not yet understood. The key might be a certain protein. Researchers at the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn are investigating it as part of a project funded by the National Science Centre.

The protein in question is a soluble cysteine-rich scavenger receptor protein found in the semen of turkey.
– In mammals, this protein is a very interesting player in the immune system, among other things, it plays an important role in the recognition of microorganisms. Our hypothesis is that the scavenger receptor present in turkey semen is involved in the protection of semen against bacteria – emphasises the project leader Dr. Mariola Słowińska from the Department of Gamete and Embryo Biology of the IAR&FR PAS.

The researchers are also investigating whether this protein could be linked to the mechanism of yellow semen syndrome. – If the results are positive, knowledge of this could be used by breeders in the future to increase the efficiency of chick production by increasing the fertilisation efficiency of turkeys – the researcher adds.

LEARNING ABOUT A NEW PLAYER…

Little is known about the occurrence and role of the protein in focus (soluble cysteine-rich scavenger receptor) in birds.

– A few years ago, our research group was the first in the world to identify this protein in turkey semen. So far, all we know is that it is very similar to proteins of the scavenger receptor family found in mammals, which have the ability to bind to microorganisms and remove microorganisms or their own cells that have been damaged. They are found on the surface of cells of the immune system, e.g. on the surface of macrophages, which, after recognising bacteria or other microorganisms, absorb them (the process of phagocytosis) – explains the scientist, who studies bird reproduction, particularly in turkeys.

Based on this knowledge, scientists want to now study the aforementioned functions in birds. – First of all, we want to know the structure and biological functions of this protein. We have already succeeded in isolating the protein, i.e. obtaining its pure form. We will use this to analyse the physico-chemical properties and modifications of the protein. On this basis, we will create the first structural model of this protein for birds – explains Mariola Słowińska.

The next step will be to produce specific antibodies against the protein, which will allow the researchers, among other things, to localise the protein under study on cells of the immune system, sperm and in organs of the reproductive system. The researchers will examine whether the protein can be a potential marker, i.e. a factor confirming the presence of a particular disease, in this case, yellow semen syndrome. They also plan to learn more about the microbiome of turkey semen to see if the substrate for the development of yellow semen syndrome is a bacterial condition.

As the researcher points out, the project focuses, therefore, not only on learning more about the protein itself, but also provides a broader view on the reproductive and immune systems in birds.

… IN ORDER TO RAPIDLY DIAGNOSE THE DISEASE

Yellow semen syndrome in turkeys leads to disorders in the fertilising capacity of the semen. – Yellow semen contains more abnormal and immature spermatozoa and, in addition, their motility is impaired. On top of this, there is an increased activity of antioxidant enzymes, which indicates imbalance in the oxidative stress (the process in which free radicals attack body cells and cause damage to them) – explains Mariola Słowińska.

The only symptom of yellow semen syndrome in turkeys that is visible at a first glance is the slightly yellowish colour of the semen. However, as the scientist explains, in poultry production semen is collected from many males simultaneously, mixed, and only then is the artificial insemination (an assisted reproduction technique) carried out. – If there is some yellow semen in this pool, the sample will have a reduced fertilisation efficiency – clarifies Mariola Słowińska.

According to the scientific literature, approximately 10 percent of turkeys are affected by yellow semen syndrome.

– With our basic research, we want to deepen our knowledge of the immunology of bird semen, especially in the context of understanding the structure of the soluble cysteine-rich scavenger receptor and its role in the mechanism of yellow semen syndrome. We would also like to detect potential markers of this condition, which would allow rapid diagnosis of sick birds – concludes Mariola Słowińska.

The project entitled “Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein – SSc5D, a new player of innate immunity in turkey (Meleagris gallopavo) semen involved in yellow semen syndrome” is financed by the National Science Centre (NCN). The research is being conducted within a consortium formed by the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn and the University of Agriculture in Kraków.

The research team includes: the staff of the Institute of Animal Reproduction and Food Research of the Polish Academy of Sciences in Olsztyn: Dr. Mariola Słowińska (Principal Investigator), Dr. Ewa Drzewiecka, Ewa Liszewska, MSc, Dr. Anna Szóstek-Mioduchowska, Halina Karol, Eng., Prof. Andrzej Ciereszko, and the staff of the University of Agriculture in Kraków: Dr. Laura Pardyak (coordinator on behalf of the URK), Dr. Zbigniew Arent, Dr. Artur Gurgul, Dr. Ewa Ocłoń, Dr. Tomasz Szmatoła, Dr. Igor Jasielczuk.

Czytaj więcej

Niezbadane dotąd białko – nowym graczem w odporności nasienia indyka

Co dziesiąty indyk może być obciążony syndromem żółtego nasienia, który powoduje obniżoną zdolność zapładniającą. Molekularne mechanizmy powstania tego schorzenia nie są jeszcze poznane. Kluczem może być pewne białko. Jego poznaniem zajmują się naukowcy z Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie, w ramach projektu z Narodowego Centrum Nauki.

Chodzi o białko o nazwie: rozpuszczalny receptor zmiatacz bogaty w cysteinę, występujące w nasieniu indora.
– U ssaków białko to jest bardzo ciekawym graczem w układzie immunologicznym m.in. pełni ważną rolę przy rozpoznawaniu drobnoustrojów. Nasza hipoteza zakłada, że obecny w nasieniu indora receptor zmiatacz jest zaangażowany w ochronę nasienia przed bakteriami – podkreśla kierownik projektu dr hab. inż. Mariola Słowińska z Zespołu Biologii Gamet i Zarodka IRZiBŻ PAN w Olsztynie.

Naukowcy sprawdzają też, czy to białko może być powiązane z mechanizmem powstania syndromu żółtego nasienia. – Jeśli wyniki będą pozytywne, wiedza na ten temat będzie mogła w przyszłości być wykorzystywana przez hodowców do podniesienia wydajności produkcji piskląt poprzez zwiększenie skuteczności zapładniania indyków – dodaje badaczka.

POZNAĆ NOWEGO GRACZA…

Na temat występowania i roli badanego białka (rozpuszczalnego receptora zmiatacza bogatego w cysteinę) u ptaków – niewiele wiadomo.

– Przed kilku laty nasza grupa badawcza, jako pierwsza w świecie, zidentyfikowała to białko w nasieniu indora. Na razie wiemy tylko, że jest ono bardzo podobne do białek rodziny receptorów zmiataczy występujących u ssaków, mających zdolność wiązania się z drobnoustrojami oraz do usuwania drobnoustrojów lub własnych komórek, które zostały uszkodzone. Występują na powierzchni komórek układu immunologicznego np. na powierzchni makrofagów, które po rozpoznaniu bakterii czy innych drobnoustrojów pochłaniają je (proces fagocytozy). – tłumaczy naukowczyni, zajmująca się badaniami nad rozrodem ptaków, szczególnie indorów.

Bazując na tej wiedzy, naukowcy chcą teraz zbadać wspomniane funkcje u ptaków. – Przede wszystkim chcemy poznać strukturę i funkcje biologiczne tego białka. Udało nam się już wyizolować białko, czyli uzyskać jego czystą postać. Użyjemy je do analiz właściwości fizykochemicznych i modyfikacji białka. Na tej podstawie stworzymy pierwszy model strukturalny tego białka dla ptaków – wyjaśnia Mariola Słowińska.

Kolejnym krokiem będzie wytworzenie specyficznych przeciwciał przeciw temu białku, które pozwolą badaczom m.in. zlokalizować badane białko na komórkach układu odpornościowego, plemnikach oraz w narządach układu rozrodczego. Badacze sprawdzą, czy białko może być potencjalnym markerem, czyli czynnikiem potwierdzającym występowanie danej choroby, w tym przypadku – syndromu żółtego nasienia. W planach jest także poznanie mikrobiomu nasienia indorów, aby sprawdzić, czy podłożem do rozwoju syndromu żółtego nasienia jest stan bakteryjny.

Jak podkreśla badaczka, projekt skupia się więc nie tylko na poznaniu samego białka, ale i pozwala szerzej spojrzeć na układ rozrodczy i immunologiczny u ptaków.

…, ABY SZYBKO ROZPOZNAĆ CHOROBĘ

Syndrom żółtego nasienia indorów prowadzi do zaburzeń w zdolności zapładniającej nasienia. – Żółte nasienie zawiera więcej nieprawidłowych i niedojrzałych plemników, a dodatkowo ich ruchliwość jest zaburzona. Do tego dochodzi zwiększona aktywność enzymów antyoksydacyjnych, co wskazuje na zaburzenie równowagi stresu oksydacyjnego (procesu, w którym wolne rodniki atakując komórki organizmu powodują ich uszkodzenie) – tłumaczy Mariola Słowińska.

Jedynym widocznym na pierwszy rzut oka objawem wystąpienia syndromu żółtego nasienia u indyków jest lekko żółtawe zabarwienie nasienia. Jak jednak tłumaczy naukowczyni, w produkcji drobiarskiej nasienie pobierane jest od wielu samców równocześnie, miesza się je i dopiero wtedy prowadzi się sztuczną inseminację, czyli technikę wspomaganego rozrodu. – Jeśli w tej puli znajdzie się żółte nasienie, próba będzie się miała obniżoną skuteczność zapładniającą – wyjaśnia Mariola Słowińska.

Według literatury naukowej, syndromem żółtego nasienia obciążonych jest około 10 proc. indorów.

– Naszymi badaniami podstawowymi chcemy pogłębić wiedzę na temat immunologii nasienia ptaków, szczególnie w kontekście poznania struktury rozpuszczalnego receptora zmiatacza bogatego w cysteinę i jego roli w mechanizmie powstawania syndromu żółtego nasienia. Chcielibyśmy również wykryć potencjalne markery tego schorzenia, co pozwoliłoby na szybką diagnostykę chorych ptaków – podsumowuje Mariola Słowińska.

Projekt pt. „SSc5D – rozpuszczalny receptor zmiatacz bogaty w cysteinę, nowy gracz w odporności nieswoistej nasienia indora (Meleagris galopavo) w odniesieniu do syndromu żółtego nasienia” jest finansowany ze środków Narodowego Centrum Nauki (NCN). Badania są prowadzone w ramach konsorcjum, które tworzą: Instytut Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie oraz Uniwersytet Rolniczy w Krakowie.

Zespół badawczy tworzą: pracownicy Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań Żywności PAN w Olsztynie: dr hab. Mariola Słowińska (kierownik projektu), dr Ewa Drzewiecka, mgr Ewa Liszewska, dr hab. Anna Szóstek-Mioduchowska, inż. Halina Karol,  prof. dr hab. Andrzej Ciereszko oraz pracownicy Uniwersytetu Rolniczego w Krakowie: dr Laura Pardyak (koordynator ze strony URK), dr hab. wet. Zbigniew Arent, prof. URK, dr hab. inż Artur Gurgul, prof. URK, dr Ewa Ocłoń, dr inż. Tomasz Szmatoła, dr Igor Jasielczuk.

Czytaj więcej